79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0470 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0470  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  242  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0242594 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1630  putative transcriptional regulator  91.67 
 
 		 120 aa  228  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.917024  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4544  hypothetical protein  77.88 
 
 		 156 aa  176  9e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.234964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4062  hypothetical protein  79.09 
 
 		 147 aa  174  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4430  hypothetical protein  84.16 
 
 		 147 aa  174  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7857  hypothetical protein  77.36 
 
 		 126 aa  170  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739073  normal  0.172696 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0060  regulatory protein, ArsR  73.68 
 
 		 126 aa  166  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0803  hypothetical protein  75.7 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.80068 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2689  putative transcriptional regulator  79 
 
 		 126 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.515825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3137  hypothetical protein  64.96 
 
 		 127 aa  164  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.581839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1598  putative PAS/PAC sensor protein  38.14 
 
 		 326 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2579  transcriptional regulator  34.41 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0422  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 99 aa  71.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1698  transcriptional regulator  38.95 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354656  normal  0.781335 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4890  putative transcriptional regulator  35.87 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.040811  normal  0.40753 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1184  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1018  putative PAS/PAC sensor protein  41.84 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.377599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0230  putative PAS/PAC sensor protein  35.79 
 
 		 325 aa  67.4  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0081  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  36.54 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2811  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 99 aa  67  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3014  transcriptional regulator, MarR/EmrR family  36.96 
 
 		 98 aa  67  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0765911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4102  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404387  normal  0.0188241 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1028  putative PAS/PAC sensor protein  35 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0710  transcriptional regulator, ArsR family  42.7 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1252  putative PAS/PAC sensor protein  32.98 
 
 		 303 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1682  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.51 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0239  hypothetical protein  30.43 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15068  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0611  transcriptional regulator, MarR/EmrR family  39.05 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254501 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1413  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.946834  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1247  putative PAS/PAC sensor protein  33.68 
 
 		 327 aa  63.9  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.977121  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1862  hypothetical protein  37.23 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361874  normal  0.015188 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4596  hypothetical protein  41.49 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0505761  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0308  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  36.96 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.762623 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1165  hypothetical protein  37.5 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2593  hypothetical protein  37.08 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1300  transcriptional regulator  38.2 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.223469  normal  0.471432 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1426  hypothetical protein  37.21 
 
 		 119 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0952  hypothetical protein  34.88 
 
 		 115 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.411513 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3477  MarR/EmrR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2225  hypothetical protein  37.18 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000123017 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4065  hypothetical protein  39.56 
 
 		 120 aa  57  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.686189  normal  0.326424 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3450  hypothetical protein  36.46 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0889  putative transcriptional regulator  29.79 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343594  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2000  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5191  putative transcriptional regulator  45 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0331978  normal  0.592256 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1114  regulatory protein MarR  34.95 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0481626  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36190  hypothetical protein  36.84 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4140  hypothetical protein  36.96 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.609006 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0592  transcriptional regulator, ArsR family  34.65 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.751987 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1599  ArsR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 103 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.556289  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0548  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 97 aa  50.4  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0542842  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2840  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0562  putative PAS/PAC sensor protein  34.48 
 
 		 332 aa  50.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0139  transcriptional regulator  29.73 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1486  hypothetical protein  27.88 
 
 		 104 aa  48.9  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0003803  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5349  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  30.21 
 
 		 103 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.399116 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4026  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  47.8  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.252958 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1352  transcriptional regulator, ArsR family  36.92 
 
 		 101 aa  47  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.182081  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0328  ArsR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.018451 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0771  hypothetical protein  39.68 
 
 		 95 aa  47  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0125  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6424  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  34.83 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4271  hypothetical protein  35.94 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350717  normal  0.351031 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2191  regulatory protein, ArsR  34.44 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1413  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  29.7 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22783  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30320  hypothetical protein  40 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0184  regulatory protein, ArsR  28.41 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.678955  normal  0.871584 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5266  transcriptional regulator, ArsR family  41.82 
 
 		 368 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 167 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3521  ArsR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 368 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 187 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 168 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 185 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 186 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4893  regulatory protein ArsR  34.29 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 204 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>