More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl539 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl539  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 128 aa  255  2e-67  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000175724  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0544  50S ribosomal protein L19  83.59 
 
 		 130 aa  220  4e-57  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  58.88 
 
 		 114 aa  140  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  59.81 
 
 		 116 aa  136  7.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  60.75 
 
 		 116 aa  136  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0802  50S ribosomal protein L19  54.1 
 
 		 162 aa  134  3.0000000000000003e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  60 
 
 		 118 aa  134  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  57.94 
 
 		 116 aa  134  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  57.94 
 
 		 116 aa  134  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  60.4 
 
 		 114 aa  133  9e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  58.25 
 
 		 115 aa  133  9e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  56.19 
 
 		 128 aa  131  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1413  ribosomal protein L19  62.24 
 
 		 119 aa  130  6e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000153602  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3255  50S ribosomal protein L19  60.19 
 
 		 116 aa  130  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  58.49 
 
 		 114 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  54.21 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0607  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 119 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000101225  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  58.42 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  55.88 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  58.49 
 
 		 118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5511499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  58.49 
 
 		 118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2185  50S ribosomal protein L19  57 
 
 		 114 aa  127  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0675384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  54.21 
 
 		 115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  57.55 
 
 		 114 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  57.55 
 
 		 114 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  57.55 
 
 		 114 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  57.55 
 
 		 114 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  57.55 
 
 		 114 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3590  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  57.55 
 
 		 114 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  57.55 
 
 		 114 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  57.55 
 
 		 114 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  57.55 
 
 		 114 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  53.15 
 
 		 117 aa  127  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  55.88 
 
 		 115 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0989  ribosomal protein L19  54.29 
 
 		 118 aa  127  6e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000000485147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  58.42 
 
 		 118 aa  127  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  54.21 
 
 		 115 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2917  50S ribosomal protein L19  53.7 
 
 		 117 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000537691  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0302  ribosomal protein L19  56.31 
 
 		 116 aa  127  7.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0983  50S ribosomal protein L19  57 
 
 		 120 aa  126  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  58.42 
 
 		 119 aa  126  8.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  55.66 
 
 		 118 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2304  ribosomal protein L19  62.5 
 
 		 117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000000980437  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2751  50S ribosomal protein L19  53.7 
 
 		 117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000896071  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  55.24 
 
 		 113 aa  125  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1402  ribosomal protein L19  58.42 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00379521 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0652  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.520317  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  56.6 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0789  50S ribosomal protein L19  53.33 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.23665e-16  unclonable  1.39809e-28 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  54.9 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1152  50S ribosomal protein L19  58.59 
 
 		 118 aa  124  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  59 
 
 		 116 aa  124  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  55.88 
 
 		 115 aa  124  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3132  ribosomal protein L19  59 
 
 		 116 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1831  50S ribosomal protein L19  57 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002539  LSU ribosomal protein L19p  52.25 
 
 		 117 aa  124  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000131397  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1274  ribosomal protein L19  53.27 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03477  50S ribosomal protein L19  52.25 
 
 		 117 aa  124  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1093  50S ribosomal protein L19  58.82 
 
 		 119 aa  124  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00704919  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0228  ribosomal protein L19  55.45 
 
 		 119 aa  124  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2479  50S ribosomal protein L19  59 
 
 		 119 aa  123  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  52.34 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0913  ribosomal protein L19  58.42 
 
 		 119 aa  122  1e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  55.88 
 
 		 113 aa  122  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2219  50S ribosomal protein L19  58 
 
 		 119 aa  122  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000293705 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  55.05 
 
 		 114 aa  122  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1962  50S ribosomal protein L19  55.14 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 		 114 aa  122  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0892  50S ribosomal protein L19  51.85 
 
 		 117 aa  122  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00545492  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1095  50S ribosomal protein L19  55.88 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 113 aa  121  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  56.44 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11090  LSU ribosomal protein L19P  55 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.168446  normal  0.0967881 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1171  ribosomal protein L19  57 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1474  ribosomal protein L19  53.77 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0170029 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1373  LSU ribosomal protein L19P  51.89 
 
 		 113 aa  121  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000974692  normal  0.351017 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0190  50S ribosomal protein L19  56.44 
 
 		 133 aa  121  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1680  50S ribosomal protein L19  55.88 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.167471  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  55.66 
 
 		 119 aa  121  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07350  ribosomal protein L19  54.29 
 
 		 124 aa  121  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105105  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0317  50S ribosomal protein L19  52.54 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000173256  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2883  50S ribosomal protein L19  58.65 
 
 		 115 aa  120  6e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.533636 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1491  50S ribosomal protein L19  51.89 
 
 		 116 aa  120  6e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  54.29 
 
 		 115 aa  120  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  54.29 
 
 		 115 aa  120  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1360  50S ribosomal protein L19  50.93 
 
 		 117 aa  120  8e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1213  50S ribosomal protein L19  50.93 
 
 		 117 aa  120  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000888328  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1198  50S ribosomal protein L19  54.55 
 
 		 118 aa  120  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.633617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3100  50S ribosomal protein L19  50.93 
 
 		 117 aa  120  8e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026861  normal  0.106468 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1290  50S ribosomal protein L19  50.93 
 
 		 117 aa  120  8e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000003977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1171  50S ribosomal protein L19  50.93 
 
 		 117 aa  120  8e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251517  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0090  50S ribosomal protein L19  50.91 
 
 		 136 aa  120  8e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2835  50S ribosomal protein L19  50.93 
 
 		 117 aa  120  8e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000148121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2917  50S ribosomal protein L19  50.93 
 
 		 117 aa  120  8e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000128835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0076  50S ribosomal protein L19  50.91 
 
 		 136 aa  120  8e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3014  50S ribosomal protein L19  50.93 
 
 		 117 aa  120  8e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000550721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1257  50S ribosomal protein L19  50.93 
 
 		 117 aa  120  8e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000504967  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1950  50S ribosomal protein L19  57.28 
 
 		 113 aa  120  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1970  50S ribosomal protein L19  57.28 
 
 		 113 aa  120  9e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.101301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>