More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1841 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_0899  CTP synthetase  63.92 
 
 
558 aa  706  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.995561  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3280  CTP synthetase  68.4 
 
 
545 aa  761  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  2.22232e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  60.37 
 
 
553 aa  687  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1184  CTP synthetase  68.22 
 
 
546 aa  758  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0154566  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0794  CTP synthetase  65.54 
 
 
545 aa  737  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0895398  normal  0.701374 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1289  CTP synthetase  68.4 
 
 
545 aa  763  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.934915  hitchhiker  2.80114e-09 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3084  CTP synthetase  65.54 
 
 
545 aa  728  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  6.46787e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2924  CTP synthetase  65.54 
 
 
545 aa  728  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.6445e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03526  CTP synthetase  67.04 
 
 
546 aa  763  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  67.9 
 
 
555 aa  766  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3156  CTP synthetase  61.52 
 
 
542 aa  652  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0821196 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3317  CTP synthetase  66.67 
 
 
545 aa  743  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00384789  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5105  CTP synthetase  62.5 
 
 
552 aa  707  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1161  CTP synthetase  64.84 
 
 
553 aa  712  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650114 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  67.72 
 
 
555 aa  766  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1176  CTP synthetase  60.66 
 
 
563 aa  681  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.413679 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0614  CTP synthetase  66.36 
 
 
554 aa  742  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2127  CTP synthetase  64.47 
 
 
552 aa  711  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0913295  normal  0.042023 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3351  CTP synthetase  68.03 
 
 
545 aa  755  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.38422e-06  hitchhiker  2.52338e-05 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2918  CTP synthetase  65.54 
 
 
545 aa  728  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000134002  normal  0.938704 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0932  CTP synthetase  65.54 
 
 
545 aa  728  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000109112  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3447  CTP synthetase  66.67 
 
 
545 aa  743  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.125216  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  61.08 
 
 
540 aa  652  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  71.24 
 
 
542 aa  802  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  58.01 
 
 
533 aa  644  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0980  CTP synthetase  66.67 
 
 
545 aa  743  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0184119  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  59.74 
 
 
555 aa  656  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  56.27 
 
 
535 aa  635  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  57.14 
 
 
533 aa  636  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  1.27982e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1204  CTP synthetase  68.4 
 
 
545 aa  763  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000204322  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1468  CTP synthetase  65.99 
 
 
553 aa  719  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.915674  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2633  CTP synthetase  65.99 
 
 
553 aa  719  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267072  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2579  CTP synthetase  65.99 
 
 
570 aa  719  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3128  CTP synthetase  68.4 
 
 
545 aa  761  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  1.12535e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  56.93 
 
 
542 aa  640  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3123  CTP synthetase  65.81 
 
 
553 aa  719  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.839664  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0218  CTP synthetase  61.06 
 
 
557 aa  691  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.682216 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2845  CTP synthetase  62.73 
 
 
555 aa  713  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  70.87 
 
 
542 aa  798  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  3.00969e-05 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0945  CTP synthetase  63.55 
 
 
553 aa  703  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3234  CTP synthetase  65.92 
 
 
545 aa  740  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2758  CTP synthetase  68.77 
 
 
545 aa  764  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  2.21418e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2054  CTP synthetase  60.22 
 
 
542 aa  640  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3137  CTP synthetase  68.4 
 
 
545 aa  761  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.10473e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  71.3 
 
 
542 aa  804  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1298  CTP synthetase  68.65 
 
 
544 aa  764  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1670  CTP synthetase  64.94 
 
 
543 aa  751  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004808  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  71.24 
 
 
542 aa  802  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2348  CTP synthetase  60.74 
 
 
544 aa  639  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1238  CTP synthetase  63.89 
 
 
543 aa  652  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2979  CTP synthetase  60.71 
 
 
534 aa  651  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.535852  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2026  CTP synthetase  67.04 
 
 
545 aa  758  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  4.06175e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  71.8 
 
 
543 aa  808  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  83.49 
 
 
551 aa  947  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2019  CTP synthetase  64.1 
 
 
552 aa  707  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0440235 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1716  CTP synthase  57.7 
 
 
545 aa  637  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  57.86 
 
 
531 aa  653  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3443  CTP synthetase  62.71 
 
 
559 aa  713  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38810  CTP synthetase  70.74 
 
 
543 aa  792  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  57.3 
 
 
541 aa  654  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0915  CTP synthetase  62.52 
 
 
552 aa  714  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2233  CTP synthetase  60.22 
 
 
555 aa  636  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  75.09 
 
 
547 aa  832  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  57.25 
 
 
535 aa  656  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  56.56 
 
 
534 aa  637  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4327  CTP synthetase  61.22 
 
 
555 aa  667  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0975  CTP synthetase  60.89 
 
 
547 aa  657  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2029  CTP synthetase  59.96 
 
 
542 aa  635  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1065  CTP synthetase  64.84 
 
 
553 aa  720  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.242214  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0851  CTP synthetase  66.73 
 
 
545 aa  752  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.718725  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1472  CTP synthase  74.16 
 
 
555 aa  816  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002506  CTP synthase  66.67 
 
 
546 aa  756  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.44608e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0662  CTP synthetase  69.44 
 
 
549 aa  779  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3546  CTP synthetase  66.54 
 
 
545 aa  747  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.319246  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  58.44 
 
 
531 aa  652  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  60.22 
 
 
547 aa  641  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  59.3 
 
 
546 aa  662  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0156  CTP synthetase  59.7 
 
 
546 aa  649  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3387  CTP synthetase  67.1 
 
 
545 aa  750  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0942417  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0817  CTP synthetase  67.29 
 
 
545 aa  755  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.351659  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02587  hypothetical protein  65.54 
 
 
545 aa  728  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  4.48332e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  58.12 
 
 
532 aa  664  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  61.27 
 
 
550 aa  678  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3169  CTP synthetase  65.61 
 
 
545 aa  740  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0659472  normal  0.252968 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1448  CTP synthetase  67.72 
 
 
554 aa  727  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1727  CTP synthetase  58.96 
 
 
535 aa  640  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  55.56 
 
 
533 aa  640  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  56.83 
 
 
537 aa  635  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00174  CTP synthetase  67.9 
 
 
554 aa  746  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142517  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0969  CTP synthetase  64.65 
 
 
553 aa  717  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.471871  normal  0.0231208 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2562  CTP synthetase  64.04 
 
 
557 aa  707  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.542571  normal  0.0982923 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3093  CTP synthetase  65.54 
 
 
545 aa  728  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.106381  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1441  CTP synthetase  64.95 
 
 
553 aa  716  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0566  CTP synthetase  66.36 
 
 
554 aa  743  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.796665  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3150  CTP synthetase  65.8 
 
 
545 aa  742  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858121  normal  0.288938 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3111  CTP synthetase  65.8 
 
 
545 aa  742  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03082  CTP synthetase  67.85 
 
 
543 aa  755  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  7.72842e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0847  CTP synthetase  65.12 
 
 
545 aa  691  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.234606  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1236  CTP synthetase  68.59 
 
 
545 aa  762  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.61678e-07  hitchhiker  2.00253e-09 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1661  CTP synthetase  67.29 
 
 
550 aa  747  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>