More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4444 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4958  FolC bifunctional protein  96.83 
 
 
441 aa  813  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.154774 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1623  FolC bifunctional protein  83.45 
 
 
441 aa  703  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0475  FolC bifunctional protein  83.9 
 
 
441 aa  726  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617675  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4908  FolC bifunctional protein  99.55 
 
 
441 aa  872  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.094704  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3380  FolC bifunctional protein  84.81 
 
 
441 aa  704  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4444  FolC bifunctional protein  100 
 
 
441 aa  873  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.545059 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0200  FolC bifunctional protein  57.6 
 
 
448 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1404  FolC bifunctional protein  58.18 
 
 
438 aa  479  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0052  folylpolyglutamate synthetase  56.42 
 
 
442 aa  469  1e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0060  FolC bifunctional protein  55.76 
 
 
442 aa  466  1e-130  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0632  FolC bifunctional protein  57.37 
 
 
448 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0094  putative folC protein  55.13 
 
 
447 aa  456  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0075  FolC bifunctional protein  56.22 
 
 
442 aa  454  1e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0673465  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1986  FolC bifunctional protein  55.33 
 
 
438 aa  441  1e-122  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0400217 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1697  FolC bifunctional protein  57.99 
 
 
447 aa  440  1e-122  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  4.1019e-06 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0389  FolC bifunctional protein  57.18 
 
 
447 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251585  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0814  FolC bifunctional protein  53.6 
 
 
430 aa  433  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2022  FolC bifunctional protein  52.63 
 
 
442 aa  425  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000765521  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2106  FolC bifunctional protein  52.86 
 
 
442 aa  426  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0277055  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  53.92 
 
 
421 aa  421  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0662  FolC bifunctional protein  54.2 
 
 
440 aa  417  1e-115  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0116745  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0024  folylpolyglutamate synthase  52.37 
 
 
470 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3240  FolC bifunctional protein  55.28 
 
 
447 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3957  FolC bifunctional protein  52.07 
 
 
442 aa  400  1e-110  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.755042  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0140  FolC bifunctional protein  52.05 
 
 
444 aa  396  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4284  FolC bifunctional protein  53.23 
 
 
442 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.045669  normal  0.825965 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1988  FolC bifunctional protein  53.42 
 
 
422 aa  392  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362806  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  51.6 
 
 
423 aa  387  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0930  folylpolyglutamate synthetase  51.14 
 
 
424 aa  361  2e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2985  FolC bifunctional protein  51.05 
 
 
412 aa  359  6e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4979  FolC bifunctional protein  50.11 
 
 
437 aa  357  2e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0132  folylpolyglutamate synthase  53.79 
 
 
422 aa  357  2e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2589  FolC bifunctional protein  51.26 
 
 
424 aa  354  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.500866  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3431  folylpolyglutamate synthetase  51.68 
 
 
435 aa  353  3e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1352  folylpolyglutamate synthase  43.34 
 
 
440 aa  352  9e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5701  FolC bifunctional protein  46.31 
 
 
467 aa  350  4e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.504133  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1963  FolC bifunctional protein  49.54 
 
 
432 aa  340  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0088  FolC bifunctional protein  47.36 
 
 
397 aa  320  3e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2729  FolC bifunctional protein  44.06 
 
 
453 aa  307  2e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0844  FolC bifunctional protein  48.39 
 
 
437 aa  304  3e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1052  folylpolyglutamate synthase  39.33 
 
 
429 aa  298  1e-79  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.275241  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0353  folylpolyglutamate synthetase  40.28 
 
 
434 aa  295  1e-78  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0702  folylpolyglutamate synthase  40.52 
 
 
435 aa  293  3e-78  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1061  FolC bifunctional protein  40.09 
 
 
443 aa  263  6e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  40.82 
 
 
426 aa  250  4e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0715  folylpolyglutamate synthase  37.62 
 
 
442 aa  244  3e-63  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1299  FolC bifunctional protein  39.53 
 
 
435 aa  242  8e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  34.63 
 
 
425 aa  213  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  34.48 
 
 
457 aa  212  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.37038e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  36.1 
 
 
427 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1077  FolC bifunctional protein (tetrahydrofolate synthase) (folylpolyglutamate synthase)  35.24 
 
 
426 aa  210  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  34.39 
 
 
428 aa  202  1e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1239  FolC bifunctional protein  37.59 
 
 
437 aa  202  1e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168236  normal  0.703163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0207  FolC bifunctional protein  32.16 
 
 
418 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0203  FolC bifunctional protein  31.92 
 
 
418 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0053743 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  34.8 
 
 
447 aa  198  1e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  36.74 
 
 
422 aa  198  2e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  35.66 
 
 
443 aa  196  7e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  35.68 
 
 
422 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  37.59 
 
 
424 aa  193  6e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  34.49 
 
 
412 aa  192  9e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  32.71 
 
 
432 aa  192  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  33.33 
 
 
429 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2573  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  36.94 
 
 
422 aa  191  3e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  36.62 
 
 
424 aa  191  3e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  35.86 
 
 
431 aa  191  3e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1665  folylpolyglutamate synthetase  36.59 
 
 
434 aa  190  6e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.157637  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3265  cytoplasmic peptidoglycan synthetase C-terminal domain  36.34 
 
 
448 aa  189  8e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.165848  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  36.82 
 
 
422 aa  188  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  33.33 
 
 
424 aa  187  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03098  folylpolyglutamate synthase  34.2 
 
 
406 aa  187  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  36.32 
 
 
427 aa  186  5e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3814  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  35.78 
 
 
434 aa  186  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0522  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.94 
 
 
421 aa  186  6e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.250389  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  31.49 
 
 
420 aa  186  7e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1256  FolC bifunctional protein  41.14 
 
 
386 aa  185  1e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2440  FolC bifunctional protein  34.28 
 
 
423 aa  185  1e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.715138  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1909  FolC bifunctional protein  36.39 
 
 
442 aa  185  2e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  32.45 
 
 
424 aa  184  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  31.74 
 
 
438 aa  183  4e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  33.18 
 
 
416 aa  184  4e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  34.71 
 
 
424 aa  183  5e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3331  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  35.75 
 
 
420 aa  183  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0040495  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  32.47 
 
 
435 aa  182  8e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  32.47 
 
 
437 aa  182  9e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2758  FolC bifunctional protein  33.49 
 
 
423 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.273906  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  34.27 
 
 
459 aa  180  5e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2741  FolC bifunctional protein  33.49 
 
 
423 aa  180  5e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1997  FolC bifunctional protein  34.53 
 
 
436 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.708043 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2797  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  34.59 
 
 
422 aa  179  8e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2835  FolC bifunctional protein  33.25 
 
 
423 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.353544  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1618  FolC bifunctional protein  33.25 
 
 
423 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1480  FolC bifunctional protein  33.02 
 
 
432 aa  178  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.293616  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002876  dihydrofolate synthase/folylpolyglutamate synthase  33.26 
 
 
420 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.394624  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1653  dihydrofolate synthase  31.86 
 
 
421 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0133997  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3525  FolC bifunctional protein  36.94 
 
 
440 aa  177  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2154  bifunctional protein: folylpolyglutamate synthase and dihydrofolate synthase  35.51 
 
 
440 aa  177  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10427  normal  0.190806 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  36.14 
 
 
424 aa  176  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0806  FolC bifunctional protein  37.08 
 
 
425 aa  177  5e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2305  FolC bifunctional protein  36.44 
 
 
430 aa  176  6e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.639794  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>