30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0111 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0111  periplasmic binding protein  100 
 
 		 421 aa  868    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0131  periplasmic binding protein  53.04 
 
 		 411 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.400899  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0118  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  35.24 
 
 		 454 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0277  periplasmic binding protein  25.59 
 
 		 371 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0800726  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1299  periplasmic binding protein  25.9 
 
 		 414 aa  95.1  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2248  periplasmic binding protein  23.05 
 
 		 434 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226593  normal  0.029127 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3086  periplasmic binding protein  24.33 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.074128 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1003  periplasmic binding protein  24.53 
 
 		 405 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0182612  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0277  periplasmic binding protein  23.44 
 
 		 394 aa  81.3  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.035667  normal  0.0566476 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1093  periplasmic binding protein  23.51 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000816511  hitchhiker  0.00387756 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1006  putative iron complex transport system substrate-binding protein  20.98 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.568283  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0161  periplasmic binding protein  23.75 
 
 		 400 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1024  putative iron complex transport system substrate-binding protein  22.04 
 
 		 397 aa  76.6  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264421  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5372  periplasmic binding protein  23.26 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1296  putative iron complex transport system substrate-binding protein  20.45 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.220074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2136  periplasmic binding protein  22.17 
 
 		 442 aa  73.9  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24460  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  24.44 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1954  periplasmic binding protein  22.38 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0336724  hitchhiker  2.0036600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0344  periplasmic binding protein  23.22 
 
 		 437 aa  72  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1519  periplasmic binding protein  21.65 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000588293 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0083  periplasmic binding protein  23.36 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622653  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3336  periplasmic binding protein  22.26 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3498  periplasmic binding protein  24.62 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1256  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  22.09 
 
 		 374 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0670  putative lipoprotein  22.38 
 
 		 379 aa  53.9  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.174257 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12513  periplasmic-binding protein of ABC transporter  21.31 
 
 		 378 aa  49.7  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3541  periplasmic binding protein  20.3 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1596  periplasmic binding protein  22.97 
 
 		 339 aa  44.7  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0648  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  20.45 
 
 		 391 aa  44.3  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.515203 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0748  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  21.55 
 
 		 385 aa  43.1  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>