29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0175 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0785  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  40.48 
 
 		 884 aa  638    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.826413  normal  0.126691 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0175  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  100 
 
 		 812 aa  1621    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0249  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  40.37 
 
 		 863 aa  585  1.0000000000000001e-165  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2235  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  41.55 
 
 		 881 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2859  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  38.7 
 
 		 854 aa  543  1e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000287651  normal  0.328764 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1209  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  39.53 
 
 		 872 aa  525  1e-147  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00285294 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0662  hypothetical protein  38.59 
 
 		 868 aa  519  1.0000000000000001e-145  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3066  hypothetical protein  36.72 
 
 		 815 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.690569 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2270  hypothetical protein  31.37 
 
 		 840 aa  424  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.807987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3149  hypothetical protein  31.69 
 
 		 808 aa  357  5e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.322699 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1579  transmembrane oligosaccharyl transferase  31.29 
 
 		 824 aa  324  4e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00308238  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0243  transmembrane oligosaccharyl transferase  29.91 
 
 		 840 aa  287  5e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1498  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  30.43 
 
 		 891 aa  287  7e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0242  transmembrane oligosaccharyl transferase  29.67 
 
 		 837 aa  284  5.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2808  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  27.75 
 
 		 1045 aa  230  7e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0927  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  28.16 
 
 		 961 aa  216  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.419112  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2752  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  28.17 
 
 		 1030 aa  204  6e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.779592 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0368  oligosaccharyl transferase  25.5 
 
 		 836 aa  200  9e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2957  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  26.92 
 
 		 998 aa  196  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3138  hypothetical protein  22 
 
 		 768 aa  157  9e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000469073  hitchhiker  0.00590217 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1062  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  31.11 
 
 		 1048 aa  153  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1164  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  26.06 
 
 		 736 aa  94.4  8e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297002  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1548  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  35.53 
 
 		 704 aa  89  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0967  uncharacterized membrane protein required for N-linked glycosylation-like protein  55.26 
 
 		 83 aa  80.5  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.152221 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0310  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  22.33 
 
 		 2073 aa  77.8  0.0000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01455  hypothetical protein similar to oligosaccharyl transferase (Eurofung)  22.6 
 
 		 741 aa  51.6  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.531962 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2819  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  33.33 
 
 		 754 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1479  hypothetical protein  31.87 
 
 		 774 aa  45.8  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.202348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0075  dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase  23.08 
 
 		 712 aa  45.1  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.70229 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>