More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0205 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0205  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 
312 aa  635    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0244  exopolyphosphatase  45.66 
 
 
321 aa  273  3e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0334  exopolyphosphatase  46.91 
 
 
307 aa  271  1e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1628  exopolyphosphatase  44.05 
 
 
326 aa  267  2e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0338  Ppx/GppA phosphatase  42.39 
 
 
323 aa  244  9.999999999999999e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2578  Ppx/GppA phosphatase  34.74 
 
 
506 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  35.53 
 
 
502 aa  185  8e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  32.78 
 
 
507 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1953  Ppx/GppA phosphatase  33.99 
 
 
491 aa  177  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  32.67 
 
 
501 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  32 
 
 
500 aa  165  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  33.01 
 
 
501 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  31.33 
 
 
500 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  32.34 
 
 
502 aa  158  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2105  Ppx/GppA phosphatase  31.17 
 
 
497 aa  153  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000081594  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1634  Ppx/GppA phosphatase family protein  26.9 
 
 
502 aa  152  7e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.505763  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1916  Ppx/GppA phosphatase family protein  26.9 
 
 
502 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.050324  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0090  Ppx/GppA phosphatase  32.89 
 
 
288 aa  146  6e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0501  Ppx/GppA phosphatase  30.35 
 
 
519 aa  145  8.000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  29.45 
 
 
513 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2046  exopolyphosphatase  25.73 
 
 
510 aa  142  8e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.941152  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  29.9 
 
 
301 aa  136  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0972  Ppx/GppA phosphatase  29 
 
 
520 aa  136  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  31.67 
 
 
513 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0423  exopolyphosphatase, putative  29.41 
 
 
519 aa  132  5e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0231  Ppx/GppA phosphatase  31.01 
 
 
544 aa  131  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.448988 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  28.15 
 
 
305 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00540  Exopolyphosphatase  29.32 
 
 
305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000336687  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1684  exopolyphosphatase, putative  28.9 
 
 
514 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3616  Ppx/GppA phosphatase  30.45 
 
 
526 aa  129  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000501756 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0489  Ppx/GppA phosphatase  28.71 
 
 
527 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2394  exopolyphosphatase  28.53 
 
 
501 aa  127  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06591  putative exopolyphosphatase  30.77 
 
 
548 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2062  Ppx/GppA phosphatase  32.69 
 
 
303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0498  Ppx/GppA phosphatase  28.89 
 
 
521 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1993  Ppx/GppA phosphatase  29.43 
 
 
519 aa  126  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  31.31 
 
 
549 aa  125  7e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2062  Ppx/GppA phosphatase  33.88 
 
 
300 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0123  Ppx/GppA phosphatase  30.87 
 
 
296 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2696  Ppx/GppA phosphatase  27.33 
 
 
512 aa  124  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00554576  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0084  Ppx/GppA phosphatase  33.89 
 
 
321 aa  123  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.426171  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0810  Ppx/GppA phosphatase  31.31 
 
 
318 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2154  Ppx/GppA phosphatase  32.24 
 
 
300 aa  122  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4141  Ppx/GppA phosphatase  30.38 
 
 
557 aa  122  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3904  Ppx/GppA phosphatase family protein  27.52 
 
 
512 aa  122  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3736  exopolyphosphatase, Ppx/GppA phosphatase  27.52 
 
 
512 aa  122  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.249397  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4209  Ppx/GppA phosphatase family protein  27.52 
 
 
512 aa  122  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4011  Ppx/GppA phosphatase family protein  27.52 
 
 
512 aa  122  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1871  Ppx/GppA phosphatase  29.32 
 
 
497 aa  122  9e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.855928  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0226  Ppx/GppA phosphatase  32.97 
 
 
326 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000460775  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1033  Ppx/GppA phosphatase  27.71 
 
 
505 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35316  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  31.19 
 
 
545 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  31.19 
 
 
545 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4099  Ppx/GppA phosphatase family protein  28.09 
 
 
524 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4044  Ppx/GppA phosphatase family protein  27.52 
 
 
512 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.133134  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  30 
 
 
550 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3129  Ppx/GppA phosphatase  30.57 
 
 
311 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal  0.0109976 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0232  Ppx/GppA phosphatase  28.96 
 
 
488 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  28.57 
 
 
545 aa  119  4.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  30.16 
 
 
532 aa  119  6e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3752  exopolyphosphatase, Ppx/GppA phosphatase  27.18 
 
 
512 aa  119  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319626  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69220  exopolyphosphatase  28.53 
 
 
506 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5986  exopolyphosphatase  28.53 
 
 
501 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2467  Guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  29.39 
 
 
500 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  28.06 
 
 
501 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0592  Ppx/GppA phosphatase  29.35 
 
 
519 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05201  putative exopolyphosphatase  29.43 
 
 
531 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  28.48 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0404  Ppx/GppA phosphatase  27.91 
 
 
505 aa  117  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5216  Ppx/GppA phosphatase  28.3 
 
 
500 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5125  Ppx/GppA phosphatase  28.3 
 
 
500 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  26.54 
 
 
544 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  26.54 
 
 
544 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3823  Ppx/GppA phosphatase  27.42 
 
 
524 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1140  Ppx/GppA phosphatase family protein  27.09 
 
 
524 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137013  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1332  exopolyphosphatase  26.96 
 
 
511 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3600  Ppx/GppA phosphatase  30.63 
 
 
514 aa  116  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.446483 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1456  Ppx/GppA phosphatase  26.33 
 
 
553 aa  116  6e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.240113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0659  Ppx/GppA phosphatase  30.53 
 
 
367 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1516  Ppx/GppA phosphatase  30.25 
 
 
376 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219937  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  30.57 
 
 
570 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  28.34 
 
 
539 aa  115  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0454  Ppx/GppA phosphatase  27.74 
 
 
521 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.976943 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0245  phosphatase  30.16 
 
 
492 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075442  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3247  Ppx/GppA phosphatase  30.49 
 
 
311 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.559921 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2946  exopolyphosphatase  26.33 
 
 
511 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  28.43 
 
 
511 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2542  Ppx/GppA phosphatase  28.93 
 
 
533 aa  114  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0301  Ppx/GppA phosphatase  27.65 
 
 
500 aa  114  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3006  Ppx/GppA phosphatase  31.7 
 
 
512 aa  113  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.487592  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5249  exopolyphosphatase  27.74 
 
 
500 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  29.14 
 
 
513 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4116  Ppx/GppA phosphatase family protein  27.18 
 
 
511 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000884686  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1955  Ppx/GppA phosphatase  26.5 
 
 
523 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2278  Ppx/GppA phosphatase  28.93 
 
 
499 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5277  Ppx/GppA phosphatase  27.65 
 
 
500 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.835084  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5039  Ppx/GppA phosphatase  28.71 
 
 
500 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  28.09 
 
 
510 aa  112  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2876  exopolyphosphatase  28.12 
 
 
513 aa  112  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004382  exopolyphosphatase  27.33 
 
 
501 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>