49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2782 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2782  ABC-3 protein  100 
 
 		 466 aa  911    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3140  ABC 3 transport family protein  37.11 
 
 		 251 aa  105  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4332  ABC-3 protein  35.02 
 
 		 265 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.364125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0050  putative manganese transport system permease protein  29.44 
 
 		 249 aa  103  5e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0618  ABC-3 protein  33.07 
 
 		 286 aa  103  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.087201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3309  ABC-3 protein  34.87 
 
 		 262 aa  100  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.224275  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0566  ABC 3 transport family protein  33.86 
 
 		 259 aa  96.3  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3462  ABC-3 protein  33.98 
 
 		 259 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0567  ABC-3 protein  33.98 
 
 		 255 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0568  ABC-3 protein  34.39 
 
 		 255 aa  95.5  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1547  ABC-3 protein  28.57 
 
 		 249 aa  95.5  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000363711  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3515  ABC-3 protein  33.76 
 
 		 261 aa  95.5  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0529  hypothetical protein  31.91 
 
 		 263 aa  93.6  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00670346  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0449  ABC-3 protein  35.14 
 
 		 263 aa  90.5  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.856508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3714  ABC-3 protein  32.68 
 
 		 263 aa  89  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0390511  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2539  zinc/manganese transport system permease protein  37.5 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.421777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3923  ABC-3 protein  34.23 
 
 		 266 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00893533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3740  ABC-3 protein  34.23 
 
 		 266 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06464  hypothetical protein  27.76 
 
 		 264 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3797  ABC-3 protein  34.23 
 
 		 266 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.48799  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0528  ABC-3 protein  33.85 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000497802  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000604  zinc ABC transporter permease protein ZnuB  27.98 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000103291  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1537  ABC-3 protein  32.02 
 
 		 279 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356842  normal  0.594974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  28.91 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2617  ABC-3 protein  27.22 
 
 		 312 aa  53.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.60645 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  30.29 
 
 		 281 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  25.28 
 
 		 280 aa  52.4  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1913  ABC-3 protein  27.23 
 
 		 280 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0335  ABC-3 protein  26.34 
 
 		 283 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0205271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1010  ABC-3 protein  27.89 
 
 		 288 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1532  ABC-3 protein  29.35 
 
 		 280 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  24.67 
 
 		 287 aa  47.8  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  27.05 
 
 		 279 aa  47.8  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11121  hypothetical protein  27.83 
 
 		 284 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.314432 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5318  ABC-3 protein  29.02 
 
 		 285 aa  47  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  23.21 
 
 		 278 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3921  ABC-3 protein  29.41 
 
 		 296 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.200349 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  23.21 
 
 		 278 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0037  cation ABC transporter, permease protein  24.85 
 
 		 269 aa  45.4  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  25 
 
 		 272 aa  45.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  25.89 
 
 		 280 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004108  zinc ABC transporter permease protein ZnuB  29.89 
 
 		 261 aa  43.9  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1197  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 273 aa  43.9  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620873  normal  0.0904555 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1627  ABC-3 protein  29.85 
 
 		 280 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  33.01 
 
 		 300 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4803  ABC-3 protein  29.78 
 
 		 288 aa  43.5  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4717  hypothetical protein  29.78 
 
 		 288 aa  43.5  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  24.71 
 
 		 312 aa  43.5  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5102  ABC-3 protein  29.78 
 
 		 288 aa  43.1  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593949  normal  0.159747 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>