148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3675 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  100 
 
 		 75 aa  142  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3245  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  47.22 
 
 		 75 aa  67  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1892  H+transporting two-sector ATPase C subunit  48.61 
 
 		 74 aa  61.2  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0141 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  55.56 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  47.83 
 
 		 72 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  47.83 
 
 		 72 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  47.83 
 
 		 72 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  47.83 
 
 		 72 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  47.83 
 
 		 72 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  47.83 
 
 		 72 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  47.83 
 
 		 72 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  47.83 
 
 		 72 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  47.83 
 
 		 72 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  47.83 
 
 		 72 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  53.12 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  46.38 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  48.53 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2453  ATP synthase F0, C subunit  53.23 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0397  F0F1 ATP synthase subunit C  37.5 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1067  ATP synthase F0, C subunit  48.53 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0428  F0F1 ATP synthase subunit C  40.28 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.505104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4623  ATP synthase F0, C subunit  43.94 
 
 		 92 aa  57  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  54.55 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1019  H+transporting two-sector ATPase C subunit  50.79 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4378  H+transporting two-sector ATPase C subunit  41.1 
 
 		 74 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  46.88 
 
 		 70 aa  53.5  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19180  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  48.53 
 
 		 75 aa  53.5  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  46.88 
 
 		 70 aa  53.5  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  46.88 
 
 		 70 aa  53.5  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  41.18 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  40.26 
 
 		 79 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  42.67 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4017  H+transporting two-sector ATPase C subunit  47.14 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000406172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  43.75 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6141  ATP synthase F0, C subunit  49.02 
 
 		 73 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  42.67 
 
 		 75 aa  51.2  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  46.88 
 
 		 70 aa  51.2  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0660  F0F1-type ATP synthase, subunit c  41.18 
 
 		 70 aa  51.2  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.307082  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0847  ATP synthase F0, C subunit  35.62 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  43.4 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  39.44 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  41.79 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2332  hypothetical protein  35.59 
 
 		 91 aa  49.7  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2412  ATP synthase F0, C subunit  48 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  43.4 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  41.38 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0873  F0F1 ATP synthase subunit C  40.38 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1087  F0F1 ATP synthase subunit C  40.38 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  41.79 
 
 		 91 aa  48.9  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  41.51 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0696  F0F1 ATP synthase subunit C  37.5 
 
 		 74 aa  48.9  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 		 77 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0895  H+transporting two-sector ATPase C subunit  46.77 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0713  ATP synthase F0, C subunit  45 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0869955  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3369  ATP synthase F0, C subunit  41.27 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0857741  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  41.79 
 
 		 91 aa  48.9  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  40.79 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3498  H+transporting two-sector ATPase C subunit  41.27 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0331  ATP synthase F0, C subunit  44 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3174  H+transporting two-sector ATPase C subunit  41.27 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  41.51 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  41.51 
 
 		 82 aa  47.4  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1488  F0F1 ATP synthase subunit C  42.31 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7658  H+transporting two-sector ATPase C subunit  39.68 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.076902  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  39.66 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6945  H+transporting two-sector ATPase C subunit  39.68 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0893  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit C  38.57 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.154695 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0990  ATP synthase F0, C subunit  51.28 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.447801  normal  0.601286 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  39.66 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3308  F0F1 ATP synthase subunit C  40.82 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000866069  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3360  ATP synthase F0, C subunit  36.62 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000392065  hitchhiker  0.00459127 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0517  ATP synthase F0, C subunit  38.46 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.959097  normal  0.580721 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08130  ATP synthase subunit C  46.03 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3334  ATP synthase F0 subunit C  42.31 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2884  ATP synthase F0, C subunit  42.03 
 
 		 73 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000318758  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  38.03 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0930  F0F1 ATP synthase subunit C  41.27 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  36.62 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0513  F0F1 ATP synthase subunit C  41.27 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  36.62 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  36.62 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  38.03 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  36.62 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  41.33 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  39.62 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3143  ATP synthase F0, C subunit  39.66 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00841289  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4141  ATP synthase F0, C subunit  45.16 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2700  ATP synthase F0, C subunit  32.73 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  41.38 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0065  ATP synthase F0, C subunit  42.62 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.475844  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2255  ATP synthase F0, C subunit  39.62 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.139541  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1643  ATP synthase F0, C subunit  54.35 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.915804  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3387  F0F1 ATP synthase subunit C  39.62 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000140393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2708  ATP synthase F0, C subunit  42.62 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00577662  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1758  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  38.81 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19238  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1429  ATP synthase F0, C subunit  54.55 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0579198  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  38.03 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2716  F0F1 ATP synthase subunit C  39.62 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2603  ATP synthase F0, C subunit  38.46 
 
 		 73 aa  45.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239607  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3635  ATP synthase F0, C subunit  44.44 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466022  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>