29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7782 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7782  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 334 aa  674    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.165999  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0124  aminoglycoside phosphotransferase  49.38 
 
 		 338 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2871  aminoglycoside phosphotransferase  50.16 
 
 		 358 aa  280  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.129273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1765  aminoglycoside phosphotransferase  48.94 
 
 		 340 aa  237  3e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2071  aminoglycoside phosphotransferase  33.64 
 
 		 338 aa  177  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2096  aminoglycoside phosphotransferase  40.51 
 
 		 343 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1488  aminoglycoside phosphotransferase  36.22 
 
 		 346 aa  140  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.633549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2754  aminoglycoside phosphotransferase  34.75 
 
 		 341 aa  129  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3248  methylthioribose kinase  22.78 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.58937  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0641  methylthioribose kinase  19.69 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.689037  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3520  predicted protein  25.45 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0282034 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5889  methylthioribose kinase  23.29 
 
 		 429 aa  53.9  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0199643  normal  0.507346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4543  methylthioribose kinase  23.69 
 
 		 433 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1098  methylthioribose kinase  21.86 
 
 		 393 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2024  hypothetical protein  33.07 
 
 		 333 aa  50.4  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.010627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4831  methylthioribose kinase  20.55 
 
 		 423 aa  50.4  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.226864  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0964  methylthioribose kinase  27.19 
 
 		 419 aa  49.7  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.155743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0520  methylthioribose kinase  24.2 
 
 		 419 aa  49.3  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2318  protein of unknown function DUF227  28.99 
 
 		 385 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.100619  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3317  methylthioribose kinase  23.32 
 
 		 407 aa  46.6  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1139  methylthioribose kinase  21.76 
 
 		 399 aa  47  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3408  aminoglycoside phosphotransferase-like  23.46 
 
 		 263 aa  46.6  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0833457 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3327  methylthioribose kinase  23.32 
 
 		 409 aa  46.6  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3178  methylthioribose kinase  23.32 
 
 		 407 aa  46.2  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0407  methylthioribose kinase  31.07 
 
 		 409 aa  46.2  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23811  predicted protein  23.45 
 
 		 817 aa  43.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3446  methylthioribose kinase  22.69 
 
 		 400 aa  43.1  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0807  Serine/threonine protein kinase-like protein  32.2 
 
 		 1190 aa  42.7  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3299  methylthioribose kinase  22.69 
 
 		 400 aa  42.7  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>