44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5545 on replicon NC_008147
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008147  Mmcs_5545  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  340  5.999999999999999e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.092464 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5947  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  340  5.999999999999999e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264862  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  49.18 
 
 
437 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  49.18 
 
 
437 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  40.48 
 
 
682 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3457  hypothetical protein  41.67 
 
 
220 aa  101  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102904  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3215  hypothetical protein  40.31 
 
 
216 aa  100  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11745  hypothetical protein  41.1 
 
 
256 aa  100  8e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.409869 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10325  hypothetical protein  41.13 
 
 
220 aa  99  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1672  hypothetical protein  43.55 
 
 
234 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.658702  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2904  hypothetical protein  38.36 
 
 
251 aa  94.7  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2934  hypothetical protein  38.36 
 
 
251 aa  94.7  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.121978 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2948  hypothetical protein  38.36 
 
 
251 aa  94.7  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5081  hypothetical protein  43.55 
 
 
232 aa  94  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5762  hypothetical protein  43.33 
 
 
322 aa  91.7  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5734  hypothetical protein  43.1 
 
 
365 aa  88.2  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5444  hypothetical protein  43.1 
 
 
365 aa  88.2  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5355  hypothetical protein  43.1 
 
 
365 aa  88.2  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5924  hypothetical protein  42.98 
 
 
370 aa  87.8  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0423  hypothetical protein  38.52 
 
 
201 aa  87  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0402  hypothetical protein  38.52 
 
 
199 aa  87  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0472134  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0414  hypothetical protein  38.52 
 
 
201 aa  87  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0505  hypothetical protein  42.98 
 
 
364 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1943  hypothetical protein  36.52 
 
 
289 aa  75.1  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.762706  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2764  hypothetical protein  37.17 
 
 
294 aa  67.4  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2375  surface antigen  42.71 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7309  hypothetical protein  35.92 
 
 
324 aa  65.1  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7968  hypothetical protein  30.36 
 
 
303 aa  64.7  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2527  hypothetical protein  34.65 
 
 
340 aa  62  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2368  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  41.32 
 
 
288 aa  60.8  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.238108  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2434  hypothetical protein  33.02 
 
 
324 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.259817  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2500  hypothetical protein  34.65 
 
 
339 aa  58.5  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718285  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0305  hypothetical protein  33.64 
 
 
317 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0032  group B streptococcal surface immunogenic protein  29.91 
 
 
434 aa  55.1  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  34.74 
 
 
1048 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27870  hypothetical protein  40.24 
 
 
227 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.86582  normal  0.0220968 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0294  hypothetical protein  31.07 
 
 
322 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3631  hypothetical protein  35.19 
 
 
336 aa  52  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0930  hypothetical protein  37.35 
 
 
357 aa  51.2  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  34.62 
 
 
364 aa  48.5  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0804  hypothetical protein  30.43 
 
 
349 aa  45.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1133  hypothetical protein  31.19 
 
 
358 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  29.32 
 
 
320 aa  41.6  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0540  hypothetical protein  24.14 
 
 
366 aa  41.2  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>