35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0771 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0771  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  194  4.0000000000000005e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3477  MarR/EmrR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0308  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  34.74 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.762623 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4102  transcriptional regulator  35.79 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404387  normal  0.0188241 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0548  transcriptional regulator  39.56 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0542842  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1682  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.06 
 
 		 117 aa  51.6  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0081  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  32.18 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1114  regulatory protein MarR  35.8 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0481626  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2593  hypothetical protein  33.71 
 
 		 104 aa  49.7  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4065  hypothetical protein  40.23 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.686189  normal  0.326424 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36190  hypothetical protein  35.79 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0470  hypothetical protein  39.68 
 
 		 120 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0242594 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0710  transcriptional regulator, ArsR family  37.33 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2542  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  33.33 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0791599  normal  0.380837 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0952  hypothetical protein  30.95 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.411513 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5191  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0331978  normal  0.592256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7857  hypothetical protein  39.68 
 
 		 126 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739073  normal  0.172696 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1300  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.223469  normal  0.471432 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1630  putative transcriptional regulator  36.51 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.917024  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0125  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1426  hypothetical protein  31.71 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1018  putative PAS/PAC sensor protein  33.75 
 
 		 332 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.377599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4140  hypothetical protein  31.03 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.609006 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1599  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.556289  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0060  regulatory protein, ArsR  36.51 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1252  putative PAS/PAC sensor protein  32.53 
 
 		 303 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12100  hypothetical protein  35.16 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4026  hypothetical protein  32.47 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.252958 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1165  hypothetical protein  31.71 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2689  putative transcriptional regulator  36.51 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.515825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4544  hypothetical protein  36.51 
 
 		 156 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.234964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1413  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  31.58 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22783  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2225  hypothetical protein  35.29 
 
 		 89 aa  40.4  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000123017 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4062  hypothetical protein  32.26 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4430  hypothetical protein  32.26 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>