More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3622 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3622  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 398 aa  788    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00095064 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4198  glycosyl transferase family protein  74.31 
 
 		 358 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.797946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3480  glycosyl transferase family protein  60.36 
 
 		 336 aa  399  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.324933 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1041  glycosyl transferase family 2  58.43 
 
 		 368 aa  389  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3095  glycosyl transferase family 2  56.48 
 
 		 341 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0404  glycosyl transferase family 2  56.45 
 
 		 320 aa  345  8.999999999999999e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0210127 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0228  glycosyl transferase, group 2 family protein  56.45 
 
 		 320 aa  345  8.999999999999999e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1772  putative glycosyltransferase transmembrane protein  48.4 
 
 		 347 aa  338  9.999999999999999e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.437602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0955  glycosyl transferase family 2  52.73 
 
 		 338 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1106  glycosyl transferase family 2  52.41 
 
 		 338 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263485  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0656  glycosyl transferase family protein  50.16 
 
 		 329 aa  317  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1411  glycosyltransferase transmembrane protein  51.6 
 
 		 302 aa  305  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  50.64 
 
 		 320 aa  291  2e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  44.52 
 
 		 320 aa  289  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0605  glycosyl transferase  45.81 
 
 		 310 aa  288  9e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  45.31 
 
 		 313 aa  288  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  46.9 
 
 		 342 aa  286  5e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  49.36 
 
 		 320 aa  284  2.0000000000000002e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  43.31 
 
 		 320 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0689  glycosyl transferase family protein  46.28 
 
 		 312 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0464  glycosyl transferase  45.95 
 
 		 310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0635  glycosyl transferase family 2  45.4 
 
 		 310 aa  280  3e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  42.26 
 
 		 320 aa  276  6e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  47.59 
 
 		 336 aa  275  9e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4237  glycosyl transferase family 2  49.52 
 
 		 337 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  hitchhiker  0.0000633175 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  43.08 
 
 		 324 aa  274  3e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  46.28 
 
 		 320 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  44.69 
 
 		 321 aa  274  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2203  glycosyl transferase family 2  45.31 
 
 		 315 aa  273  3e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  45.57 
 
 		 343 aa  272  8.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  45.48 
 
 		 320 aa  272  9e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  46.06 
 
 		 343 aa  268  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  48.08 
 
 		 314 aa  268  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1671  glycosyl transferase family 2  43.37 
 
 		 310 aa  268  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000135664  normal  0.123031 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  47.44 
 
 		 314 aa  266  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  43.45 
 
 		 344 aa  265  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  41.75 
 
 		 324 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4382  glycosyl transferase family 2  46.62 
 
 		 336 aa  262  6e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4444  glycosyl transferase family 2  46.62 
 
 		 336 aa  262  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  47.27 
 
 		 337 aa  261  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  41.72 
 
 		 319 aa  258  1e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4415  glycosyl transferase family protein  48.3 
 
 		 339 aa  256  4e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0445  glycosyl transferase family 2  42.77 
 
 		 334 aa  256  4e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2657  family 2 glycosyl transferase  46.77 
 
 		 329 aa  255  8e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0623  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.87 
 
 		 316 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3834  glycosyl transferase family protein  46.79 
 
 		 314 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4095  glycosyl transferase family protein  46.77 
 
 		 335 aa  249  8e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  47.42 
 
 		 329 aa  248  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0153758 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2754  glycosyl transferase family 2  46.52 
 
 		 318 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.412494  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2585  glycosyl transferase family protein  45.81 
 
 		 316 aa  246  6e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0760  glycosyl transferase family protein  48.09 
 
 		 343 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.057751 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  43.57 
 
 		 568 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  40.13 
 
 		 332 aa  231  2e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2286  glycosyl transferase family protein  39.87 
 
 		 325 aa  230  4e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.398997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  40.89 
 
 		 314 aa  229  6e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  40.88 
 
 		 319 aa  229  6e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  39.32 
 
 		 312 aa  224  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3114  glycosyl transferase family protein  38.68 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.482779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2496  glycosyltransferase  36.54 
 
 		 313 aa  217  4e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00712188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2023  glycosyl transferase family 2  34.67 
 
 		 314 aa  213  4.9999999999999996e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11238  putative glycosyltransferase  33.99 
 
 		 317 aa  211  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2281  glycosyl transferase family 2  39.67 
 
 		 337 aa  205  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0390263  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1158  glycosyl transferase family 2  38.61 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1340  glycosyl transferase family protein  37.75 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275627  normal  0.171595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3117  glycosyl transferase family 2  34.01 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3181  glycosyl transferase family 2  33.22 
 
 		 318 aa  202  8e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0111  glycosyl transferase family protein  33 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375009  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1703  glycosyl transferase family 2  37.27 
 
 		 331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1980  glycosyl transferase family protein  38.69 
 
 		 323 aa  201  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5120  glycosyl transferase family 2  33.12 
 
 		 323 aa  199  7e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2410  glycosyl transferase family 2  35.18 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.488157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6420  glycosyl transferase family 2  42.12 
 
 		 333 aa  197  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880852  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.44 
 
 		 317 aa  196  8.000000000000001e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1880  glycosyl transferase family 2  35.92 
 
 		 325 aa  192  7e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00309208 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  38.26 
 
 		 331 aa  191  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  39.34 
 
 		 328 aa  188  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1792  b-glycosyltransferase  31.92 
 
 		 324 aa  186  6e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.794906 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3770  b-glycosyltransferase  32.59 
 
 		 331 aa  186  7e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0280  glycosyl transferase family 2  35.46 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2155  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  33.44 
 
 		 326 aa  162  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4016  glycosyl transferase family 2  34.08 
 
 		 326 aa  162  8.000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2408  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  33.12 
 
 		 322 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2145  glycosyl transferase family 2  40.97 
 
 		 249 aa  162  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0368252 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2549  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.81 
 
 		 322 aa  161  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3690  glycosyl transferase family 2  38.43 
 
 		 234 aa  161  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.349905  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02180  undecaprenyl phosphate-L-Ara4FN transferase  32.81 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1404  glycosyl transferase family 2  32.81 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2399  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.81 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.911848  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.81 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02139  hypothetical protein  32.81 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.81 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2642  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  33.03 
 
 		 327 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2078  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  33.97 
 
 		 327 aa  160  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2842  glycosyl transferase family protein  33.53 
 
 		 340 aa  159  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1596  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.04 
 
 		 240 aa  159  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2526  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.72 
 
 		 327 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2538  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.72 
 
 		 327 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2434  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.72 
 
 		 327 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2483  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.02 
 
 		 327 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1413  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.274131 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>