45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3219 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3219  ATP/GTP-binding protein  100 
 
 		 342 aa  694    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184147  normal  0.517488 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3182  putative ATP/GTP-binding protein  81.54 
 
 		 337 aa  547  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0612  ATP/GTP-binding protein  81.54 
 
 		 337 aa  547  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.775808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0497  hypothetical protein  26.67 
 
 		 377 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4716  hypothetical protein  28.25 
 
 		 354 aa  102  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3574  hypothetical protein  25.35 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0473131 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5416  AAA ATPase  27.41 
 
 		 393 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5592  AAA ATPase  27.41 
 
 		 393 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0157  transposition protein TniB  25.81 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3009  hypothetical protein  25.87 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246617 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4044  NTP-binding protein TniB  25.87 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160827  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4973  NTP-binding protein TniB  25.87 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899984  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0883  hypothetical protein  25.84 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2982  TniB family protein  25.41 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1174  transposition protein TniB  25 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4383  TniB  24.32 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0720685  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4603  TniB  24.32 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.956661  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4305  TniB  24.32 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893182  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4221  TniB  24.32 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341366  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  27.04 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  24.35 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  28.76 
 
 		 296 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0219  TniB family protein  24.89 
 
 		 325 aa  53.1  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.858856  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  25.29 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5217  hypothetical protein  22.79 
 
 		 312 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.213042 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3151  hypothetical protein  22.79 
 
 		 312 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1579  TniB family protein  25.1 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0154252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4580  TniB  26.16 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3128  uncharacterized ATPase putative transposase  22.82 
 
 		 276 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.765042 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2200  uncharacterized ATPase putative transposase  22.82 
 
 		 276 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.866593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5461  TniB family protein  26.29 
 
 		 297 aa  50.8  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.93146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5057  hypothetical protein  22.43 
 
 		 312 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4979  TniB family protein  25.59 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635243 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2935  TniB family protein  24.12 
 
 		 301 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1681  TniB family protein  24.12 
 
 		 301 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4235  hypothetical protein  24.7 
 
 		 292 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.814526 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0976  TniB family protein  22.51 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1591  TniB  20.92 
 
 		 313 aa  48.5  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.545721  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  26.97 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0694  TniB  20.92 
 
 		 313 aa  48.5  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0017  hypothetical protein  25.48 
 
 		 335 aa  47  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  24.62 
 
 		 300 aa  47  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  27.82 
 
 		 312 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4287  TniB  28.57 
 
 		 440 aa  43.5  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105258  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0626  DNA repair protein RadA  30.39 
 
 		 459 aa  42.7  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>