17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_62535 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_62535  RNA polymerase II core subunit  100 
 
 		 122 aa  248  3e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185842  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04269  DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11a, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03860)  44.54 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00540677 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02280  DNA-directed RNA polymerase ii 13.3 kda polypeptide, putative  50 
 
 		 162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.17103  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35735  predicted protein  41.67 
 
 		 115 aa  94.7  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0691994  normal  0.967834 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47430  predicted protein  48.04 
 
 		 125 aa  87.8  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65363  RNA polymerase I and III subunit  34.95 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.285306  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06558  DNA-directed RNA polymerase I and III 14 KDA polypeptide (AFU_orthologue; AFUA_6G04610)  32.69 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.336636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1862  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  35.56 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.794833 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01370  DNA-directed RNA polymerase, putative  33.64 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.291062  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1637  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  38.27 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1268  RNA polymerase dimerization  38.98 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12779  predicted protein  33.33 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0776708  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30435  predicted protein  30.59 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1539  DNA-directed RNA polymerase subunit L  24.39 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.111893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1439  DNA-directed RNA polymerase, subunit L  38.81 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0364  Fis family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0190  RNA polymerase dimerisation  31.25 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.388053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>