16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0184 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0184  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 107 aa  213  9e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.678955  normal  0.871584 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0328  ArsR family transcriptional regulator  95.33 
 
 		 107 aa  205  1e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.018451 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0188  ArsR family transcriptional regulator  83.72 
 
 		 86 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.54087 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2840  transcriptional regulator, ArsR family  44.21 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1352  transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.182081  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1630  putative transcriptional regulator  28.41 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.917024  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0239  hypothetical protein  26.97 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15068  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0470  hypothetical protein  28.41 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0242594 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2689  putative transcriptional regulator  28.41 
 
 		 126 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.515825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2579  transcriptional regulator  22.83 
 
 		 99 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3014  transcriptional regulator, MarR/EmrR family  22.99 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0765911 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7857  hypothetical protein  28.72 
 
 		 126 aa  40.8  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739073  normal  0.172696 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0916  transcriptional regulator, HxlR family  32.14 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4890  putative transcriptional regulator  24.18 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.040811  normal  0.40753 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0504  transcriptional regulator, TrmB  36.73 
 
 		 176 aa  40.4  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.21026 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1374  hypothetical protein  46.51 
 
 		 169 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508752  normal  0.0176648 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>