More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0065 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0065  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
326 aa  652  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0766  alcohol dehydrogenase  71.38 
 
 
327 aa  470  1e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24770  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  73.93 
 
 
328 aa  459  1e-128  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2939  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  69.85 
 
 
327 aa  452  1e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533119  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4477  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  65.85 
 
 
327 aa  448  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.06096e-09 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2819  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  68.62 
 
 
327 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1526  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  68 
 
 
327 aa  450  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2753  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  66.67 
 
 
327 aa  447  1e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.700456  normal  0.0252326 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2962  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  69.23 
 
 
327 aa  442  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.372073  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0808  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  67.38 
 
 
327 aa  441  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1984  alcohol dehydrogenase  67.38 
 
 
327 aa  438  1e-122  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18460  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  67.38 
 
 
327 aa  439  1e-122  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5289  quinone oxidoreductase  66.46 
 
 
327 aa  437  1e-122  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574483  normal  0.60541 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2968  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  65.43 
 
 
327 aa  440  1e-122  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0338214  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1474  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  66.98 
 
 
331 aa  435  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0250  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  65.54 
 
 
327 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.68401  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2639  zinc-binding alcohol dehydrogenase  65.43 
 
 
345 aa  434  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.718234  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0359  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  66.15 
 
 
327 aa  433  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  6.24901e-08 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4744  alcohol dehydrogenase  65.85 
 
 
327 aa  431  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5324  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1643  zinc-binding alcohol dehydrogenase  66.77 
 
 
327 aa  430  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.561484  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1204  quinone oxidoreductase  66.05 
 
 
326 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.740135  normal  0.265781 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5461  zinc-binding alcohol dehydrogenase  64.92 
 
 
327 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1185  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  66.15 
 
 
327 aa  426  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3408  alcohol dehydrogenase  63.08 
 
 
327 aa  424  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5401  alcohol dehydrogenase  64.92 
 
 
327 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910947 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4748  oxidoreductase, zinc-binding  62.15 
 
 
327 aa  424  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3356  quinone oxidoreductase  64.92 
 
 
327 aa  424  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0638936 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3700  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  64.31 
 
 
327 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4869  quinone oxidoreductase  64 
 
 
327 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.578327  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1210  alcohol dehydrogenase  66.56 
 
 
328 aa  418  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783737  normal  0.219465 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0752  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  62.65 
 
 
330 aa  416  1e-115  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534368  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0612  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  65.64 
 
 
329 aa  416  1e-115  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00543509 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2846  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  64.51 
 
 
328 aa  416  1e-115  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0354021  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1893  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  65.23 
 
 
327 aa  417  1e-115  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695142  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3133  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  63.17 
 
 
338 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.87638 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0950  quinone oxidoreductase  61.04 
 
 
327 aa  410  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.759216  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5139  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  62.65 
 
 
328 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1602  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  61.85 
 
 
327 aa  410  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2767  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  62.28 
 
 
338 aa  405  1e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3502  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  62.96 
 
 
328 aa  406  1e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.990659  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1675  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  63.38 
 
 
327 aa  402  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.509844  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2229  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  62.88 
 
 
327 aa  402  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.979693 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1230  zinc-binding alcohol dehydrogenase  62.35 
 
 
328 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2364  dehydrogenase NAD(P)-binding domain-containing protein  62.65 
 
 
328 aa  400  1e-110  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.214717 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2365  quinone oxidoreductase  61.73 
 
 
328 aa  399  1e-110  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3679  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  61.23 
 
 
329 aa  394  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1108  alcohol dehydrogenase  62.04 
 
 
328 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.588532  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3835  quinone oxidoreductase  61.11 
 
 
328 aa  396  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4991  alcohol dehydrogenase  60.92 
 
 
328 aa  392  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2634  zinc-binding alcohol dehydrogenase  60.92 
 
 
325 aa  393  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341992  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2477  acyl-CoA dehydrogenase-like  63.06 
 
 
738 aa  391  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193974  normal  0.0198771 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1434  putative Zn-dependent oxidoreductase  61.42 
 
 
326 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2363  alcohol dehydrogenase  61.54 
 
 
329 aa  392  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.949479  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0082  alcohol dehydrogenase  61.42 
 
 
326 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0838693  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2891  putative oxidoreductase protein  60.48 
 
 
338 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.874963  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0728  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  59.75 
 
 
325 aa  390  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.43463 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1586  alcohol dehydrogenase  60.31 
 
 
330 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3877  quinone oxidoreductase  60 
 
 
332 aa  384  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161114  normal  0.0453412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1223  quinone oxidoreductase  60.62 
 
 
328 aa  386  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1248  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  62.96 
 
 
328 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.893092  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0309  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.33 
 
 
328 aa  382  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4334  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  60.49 
 
 
334 aa  384  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511675  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4337  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  60.49 
 
 
329 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270219  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4187  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  60 
 
 
332 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3034  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  59.88 
 
 
334 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1052  quinone oxidoreductase  58.28 
 
 
327 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2517  putative zinc-binding dehydrogenase  60.49 
 
 
326 aa  377  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.145021  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4779  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  59.38 
 
 
325 aa  377  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.279047  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6206  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  58.64 
 
 
328 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3189  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.97 
 
 
333 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0105  zinc-binding alcohol dehydrogenase  57.41 
 
 
328 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227745  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0260  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  55.56 
 
 
325 aa  365  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0249  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  55.56 
 
 
325 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0608751  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0901  alcohol dehydrogenase  56.31 
 
 
327 aa  363  2e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149382  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4413  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  56.17 
 
 
325 aa  361  8e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00493012  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3346  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  56.97 
 
 
328 aa  360  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.584462  normal  0.149022 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001990  alcohol dehydrogenase  54.29 
 
 
326 aa  358  7e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3572  alcohol dehydrogenase  54.29 
 
 
326 aa  358  7e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3679  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  54.63 
 
 
326 aa  356  3e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0862676  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2475  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  54.6 
 
 
329 aa  355  4e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2493  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.91 
 
 
326 aa  354  9e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00458  alcohol dehydrogenase  53.68 
 
 
326 aa  354  1e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1035  alcohol dehydrogenase  54.91 
 
 
326 aa  350  2e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1505  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  56.04 
 
 
330 aa  350  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0463  quinone oxidoreductase  53.4 
 
 
325 aa  349  4e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.152247  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0396  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family protein  53.4 
 
 
325 aa  349  4e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0178  YhdH/YhfP family quinone oxidoreductase  56.92 
 
 
326 aa  349  4e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  8.73043e-07  normal  0.604397 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03112  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  54.94 
 
 
324 aa  349  5e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0728423  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0454  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  54.94 
 
 
324 aa  349  5e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.749607  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4569  quinone oxidoreductase, YhdH family  54.63 
 
 
324 aa  348  5e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000284525  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03063  hypothetical protein  54.94 
 
 
324 aa  349  5e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0710671  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3737  quinone oxidoreductase  54.63 
 
 
324 aa  348  5e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.96751e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0272  quinone oxidoreductase  53.68 
 
 
326 aa  348  9e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  5.68585e-07 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0454  quinone oxidoreductase  54.94 
 
 
324 aa  347  1e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0271  alcohol dehydrogenase  53.99 
 
 
326 aa  348  1e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000478762 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3837  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  56.62 
 
 
328 aa  348  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00134301  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3443  quinone oxidoreductase  54.94 
 
 
324 aa  347  1e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.78871e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3285  quinone oxidoreductase, YhdH family  54.32 
 
 
324 aa  347  2e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00682496  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1200  putative quinone oxidoreductase  53.09 
 
 
325 aa  347  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0700296  normal  0.0860145 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2972  putative zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.43 
 
 
326 aa  345  6e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>