More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2642 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2642  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 
391 aa  793    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3116  S-adenosylmethionine synthetase  82.43 
 
 
391 aa  661    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  67.69 
 
 
397 aa  543  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  66.92 
 
 
395 aa  537  1e-151  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  66.84 
 
 
393 aa  534  1e-151  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  66.32 
 
 
397 aa  531  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0287  S-adenosylmethionine synthetase  65.16 
 
 
408 aa  531  1e-149  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  67.35 
 
 
396 aa  528  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  66.07 
 
 
396 aa  526  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  64.95 
 
 
395 aa  521  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  64.1 
 
 
396 aa  522  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  65.31 
 
 
395 aa  520  1e-146  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  66.24 
 
 
403 aa  520  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  64.95 
 
 
395 aa  516  1.0000000000000001e-145  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  64.96 
 
 
403 aa  514  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0125  S-adenosylmethionine synthetase  63.68 
 
 
396 aa  508  1e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105717  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  62.72 
 
 
396 aa  505  9.999999999999999e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  63.01 
 
 
395 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  63.01 
 
 
395 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  65.03 
 
 
402 aa  503  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1756  S-adenosylmethionine synthetase  61.77 
 
 
395 aa  503  1e-141  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000785421  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2435  S-adenosylmethionine synthetase  64.03 
 
 
391 aa  503  1e-141  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2145  S-adenosylmethionine synthetase  64.03 
 
 
391 aa  503  1e-141  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  63.08 
 
 
396 aa  499  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  61.7 
 
 
398 aa  498  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  64.52 
 
 
396 aa  500  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  61.7 
 
 
398 aa  498  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  62.92 
 
 
399 aa  497  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  61.38 
 
 
396 aa  496  1e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1363  S-adenosylmethionine synthetase  61.64 
 
 
395 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176558  normal  0.04012 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0456  S-adenosylmethionine synthetase  63.17 
 
 
402 aa  492  9.999999999999999e-139  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000025014  normal  0.132712 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0660  S-adenosylmethionine synthetase  63.59 
 
 
402 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000409512  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  62.15 
 
 
399 aa  489  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  62.15 
 
 
399 aa  490  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  62.15 
 
 
399 aa  490  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  62.15 
 
 
399 aa  490  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  62.15 
 
 
399 aa  490  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  62.15 
 
 
399 aa  489  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  62.15 
 
 
399 aa  490  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  62.15 
 
 
399 aa  490  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  62.15 
 
 
399 aa  488  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  62.15 
 
 
399 aa  490  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5342  S-adenosylmethionine synthetase  61.68 
 
 
399 aa  491  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339579  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1352  S-adenosylmethionine synthetase  61.95 
 
 
399 aa  487  1e-136  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1383  methionine adenosyltransferase  59.7 
 
 
401 aa  486  1e-136  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1135  S-adenosylmethionine synthetase  60.93 
 
 
397 aa  486  1e-136  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0160  S-adenosylmethionine synthetase  60.77 
 
 
405 aa  484  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1296  S-adenosylmethionine synthetase  63.01 
 
 
395 aa  481  1e-135  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0081249  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2989  Methionine adenosyltransferase  62.56 
 
 
399 aa  481  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2348  S-adenosylmethionine synthetase  63.04 
 
 
403 aa  482  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3124  S-adenosylmethionine synthetase  61.73 
 
 
398 aa  484  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1725  S-adenosylmethionine synthetase  61.5 
 
 
402 aa  483  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.710096  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1186  S-adenosylmethionine synthetase  61.54 
 
 
414 aa  484  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1470  S-adenosylmethionine synthetase  65.21 
 
 
412 aa  484  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274097  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3565  S-adenosylmethionine synthetase  60.88 
 
 
403 aa  479  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814506  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0831  S-adenosylmethionine synthetase  59.44 
 
 
398 aa  479  1e-134  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3004  S-adenosylmethionine synthetase  61.03 
 
 
397 aa  478  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000578039  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2818  Methionine adenosyltransferase  61.6 
 
 
395 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27040  methionine adenosyltransferase  62.08 
 
 
399 aa  479  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593252  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0533  S-adenosylmethionine synthetase  61.28 
 
 
393 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000146797  normal  0.123305 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1290  S-adenosylmethionine synthetase  60 
 
 
417 aa  478  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.134908  normal  0.0680854 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1692  S-adenosylmethionine synthetase  61.34 
 
 
397 aa  479  1e-134  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.753186  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0489  S-adenosylmethionine synthetase  60.77 
 
 
405 aa  478  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1315  S-adenosylmethionine synthetase  59.64 
 
 
398 aa  476  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119396  normal  0.284127 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3094  S-adenosylmethionine synthetase  60.81 
 
 
397 aa  475  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0289909  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2575  S-adenosylmethionine synthetase  59.75 
 
 
407 aa  476  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.136519  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2353  S-adenosylmethionine synthetase  60.26 
 
 
405 aa  475  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  59.59 
 
 
383 aa  476  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15650  methionine adenosyltransferase  59.34 
 
 
400 aa  474  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148398  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2161  S-adenosylmethionine synthetase  59.64 
 
 
399 aa  473  1e-132  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4159  S-adenosylmethionine synthetase  60.2 
 
 
397 aa  472  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0297831  normal  0.258747 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2256  S-adenosylmethionine synthetase  59.59 
 
 
411 aa  472  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0616987  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0512  S-adenosylmethionine synthetase  59.64 
 
 
406 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.128804  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1864  S-adenosylmethionine synthetase  58.63 
 
 
399 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0488  S-adenosylmethionine synthetase  60.36 
 
 
406 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.227197  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3103  S-adenosylmethionine synthetase  60.41 
 
 
401 aa  470  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169073  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3192  S-adenosylmethionine synthetase  61.13 
 
 
398 aa  470  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000568371  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1857  S-adenosylmethionine synthetase  59.14 
 
 
399 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3549  S-adenosylmethionine synthetase  59.59 
 
 
403 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.642541  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1065  S-adenosylmethionine synthetase  59.74 
 
 
397 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_453  S-adenosylmethionine synthetase  59.38 
 
 
406 aa  467  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00689475  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  58.81 
 
 
384 aa  464  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1993  S-adenosylmethionine synthetase  59.28 
 
 
411 aa  465  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000306332 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  56.7 
 
 
381 aa  464  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1716  S-adenosylmethionine synthetase  60.41 
 
 
398 aa  468  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123594  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5235  S-adenosylmethionine synthetase  60.78 
 
 
400 aa  467  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  58.81 
 
 
384 aa  464  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  58.81 
 
 
384 aa  464  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  58.81 
 
 
384 aa  464  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  58.55 
 
 
383 aa  461  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11421  S-adenosylmethionine synthetase  59.5 
 
 
403 aa  461  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0291702  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  57.8 
 
 
388 aa  464  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  58.81 
 
 
384 aa  464  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12750  methionine adenosyltransferase  58.06 
 
 
405 aa  464  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0223394 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1718  S-adenosylmethionine synthetase  61.1 
 
 
400 aa  462  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388889  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  58.81 
 
 
384 aa  464  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  58.81 
 
 
384 aa  464  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  58.81 
 
 
384 aa  464  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18060  methionine adenosyltransferase  59.49 
 
 
397 aa  464  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0593613  normal  0.705478 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  58.55 
 
 
383 aa  464  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>