40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2502 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2502  Rha family phage regulatory protein  100 
 
 		 200 aa  419  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2510  Rha family phage regulatory protein  80 
 
 		 207 aa  321  4e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2286  putative antirepressor  49.19 
 
 		 380 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.36993  hitchhiker  4.73451e-22 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1419  Rha family phage regulatory protein  49.12 
 
 		 284 aa  108  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000100347  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4461  putative antirepressor  51.4 
 
 		 276 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1251  putative phage regulatory protein, Rha family  51.49 
 
 		 282 aa  106  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000124427  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0838  Cpp32  45.76 
 
 		 245 aa  93.2  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00488204  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0897  phage regulatory protein, Rha family  49.45 
 
 		 167 aa  91.3  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194242  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0029  cpp32  40.13 
 
 		 188 aa  91.3  9e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a011  putative antirepressor, Rha family  45.45 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2343  hypothetical protein  39.45 
 
 		 311 aa  81.3  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.259786  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0841  Cpp32  32.52 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000551313  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1464  phage anti-repressor protein  46.39 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521723  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0306  Rha family phage regulatory protein  42.86 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0863  uncharacterized phage-encoded protein  42.59 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.18472e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2607  hypothetical protein  42.57 
 
 		 172 aa  77.4  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113309  normal  0.0343315 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0764  Rha family phage regulatory protein  33.12 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1666  phage-encoded protein-like protein  33.96 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.279039  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1059  antirepressor, putative  37.1 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3314  phage-encoded protein-like  37.17 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0795  Rha family phage regulatory protein  40.78 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.142717 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1737  phage-encoded protein-like  42.57 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2652  Rha family phage regulatory protein  33.04 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1974  phage regulatory protein, Rha family  32.46 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452898  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2989  phage regulatory protein, Rha family  39.6 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.347787  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1731  phage-encoded protein-like  42.39 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2427  hypothetical protein  59.62 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.114835 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2806  rha protein, phage phi-80  45.71 
 
 		 72 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.022492  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2799  phage-encoded protein-like  35.65 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.181279  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0597  phage regulatory protein, Rha family  29.63 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1046  Rha family phage regulatory protein  25.56 
 
 		 258 aa  48.5  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00498472  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1027  Rha family phage regulatory protein  25.56 
 
 		 258 aa  48.5  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000867167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3457  antirepressor  28.93 
 
 		 236 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000836104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3131  phage-encoded protein-like protein  37.84 
 
 		 91 aa  46.6  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1382  hypothetical protein  41.27 
 
 		 128 aa  46.6  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.469514  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1505  antirepressor  26.5 
 
 		 252 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0420  hypothetical protein  24.44 
 
 		 250 aa  44.7  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000377873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0434  hypothetical protein  24.06 
 
 		 243 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483628  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3359  phage-encoded protein-like  27.07 
 
 		 259 aa  42  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3463  Rha family regulatory protein  25.62 
 
 		 233 aa  41.6  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>