13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1793 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1793  RNA polymerase dimerization  100 
 
 		 94 aa  188  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3577  RNA polymerase dimerization  85.71 
 
 		 94 aa  149  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.656265  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0627  RNA polymerase dimerisation  71.28 
 
 		 95 aa  131  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0620  RNA polymerase dimerisation  65.59 
 
 		 92 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00678824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1961  RNA polymerase dimerisation  69.51 
 
 		 94 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1637  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  37.23 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1439  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  39.36 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0004  RNA polymerase, dimerisation  38.3 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.627074  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1268  RNA polymerase dimerization  37.5 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2336  RNA polymerase, dimerisation  29.79 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.37963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1862  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  34.78 
 
 		 90 aa  45.4  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.794833 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1274  RNA polymerase dimerisation  31.34 
 
 		 95 aa  40.4  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.943087  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0190  RNA polymerase dimerisation  30.38 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.388053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>