More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0338 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0338  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 		 323 aa  661    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0334  exopolyphosphatase  43.73 
 
 		 307 aa  253  3e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1628  exopolyphosphatase  41.83 
 
 		 326 aa  246  4.9999999999999997e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0205  Ppx/GppA phosphatase  42.39 
 
 		 312 aa  244  9.999999999999999e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0244  exopolyphosphatase  42.35 
 
 		 321 aa  232  5e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2578  Ppx/GppA phosphatase  34.97 
 
 		 506 aa  179  8e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  33.87 
 
 		 507 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  33.66 
 
 		 502 aa  162  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  29.61 
 
 		 501 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2105  Ppx/GppA phosphatase  31.43 
 
 		 497 aa  152  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000081594  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1953  Ppx/GppA phosphatase  32.48 
 
 		 491 aa  145  8.000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  27.41 
 
 		 500 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  28.01 
 
 		 500 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1634  Ppx/GppA phosphatase family protein  25.99 
 
 		 502 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.505763  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1916  Ppx/GppA phosphatase family protein  25.99 
 
 		 502 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.050324  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0972  Ppx/GppA phosphatase  30.49 
 
 		 520 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4919  Ppx/GppA phosphatase  31.56 
 
 		 494 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434852  normal  0.382877 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  29.13 
 
 		 305 aa  123  4e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  26.54 
 
 		 513 aa  122  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  27.83 
 
 		 513 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2046  exopolyphosphatase  23.47 
 
 		 510 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.941152  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3848  Ppx/GppA phosphatase  31.07 
 
 		 499 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3457  Ppx/GppA phosphatase  30.6 
 
 		 501 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.15102  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0316  exopolyphosphatase  28.66 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  27.51 
 
 		 510 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2951  Ppx/GppA phosphatase  30.19 
 
 		 501 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2114  Ppx/GppA phosphatase  29.87 
 
 		 503 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.21968  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0493  Ppx/GppA phosphatase  28.39 
 
 		 301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2448  Ppx/GppA phosphatase  27.1 
 
 		 311 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2032  Ppx/GppA phosphatase  31.73 
 
 		 505 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.939596  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1593  Ppx/GppA phosphatase  28.66 
 
 		 529 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0661  Ppx/GppA phosphatase  28.48 
 
 		 489 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2330  Ppx/GppA phosphatase  30.82 
 
 		 501 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  27.51 
 
 		 511 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2625  Ppx/GppA phosphatase  30.77 
 
 		 506 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1205  Ppx/GppA phosphatase  30.13 
 
 		 512 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3616  Ppx/GppA phosphatase  29.52 
 
 		 526 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000501756 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2062  exopolyphosphatase, putative  26.77 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3325  Ppx/GppA phosphatase  28.66 
 
 		 498 aa  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.855451  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2850  Ppx/GppA phosphatase  31.31 
 
 		 503 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.542299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  26.59 
 
 		 570 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0495  Ppx/GppA phosphatase  28.25 
 
 		 517 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.813676 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2159  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  30.28 
 
 		 510 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.990751  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  29.5 
 
 		 549 aa  110  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  26.92 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0173  Ppx/GppA family phosphatase  29.01 
 
 		 330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2493  Ppx/GppA phosphatase  30.52 
 
 		 501 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.170096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2209  Ppx/GppA phosphatase  28.78 
 
 		 520 aa  110  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0131  Ppx/GppA phosphatase  31.07 
 
 		 499 aa  109  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1274  Ppx/GppA phosphatase  31 
 
 		 509 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635217  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0423  exopolyphosphatase, putative  28.25 
 
 		 519 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0256  exopolyphosphatase  27.25 
 
 		 500 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0394  hypothetical protein  29.71 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000322771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2160  Ppx/GppA phosphatase  28.3 
 
 		 509 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7415  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2249  Ppx/GppA phosphatase  29.94 
 
 		 499 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2018  Ppx/GppA phosphatase  30.03 
 
 		 512 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2876  exopolyphosphatase  29.08 
 
 		 513 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2753  Ppx/GppA phosphatase  29.97 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0232  Ppx/GppA phosphatase  28.71 
 
 		 488 aa  107  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0039  Ppx/GppA phosphatase  29.32 
 
 		 499 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.935227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4099  Ppx/GppA phosphatase family protein  27.24 
 
 		 524 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1955  Ppx/GppA phosphatase  27.58 
 
 		 523 aa  107  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3752  exopolyphosphatase, Ppx/GppA phosphatase  28.62 
 
 		 512 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319626  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1710  Ppx/GppA phosphatase  29.72 
 
 		 512 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00230463  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0404  Ppx/GppA phosphatase  26.84 
 
 		 505 aa  107  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2310  Ppx/GppA phosphatase  30.61 
 
 		 506 aa  107  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.100906  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2137  Ppx/GppA phosphatase  31.25 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00893545  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4044  Ppx/GppA phosphatase family protein  27.69 
 
 		 512 aa  106  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.133134  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3904  Ppx/GppA phosphatase family protein  28.62 
 
 		 512 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3736  exopolyphosphatase, Ppx/GppA phosphatase  28.62 
 
 		 512 aa  106  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.249397  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4209  Ppx/GppA phosphatase family protein  28.62 
 
 		 512 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4011  Ppx/GppA phosphatase family protein  28.62 
 
 		 512 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  26.88 
 
 		 539 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02394  exopolyphosphatase  28.76 
 
 		 513 aa  106  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.708213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1167  Ppx/GppA phosphatase  28.76 
 
 		 513 aa  106  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02356  hypothetical protein  28.76 
 
 		 513 aa  106  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1166  Ppx/GppA phosphatase  28.53 
 
 		 446 aa  106  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3725  exopolyphosphatase  28.76 
 
 		 513 aa  106  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.282301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2177  Ppx/GppA phosphatase  28.53 
 
 		 510 aa  106  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2785  exopolyphosphatase  28.76 
 
 		 513 aa  106  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.887367  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1174  exopolyphosphatase  28.76 
 
 		 513 aa  106  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0153917 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2650  exopolyphosphatase  28.76 
 
 		 513 aa  106  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0501  Ppx/GppA phosphatase  26.77 
 
 		 519 aa  106  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1303  Ppx/GppA phosphatase  30.13 
 
 		 513 aa  106  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1593  Ppx/GppA phosphatase  30.13 
 
 		 513 aa  106  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.229117  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0022  Ppx/GppA phosphatase  26.42 
 
 		 321 aa  105  7e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2549  Ppx/GppA phosphatase  29.45 
 
 		 495 aa  105  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2821  Ppx/GppA phosphatase  28.05 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0569  exopolyphosphatase  29.48 
 
 		 504 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.769517  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0789  exopolyphosphatase  29.48 
 
 		 504 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0583  exopolyphosphatase  29.48 
 
 		 504 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.968524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1493  Ppx/GppA phosphatase family protein  29.48 
 
 		 504 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.985254  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1627  exopolyphosphatase  29.48 
 
 		 504 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1140  Ppx/GppA phosphatase family protein  26.69 
 
 		 524 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1524  Ppx/GppA phosphatase family protein  29.48 
 
 		 504 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1279  Ppx/GppA phosphatase  29.18 
 
 		 504 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223089  normal  0.967623 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1301  exopolyphosphatase  29.48 
 
 		 504 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0827  Ppx/GppA phosphatase  29.18 
 
 		 504 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1120  Ppx/GppA phosphatase  26.43 
 
 		 506 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1308  Ppx/GppA phosphatase  29.18 
 
 		 504 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.56704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>