89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1643 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1643  ATP synthase F0, C subunit  100 
 
 		 107 aa  203  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.915804  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  53.73 
 
 		 75 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  45.07 
 
 		 77 aa  57  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  43.08 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  43.08 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  43.08 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  43.75 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  41.94 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1067  ATP synthase F0, C subunit  48.21 
 
 		 81 aa  50.4  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0517  ATP synthase F0, C subunit  45.95 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.959097  normal  0.580721 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  44.62 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4623  ATP synthase F0, C subunit  34.78 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3245  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  42.25 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1892  H+transporting two-sector ATPase C subunit  44 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0141 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  41.67 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf042  ATP synthase C chain  36.11 
 
 		 90 aa  48.1  0.00003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2453  ATP synthase F0, C subunit  47.27 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  39.13 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  37.97 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  45.45 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  37.84 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1243  F0F1 ATP synthase subunit C  45.1 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.290322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  38.89 
 
 		 73 aa  47.4  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000013986  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2884  ATP synthase F0, C subunit  39.44 
 
 		 73 aa  47.4  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000318758  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0847  ATP synthase F0, C subunit  35.48 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  36.92 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2332  hypothetical protein  36.84 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  36.92 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  35.71 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  36.92 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  33.65 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  36.92 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  36.92 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  36.92 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  36.92 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  37.68 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  36.92 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  36.92 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  36.92 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  36.92 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  37.68 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  37.68 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  37.68 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2246  ATP synthase F0, C subunit  39.39 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.548731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0397  F0F1 ATP synthase subunit C  34.25 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  37.68 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  43.64 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  37.68 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  43.64 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0152  ATP synthase, C subunit  40.28 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl110  ATP synthase subunit C  42.86 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  37.88 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2603  ATP synthase F0, C subunit  36.36 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239607  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  41.07 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  44.07 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4101  F0F1 ATP synthase subunit C  35.14 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000110269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2143  ATP synthase F0, C subunit  37.04 
 
 		 100 aa  43.5  0.0009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0660  F0F1-type ATP synthase, subunit c  39.06 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.307082  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0893  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit C  26.32 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.154695 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0181  ATP synthase C chain  37.04 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3387  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000140393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6141  ATP synthase F0, C subunit  44.07 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2716  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2330  ATP synthase F0, C subunit  31.58 
 
 		 95 aa  42  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000022409  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0079  ATP synthase F0, subunit c  40.85 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  38.46 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4378  H+transporting two-sector ATPase C subunit  41.79 
 
 		 74 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  31.34 
 
 		 91 aa  41.6  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4067  ATP synthase F0, C subunit  41.51 
 
 		 77 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0293539  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 		 82 aa  41.2  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0065  ATP synthase F0, C subunit  38.33 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.475844  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2708  ATP synthase F0, C subunit  38.33 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00577662  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0895  H+transporting two-sector ATPase C subunit  45.45 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  31.34 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1959  F0F1 ATP synthase subunit C  25.3 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2700  ATP synthase F0, C subunit  36 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3635  ATP synthase F0, C subunit  39.24 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1488  F0F1 ATP synthase subunit C  39.62 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0305  F0F1 ATP synthase subunit C  32.53 
 
 		 90 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000326733  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0857  F0F1 ATP synthase subunit C  37.93 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00162341  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3334  ATP synthase F0 subunit C  39.62 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19180  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  41.27 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7658  H+transporting two-sector ATPase C subunit  40 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.076902  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2777  F0F1 ATP synthase subunit C  31.08 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.787943  normal  0.376194 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6945  H+transporting two-sector ATPase C subunit  40 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1758  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  36.11 
 
 		 69 aa  40  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>