42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4871 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4488  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  227  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4871  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  227  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468339  normal  0.0822888 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4575  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  227  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.131851 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  66.98 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  64.15 
 
 		 277 aa  133  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21730  hypothetical protein, contains double-stranded beta-helix domain protein  63.89 
 
 		 109 aa  132  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.769467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1661  hypothetical protein  63.21 
 
 		 110 aa  130  7.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0496  hypothetical protein  58.72 
 
 		 111 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.41249 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3238  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  60.55 
 
 		 110 aa  128  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3536  Cupin 2 conserved barrel domain protein  66.06 
 
 		 114 aa  128  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.541629  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  59.43 
 
 		 110 aa  123  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12638  hypothetical protein  56.36 
 
 		 117 aa  121  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0484137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2089  hypothetical protein  54.46 
 
 		 130 aa  121  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154794  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4174  hypothetical protein  51.82 
 
 		 110 aa  119  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257816  normal  0.271179 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4297  hypothetical protein  55.45 
 
 		 110 aa  117  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1022  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.83 
 
 		 111 aa  115  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2051  hypothetical protein  51.4 
 
 		 110 aa  111  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.889386  normal  0.46009 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0020  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.13 
 
 		 132 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3214  cupin 2 domain-containing protein  50.47 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3698  hypothetical protein  48.15 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0927  cupin 2 domain-containing protein  51.89 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474041  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0235  hypothetical protein  41.35 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0275  hypothetical protein  41.35 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3362  hypothetical protein  45.26 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.0980345 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1759  hypothetical protein  44.34 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048485  hitchhiker  0.00577747 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2641  hypothetical protein  38.89 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2756  hypothetical protein  39.33 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.914306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31480  hypothetical protein  35.85 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  36.49 
 
 		 117 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1699  hypothetical protein  39.39 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275263  normal  0.0722973 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  33.8 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06690  hypothetical protein  37.68 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1200  cupin 2, barrel  41.79 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2019  cupin region  32.39 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.935126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.72 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.72 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.19 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2655  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  40 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.104374  hitchhiker  0.00638268 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  32.86 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0982  cupin 2 domain-containing protein  31.11 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0224  hypothetical protein  37.5 
 
 		 110 aa  40.4  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1985  hypothetical protein  32.39 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000280772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>