88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3045 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3045  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  388  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0153035 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4570  protein of unknown function DUF820  72.13 
 
 
198 aa  265  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.432927  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0763  hypothetical protein  33.7 
 
 
189 aa  100  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.105804 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1211  protein of unknown function DUF820  42.04 
 
 
187 aa  93.6  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3083  hypothetical protein  30.11 
 
 
195 aa  90.9  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.439197  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0449  protein of unknown function DUF820  33.71 
 
 
189 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391731  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3415  protein of unknown function DUF820  33.53 
 
 
186 aa  88.2  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1502  hypothetical protein  33.91 
 
 
194 aa  87.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155275  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4762  protein of unknown function DUF820  35.15 
 
 
202 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0762  hypothetical protein  34.71 
 
 
187 aa  85.5  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000676574  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1210  protein of unknown function DUF820  37.08 
 
 
189 aa  85.1  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.818422  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0401  protein of unknown function DUF820  32.56 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.387775  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0392  protein of unknown function DUF820  32.56 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3548  hypothetical protein  37.84 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1720  protein of unknown function DUF820  34.78 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00000927877  decreased coverage  0.000371214 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0217  hypothetical protein  31.93 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3149  hypothetical protein  31.29 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00139677  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2740  hypothetical protein  30.69 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2203  protein of unknown function DUF820  34.12 
 
 
196 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.1814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2309  hypothetical protein  29.11 
 
 
191 aa  72.4  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3996  hypothetical protein  34.67 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0222  protein of unknown function DUF820  30.97 
 
 
193 aa  71.2  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.10891  normal  0.109063 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0075  protein of unknown function DUF820  30.97 
 
 
184 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928941 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2158  protein of unknown function DUF820  30.07 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1433  protein of unknown function DUF820  32.91 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3790  protein of unknown function DUF820  26.32 
 
 
190 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0030  protein of unknown function DUF820  29.94 
 
 
179 aa  67  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1389  protein of unknown function DUF820  28.66 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1849  hypothetical protein  30.81 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2157  protein of unknown function DUF820  30.77 
 
 
185 aa  63.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2159  protein of unknown function DUF820  28.76 
 
 
189 aa  63.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4310  hypothetical protein  27.51 
 
 
197 aa  64.3  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3738  protein of unknown function DUF820  25.15 
 
 
190 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4530  hypothetical protein  29.66 
 
 
162 aa  62  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4739  protein of unknown function DUF820  26.47 
 
 
180 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1423  protein of unknown function DUF820  26.8 
 
 
186 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1855  protein of unknown function DUF820  24.61 
 
 
182 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1881  protein of unknown function DUF820  24.61 
 
 
182 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.749707  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2809  protein of unknown function DUF820  29.41 
 
 
181 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3291  protein of unknown function DUF820  29.41 
 
 
195 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.491293  normal  0.294877 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3231  hypothetical protein  27.21 
 
 
170 aa  55.1  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0380  hypothetical protein  31.85 
 
 
224 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  25.64 
 
 
251 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2991  protein of unknown function DUF820  34.82 
 
 
188 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0645262  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2097  protein of unknown function DUF820  29.68 
 
 
191 aa  51.6  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1774  protein of unknown function DUF820  32.17 
 
 
186 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  28.09 
 
 
197 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2695  protein of unknown function DUF820  26 
 
 
181 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  30.71 
 
 
201 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3408  protein of unknown function DUF820  26 
 
 
181 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.393779  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2118  protein of unknown function DUF820  32.17 
 
 
201 aa  48.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  26.03 
 
 
190 aa  48.1  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  23.42 
 
 
244 aa  47.8  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  22.75 
 
 
241 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  27.53 
 
 
197 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  28.65 
 
 
203 aa  46.6  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  31.91 
 
 
191 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2204  protein of unknown function DUF820  36.76 
 
 
117 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.171088 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3913  protein of unknown function DUF820  24.83 
 
 
190 aa  45.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2156  prevent-host-death family protein  21.02 
 
 
242 aa  45.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5162  protein of unknown function DUF820  30.47 
 
 
197 aa  45.1  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.688215 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1631  protein of unknown function DUF820  31.93 
 
 
184 aa  45.1  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2224  hypothetical protein  34.17 
 
 
219 aa  45.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108334  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2936  hypothetical protein  60.53 
 
 
244 aa  44.7  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2937  hypothetical protein  42.17 
 
 
242 aa  45.1  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  25.13 
 
 
185 aa  44.7  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1953  hypothetical protein  40.24 
 
 
241 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178671  normal  0.693391 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3435  hypothetical protein  39.51 
 
 
233 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10107  normal  0.104076 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 
189 aa  43.9  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7645  protein of unknown function DUF820  28.95 
 
 
198 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1028  protein of unknown function DUF820  27.56 
 
 
193 aa  43.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3258  protein of unknown function DUF820  27.56 
 
 
203 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2863  protein of unknown function DUF820  27.56 
 
 
203 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000118606  decreased coverage  0.0000938837 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  25.58 
 
 
202 aa  43.5  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00007573  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1952  hypothetical protein  32.82 
 
 
237 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.409436  normal  0.700871 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  22.66 
 
 
183 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  29.27 
 
 
197 aa  43.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1703  hypothetical protein  30.48 
 
 
184 aa  42.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4336  hypothetical protein  28.87 
 
 
227 aa  42.4  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145774  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3734  protein of unknown function DUF820  29.34 
 
 
223 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  21.34 
 
 
184 aa  42.7  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1702  hypothetical protein  29.41 
 
 
184 aa  42.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0749103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1153  hypothetical protein  32.14 
 
 
226 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3383  protein of unknown function DUF820  31.72 
 
 
187 aa  42  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0149444  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1413  hypothetical protein  27.98 
 
 
184 aa  42  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00371058 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  29.41 
 
 
201 aa  42  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1492  hypothetical protein  26.77 
 
 
208 aa  41.6  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1412  hypothetical protein  27.98 
 
 
184 aa  41.2  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>