49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_R0025 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0001623  hitchhiker  0.000378957 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0025  tRNA-Leu  89.53 
 
 		 86 bp  99.6  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00953223  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0046  tRNA-Leu  86.05 
 
 		 86 bp  75.8  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.916956  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0027  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 83 bp  71.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.130394  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0052  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0047  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.306057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0052  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0050  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.822506 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0042  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.535149 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0045  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0031  tRNA-Leu  95 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0696891  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0031  tRNA-Leu  95 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.264457  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0019  tRNA-Leu  95 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.562399  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0033  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0066  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.273312 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0007  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.606248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0020    91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00753616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0009  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0050  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 83 bp  50.1  0.00009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.840462  normal  0.934802 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0003  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0024  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.154328 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA50  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.391222  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0008  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.659495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0010  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.364833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0027  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.161341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0058  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0043  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000564776  hitchhiker  0.00000000298253 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0039  tRNA-Leu  90 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20505  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0013  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.467746  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309296  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0633499 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0006  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.806028  normal  0.553629 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_R0069  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt010  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0109013  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0037  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000169907 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0032  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0173175  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0093  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.449297  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0036  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0054  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0764192  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0031  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0038  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna20  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236452  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0083  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.285322  normal  0.0887227 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0053  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0148757  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4050  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00460724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4275  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000121039  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0029  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000562682  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLeu04  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000617497 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>