64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2876 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2876  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
294 aa  600  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205831  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00970  hypothetical protein  36.86 
 
 
437 aa  165  6.9999999999999995e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2245  hypothetical protein  29.38 
 
 
485 aa  70.9  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3881  hypothetical protein  28.96 
 
 
494 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.066726  normal  0.0411034 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 
1523 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 
1523 aa  59.3  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0069  glycosyl transferase family 2  26.84 
 
 
302 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.866174  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  25.65 
 
 
1739 aa  55.8  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  28.68 
 
 
320 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3494  hypothetical protein  25.49 
 
 
269 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08321  glycosyl transferase family protein  24.14 
 
 
305 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.389273  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3554  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 
329 aa  51.2  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.200701  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0590  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
329 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3380  glycosyl transferase family protein  39.56 
 
 
224 aa  49.3  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2176  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
324 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0528602  hitchhiker  0.0000162414 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  36.44 
 
 
312 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  25.81 
 
 
2401 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1887  glycosyl transferase family 2  26.53 
 
 
353 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3804  glycosyl transferase family protein  22.92 
 
 
582 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0155  glycosyl transferase family 2  20.67 
 
 
298 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0908  glycosyl transferase family protein  27.4 
 
 
574 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0214685  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08131  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 
303 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  25.24 
 
 
310 aa  47.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
268 aa  47.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5379  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
309 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08121  glycosyl transferase family protein  24.63 
 
 
303 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2956  glycosyl transferase family 2  26.9 
 
 
319 aa  47  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  35.59 
 
 
312 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1152  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  30.93 
 
 
515 aa  46.6  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000783621  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  29.21 
 
 
276 aa  46.6  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0760  glycosyl transferase family protein  22.28 
 
 
303 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0716  glycosyl transferase family protein  31.95 
 
 
340 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.000599057  normal  0.0145309 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  27.87 
 
 
275 aa  46.2  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5651  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 
315 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 
306 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  21.99 
 
 
327 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  34.04 
 
 
313 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  21.99 
 
 
327 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  41.54 
 
 
544 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2332  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 
280 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.154837 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1697  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 
280 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
334 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2309  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 
280 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2859  glycosyl transferase family protein  23.83 
 
 
291 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0761346  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0399  glycosyl transferase family 2  32.65 
 
 
454 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  26.6 
 
 
270 aa  43.9  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2457  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 
288 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2228  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
280 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2508  glycosyl transferase, family 2  31.68 
 
 
305 aa  43.5  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1277  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  29.7 
 
 
516 aa  43.9  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0071  glycosyl transferase family 2  25.36 
 
 
334 aa  43.5  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0258597 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0966  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 
312 aa  43.5  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  22.07 
 
 
1435 aa  43.5  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  34.71 
 
 
320 aa  43.5  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.17 
 
 
327 aa  43.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.17 
 
 
327 aa  43.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0237  putative glycosyl transferase  36 
 
 
334 aa  43.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0630  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
315 aa  42.7  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  24.17 
 
 
327 aa  42.7  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.17 
 
 
327 aa  42.7  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2348  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
309 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  28.48 
 
 
357 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 
324 aa  42.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001813  putative two-domain glycosyltransferase  42 
 
 
267 aa  42.4  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.735917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>