12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3881 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3881  hypothetical protein  100 
 
 		 494 aa  1040    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.066726  normal  0.0411034 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2245  hypothetical protein  37.76 
 
 		 485 aa  303  6.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1669  hypothetical protein  29.94 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2876  glycosyl transferase family 2  28.96 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205831  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3494  hypothetical protein  23.98 
 
 		 269 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00970  hypothetical protein  22.58 
 
 		 437 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  23.89 
 
 		 272 aa  49.7  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  22.34 
 
 		 1268 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  26.2 
 
 		 310 aa  43.9  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2107  glycosyl transferase family 2  25.25 
 
 		 313 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2151  glycosyl transferase family 2  25.25 
 
 		 313 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  23.89 
 
 		 270 aa  43.5  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>