More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0414 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  100 
 
 		 314 aa  653    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2305  thioredoxin reductase  64.31 
 
 		 334 aa  409  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0781239 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2145  thioredoxin reductase  62.94 
 
 		 314 aa  407  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  62.78 
 
 		 317 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2898  thioredoxin reductase  64.72 
 
 		 314 aa  403  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  62.5 
 
 		 323 aa  404  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30280  thioredoxin reductase 1  62.5 
 
 		 316 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  62.5 
 
 		 323 aa  404  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  61.24 
 
 		 345 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  62.46 
 
 		 316 aa  399  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  62.46 
 
 		 316 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  63.41 
 
 		 319 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2591  thioredoxin reductase 1  62.5 
 
 		 316 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  59.24 
 
 		 324 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  61.2 
 
 		 317 aa  394  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2389  thioredoxin reductase  61.83 
 
 		 316 aa  394  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0722352 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1753  thioredoxin reductase  61.2 
 
 		 317 aa  395  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  59.35 
 
 		 321 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1360  thioredoxin reductase  63.09 
 
 		 332 aa  392  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  58.52 
 
 		 326 aa  392  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  57.96 
 
 		 324 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  59.68 
 
 		 321 aa  393  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  58.2 
 
 		 324 aa  391  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0791  thioredoxin reductase  61.39 
 
 		 321 aa  387  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0703  thioredoxin reductase  61.39 
 
 		 321 aa  389  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02606  thioredoxin reductase  61.44 
 
 		 319 aa  390  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3179  thioredoxin reductase  60.88 
 
 		 316 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003744  thioredoxin reductase  61.83 
 
 		 319 aa  390  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.891826  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1248  thioredoxin reductase  57.96 
 
 		 324 aa  388  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0248  thioredoxin reductase  61.13 
 
 		 319 aa  389  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  60.25 
 
 		 318 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000709992  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  58.06 
 
 		 321 aa  385  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28230  thioredoxin-disulfide reductase  62.78 
 
 		 315 aa  386  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.75824  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1443  thioredoxin reductase  61.34 
 
 		 352 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  59.55 
 
 		 321 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1838  thioredoxin reductase  61.76 
 
 		 321 aa  387  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  59.28 
 
 		 325 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3139  thioredoxin-disulfide reductase  57.96 
 
 		 338 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  60.57 
 
 		 320 aa  382  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0488  thioredoxin reductase  61.27 
 
 		 316 aa  381  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.723059  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  59.42 
 
 		 334 aa  382  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1001  thioredoxin reductase  60.95 
 
 		 345 aa  382  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.24844  normal  0.15101 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0056  thioredoxin reductase  58.31 
 
 		 326 aa  381  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  60.57 
 
 		 320 aa  382  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4304  thioredoxin reductase  61.17 
 
 		 335 aa  383  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1221  thioredoxin reductase  58.5 
 
 		 324 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3213  thioredoxin reductase  60.38 
 
 		 314 aa  381  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.166551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  59.55 
 
 		 321 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1932  thioredoxin reductase  61.39 
 
 		 323 aa  383  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  57.56 
 
 		 323 aa  383  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  59.24 
 
 		 321 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  60.57 
 
 		 318 aa  384  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01037  thioredoxin-disulfide reductase  62.34 
 
 		 322 aa  384  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.088167  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06129  thioredoxin-disulfide reductase  62.34 
 
 		 322 aa  384  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.345376  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1982  thioredoxin reductase  61.44 
 
 		 328 aa  383  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.343784  normal  0.438815 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1037  thioredoxin reductase  59.81 
 
 		 333 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.526099 
 
 
-
 
NC_004310  BR1499  thioredoxin reductase  58.79 
 
 		 324 aa  378  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.770592  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2303  thioredoxin reductase  58.93 
 
 		 317 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0935  thioredoxin reductase  59.62 
 
 		 320 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2601  thioredoxin reductase  60.56 
 
 		 321 aa  378  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4077  thioredoxin reductase  59.31 
 
 		 346 aa  378  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5827  thioredoxin reductase  60.26 
 
 		 325 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0638947  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  58.68 
 
 		 314 aa  378  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1664  thioredoxin reductase  58.47 
 
 		 324 aa  378  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.28715  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1092  thioredoxin reductase  57.84 
 
 		 324 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0495  thioredoxin reductase  59.62 
 
 		 320 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1959  thioredoxin reductase  58.62 
 
 		 317 aa  378  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000155114  normal  0.552411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2017  thioredoxin reductase  58.99 
 
 		 317 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000213161  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  59.94 
 
 		 320 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0834  thioredoxin reductase  59.31 
 
 		 346 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2124  thioredoxin reductase  58.99 
 
 		 316 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000128654  normal  0.0108632 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0974  thioredoxin reductase  59.62 
 
 		 320 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2047  thioredoxin reductase  58.93 
 
 		 317 aa  379  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000827938  hitchhiker  0.00204856 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2028  thioredoxin reductase  59.06 
 
 		 316 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102058  hitchhiker  0.0000262597 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0846  thioredoxin reductase  59.31 
 
 		 320 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2621  thioredoxin-disulfide reductase  59.31 
 
 		 320 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105399  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4032  thioredoxin reductase  60.26 
 
 		 316 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000634849  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2762  thioredoxin-disulfide reductase  59.25 
 
 		 315 aa  377  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117857  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2123  thioredoxin-disulfide reductase  59.31 
 
 		 320 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2721  thioredoxin reductase  59.62 
 
 		 317 aa  376  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.49521  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1293  thioredoxin reductase  59.42 
 
 		 320 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.429956 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3045  thioredoxin-disulfide reductase  59.31 
 
 		 320 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0619  thioredoxin reductase  58.79 
 
 		 342 aa  376  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000125941  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3078  thioredoxin-disulfide reductase  59.31 
 
 		 320 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1283  thioredoxin reductase  58.68 
 
 		 319 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0789  thioredoxin-disulfide reductase  59.31 
 
 		 320 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  57.19 
 
 		 324 aa  375  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  60.57 
 
 		 320 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3383  thioredoxin reductase  59.94 
 
 		 317 aa  375  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.281365 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  60.57 
 
 		 320 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  55.31 
 
 		 331 aa  374  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3801  thioredoxin reductase  60.7 
 
 		 328 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2959  thioredoxin reductase  60.57 
 
 		 317 aa  374  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.457436  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0684  thioredoxin reductase  60.88 
 
 		 317 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00860267  normal  0.703249 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  57.56 
 
 		 321 aa  375  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1991  thioredoxin-disulfide reductase  59.31 
 
 		 320 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2370  thioredoxin reductase  58.93 
 
 		 316 aa  376  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0981  thioredoxin-disulfide reductase  58.33 
 
 		 317 aa  374  1e-103  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.708131  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1681  thioredoxin reductase  59.75 
 
 		 323 aa  374  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal  0.152153 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1769  thioredoxin reductase  59.56 
 
 		 317 aa  376  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.0215764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>