More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0213 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
297 aa  605  9.999999999999999e-173  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  57.09 
 
 
295 aa  331  8e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  53.1 
 
 
290 aa  308  5e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  53.31 
 
 
290 aa  299  4e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  49.66 
 
 
294 aa  292  5e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  49.32 
 
 
292 aa  278  7e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  49.65 
 
 
291 aa  276  4e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  49.65 
 
 
293 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  49.3 
 
 
292 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  50 
 
 
292 aa  265  7e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  50 
 
 
292 aa  265  8e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  50 
 
 
292 aa  265  8e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  50 
 
 
292 aa  265  8e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  50 
 
 
292 aa  265  8e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  50 
 
 
292 aa  265  8e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  50 
 
 
292 aa  265  8e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  50 
 
 
292 aa  265  8e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  50 
 
 
292 aa  264  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  50 
 
 
292 aa  264  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0208  dimethyladenosine transferase  48.51 
 
 
298 aa  264  2e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000398679  normal  0.017695 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  46.1 
 
 
296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0514  dimethyladenosine transferase  47.04 
 
 
297 aa  253  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00510308  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0527  dimethyladenosine transferase  47.04 
 
 
297 aa  253  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0439475  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  43.49 
 
 
293 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  44.41 
 
 
284 aa  237  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  43.25 
 
 
290 aa  232  6e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  39.58 
 
 
305 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0171  dimethyladenosine transferase  39.86 
 
 
290 aa  219  5e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  41.11 
 
 
288 aa  216  5e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  40.7 
 
 
301 aa  212  4.9999999999999996e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  38.71 
 
 
280 aa  206  3e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000452453  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  40.75 
 
 
299 aa  206  4e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  39.36 
 
 
285 aa  202  5e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  39.36 
 
 
285 aa  202  5e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  37.89 
 
 
284 aa  199  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2047  dimethyladenosine transferase  38.6 
 
 
276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0069  dimethyladenosine transferase  41.13 
 
 
273 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000661842  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0053  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  38.36 
 
 
294 aa  188  8e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000057406  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4477  dimethyladenosine transferase  41.18 
 
 
273 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl005  dimethyladenosine transferase  39.48 
 
 
267 aa  187  2e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0046  dimethyladenosine transferase  34.36 
 
 
302 aa  186  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2111  dimethyladenosine transferase  40.21 
 
 
297 aa  186  4e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  40.27 
 
 
276 aa  186  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  40.07 
 
 
268 aa  185  8e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  36.71 
 
 
291 aa  185  9e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1492  dimethyladenosine transferase  36.62 
 
 
279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4416  dimethyladenosine transferase  40.73 
 
 
272 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  36.88 
 
 
275 aa  183  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  38.87 
 
 
275 aa  183  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4480  dimethyladenosine transferase  40.36 
 
 
272 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3810  dimethyladenosine transferase  38.83 
 
 
277 aa  182  8.000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  38.85 
 
 
279 aa  181  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1329  dimethyladenosine transferase  38.85 
 
 
260 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000282219  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  37.01 
 
 
276 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1357  dimethyladenosine transferase  38.49 
 
 
260 aa  176  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000735455  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4886  dimethyladenosine transferase  37.82 
 
 
271 aa  177  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00215913  hitchhiker  0.00477797 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1935  dimethyladenosine transferase  38.18 
 
 
275 aa  176  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  39.79 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2288  dimethyladenosine transferase  37.37 
 
 
275 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0633  dimethyladenosine transferase  38.38 
 
 
277 aa  172  5e-42  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0404  dimethyladenosine transferase  36.86 
 
 
291 aa  172  5e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0513  dimethyladenosine transferase  35.06 
 
 
273 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0920  dimethyladenosine transferase  37.31 
 
 
282 aa  172  5.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1537  dimethyladenosine transferase  36.04 
 
 
275 aa  172  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.22522  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0383  dimethyladenosine transferase  36.69 
 
 
291 aa  171  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  37.04 
 
 
267 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  35.38 
 
 
266 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  36.26 
 
 
272 aa  170  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  37.04 
 
 
267 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  36.43 
 
 
271 aa  169  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  35.38 
 
 
266 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1612  dimethyladenosine transferase  36.43 
 
 
275 aa  169  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  35.02 
 
 
267 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  35.02 
 
 
267 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0456  dimethyladenosine transferase  35.42 
 
 
261 aa  169  7e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.45275  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_347  dimethyladenosine transferase  36.92 
 
 
291 aa  169  7e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  35.53 
 
 
276 aa  168  8e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  38.49 
 
 
261 aa  168  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  36.9 
 
 
262 aa  167  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4092  dimethyladenosine transferase  37.23 
 
 
288 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114953  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3343  dimethyladenosine transferase  33.57 
 
 
281 aa  167  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.281566 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  38.01 
 
 
268 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0897  dimethyladenosine transferase  38.03 
 
 
282 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00367265  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1193  dimethyladenosine transferase  36.7 
 
 
263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  37.41 
 
 
268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  36.57 
 
 
266 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1063  dimethyladenosine transferase  35.69 
 
 
275 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156992 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2833  dimethyladenosine transferase  36.84 
 
 
288 aa  166  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137486  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1513  dimethyladenosine transferase  36.49 
 
 
305 aa  166  5e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352212  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001665  dimethyladenosine transferase  35.06 
 
 
269 aa  166  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  37.13 
 
 
268 aa  166  5e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3485  dimethyladenosine transferase  37.77 
 
 
284 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362692  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  37.04 
 
 
268 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  36.5 
 
 
268 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1762  dimethyladenosine transferase  35.11 
 
 
275 aa  165  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  37.59 
 
 
262 aa  165  8e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  35.59 
 
 
297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  36.5 
 
 
268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  36.67 
 
 
268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  36.67 
 
 
268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>