65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2981 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2981  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  620  1e-176  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2984  protein of unknown function DUF214  76.41 
 
 
323 aa  428  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2864  hypothetical protein  75 
 
 
326 aa  425  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3090  hypothetical protein  75 
 
 
326 aa  425  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.613654 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1153  hypothetical protein  72.79 
 
 
317 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2194  hypothetical protein  72.76 
 
 
316 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.265729  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0363  hypothetical protein  48.91 
 
 
343 aa  277  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.920625  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2517  protein of unknown function DUF214  54.83 
 
 
349 aa  268  7e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0668  hypothetical protein  46.98 
 
 
323 aa  260  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0577  hypothetical protein  45.64 
 
 
314 aa  259  6e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4866  hypothetical protein  47.99 
 
 
323 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5217  protein of unknown function DUF214  45.3 
 
 
328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339696  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1177  cell division ABC transporter (membrane component)  45.64 
 
 
319 aa  242  7.999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.54345 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0835  hypothetical protein  47.83 
 
 
327 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.618544  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0944  hypothetical protein  47.83 
 
 
326 aa  235  9e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1996  hypothetical protein  41.3 
 
 
333 aa  233  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1922  hypothetical protein  41.3 
 
 
333 aa  233  3e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0985  hypothetical protein  40.61 
 
 
347 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3090  hypothetical protein  43.73 
 
 
329 aa  229  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3866  cell division protein  41.16 
 
 
337 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546597  normal  0.0832044 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3573  cell division protein  39.68 
 
 
337 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4028  cell division protein  40.34 
 
 
316 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0021  hypothetical protein  44.92 
 
 
333 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.873886  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2544  hypothetical protein  39.78 
 
 
339 aa  202  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0099  FtsX family protein  33.68 
 
 
324 aa  196  3e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3255  hypothetical protein  38.44 
 
 
298 aa  143  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.97977  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1594  hypothetical protein  36.01 
 
 
327 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.473332 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3218  hypothetical protein  37.79 
 
 
297 aa  125  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368988  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0477  hypothetical protein  32.07 
 
 
300 aa  123  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2452  hypothetical protein  39.09 
 
 
300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2388  hypothetical protein  39.77 
 
 
300 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2016  hypothetical protein  40.34 
 
 
309 aa  104  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0734  cell division protein FtsX  39.77 
 
 
300 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3055  protein of unknown function DUF214  38.78 
 
 
297 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3499  hypothetical protein  38.34 
 
 
297 aa  102  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.770772 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0700  hypothetical protein  36.99 
 
 
311 aa  96.3  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3012  hypothetical protein  33.69 
 
 
303 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752793  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2375  hypothetical protein  37.12 
 
 
301 aa  86.7  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2891  hypothetical protein  30 
 
 
301 aa  68.9  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.650198  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3083  hypothetical protein  32.44 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00150828  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0223  cell division protein FtsX  30.84 
 
 
317 aa  63.5  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0710231 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0241  cell division protein FtsX  26.78 
 
 
317 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.159478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0579  cell division protein FtsX  26.78 
 
 
317 aa  62  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00250347  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3977  cell division protein FtsX  26.78 
 
 
317 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.199267  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4063  cell division protein FtsX  28.88 
 
 
321 aa  59.7  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3071  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 
345 aa  58.5  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0933054  normal  0.0269654 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0406  protein of unknown function DUF214  28.18 
 
 
296 aa  55.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00446449  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3607  cell division protein FtsX  24.21 
 
 
333 aa  52.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00806007  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0135  protein insertion permease FtsX, putative  28.05 
 
 
300 aa  51.6  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108648  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3672  protein of unknown function DUF214  34.46 
 
 
315 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1855  cell division protein FtsX  27.4 
 
 
316 aa  49.7  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.393875  normal  0.417325 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0356  hypothetical protein  27.33 
 
 
341 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1553  cell division protein FtsX  25.17 
 
 
312 aa  48.1  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.119843  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0058  cell division protein FtsX  21.8 
 
 
316 aa  47.8  0.0002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.105068  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5159  hypothetical protein  27.33 
 
 
341 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4982  hypothetical protein  28.95 
 
 
341 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5109  hypothetical protein  28 
 
 
341 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3946  hypothetical protein  31.79 
 
 
326 aa  46.6  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00455123  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0160  putative cell division permease protein FtsX  29.79 
 
 
324 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2451  hypothetical protein  22.33 
 
 
293 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000143098  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0711  hypothetical protein  28.5 
 
 
294 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1774  cell division ABC transporter, permease protein FtsX, putative  25 
 
 
316 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.032171  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0245  cell division protein FtsX  23.94 
 
 
295 aa  42.7  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1982  cell division protein FtsX  24.1 
 
 
293 aa  43.1  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.983793  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00278  cell division protein  29.73 
 
 
322 aa  42.7  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>