263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3618 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3618  Mg2 transporter protein CorA family protein  100 
 
 		 362 aa  724    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000031468 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4020  Mg2 transporter protein CorA family protein  62.97 
 
 		 344 aa  381  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0613  Mg2+ transporter protein, CorA-like  57.52 
 
 		 346 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715831  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2765  Mg2+ transporter protein, CorA-like  55.33 
 
 		 345 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5383  Mg2 transporter protein CorA family protein  55.59 
 
 		 361 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.600829 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6749  Mg2 transporter protein CorA family protein  55.16 
 
 		 345 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0549  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  55.98 
 
 		 362 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.147987 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0226  CorA family protein  53.12 
 
 		 336 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0933777  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0057  Mg2+/Co2+ transporter  53.12 
 
 		 336 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1732  Mg2+ and Co2+ transporters  53.12 
 
 		 336 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1067  CorA family protein  53.12 
 
 		 340 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0361  Mg2+/Co2+ transporter  53.12 
 
 		 340 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1643  Mg2+/Co2+ transporter  53.12 
 
 		 340 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1224  Mg2+/Co2+ transporter  53.12 
 
 		 340 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.297825  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0396  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  51.93 
 
 		 342 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0423  Mg2 transporter protein CorA family protein  51.63 
 
 		 357 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.515411 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3048  Mg2 transporter protein CorA family protein  59.4 
 
 		 347 aa  353  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0102286  normal  0.474894 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3578  Mg2+ transporter protein, CorA-like  52.52 
 
 		 372 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40270  putative cation transporter  54.52 
 
 		 340 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0611519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0748  Mg2 transporter protein CorA family protein  55.42 
 
 		 339 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0462  Mg2 transporter protein CorA family protein  51.34 
 
 		 342 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.939947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2617  Mg2+ transporter protein, CorA-like  51.04 
 
 		 342 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200035  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0488  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  51.04 
 
 		 342 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2904  Mg2 transporter protein CorA family protein  51.04 
 
 		 370 aa  345  8e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.407019  normal  0.898383 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1774  Mg2+ transporter protein, CorA-like  51.99 
 
 		 355 aa  342  7e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4318  Mg2+ transporter protein, CorA-like  53.01 
 
 		 340 aa  339  4e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1851  Mg2 transporter protein CorA family protein  50 
 
 		 342 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0103716 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04870  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  54.52 
 
 		 339 aa  339  5.9999999999999996e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3701  cation transporter, putative  51.46 
 
 		 339 aa  336  5e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2558  Mg2 transporter protein CorA family protein  47.93 
 
 		 342 aa  287  2.9999999999999996e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1906  Mg2+/Co+2/Zn+2 transporter, CorA-like  43.15 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2415  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.71 
 
 		 328 aa  202  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0770496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1621  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  33 
 
 		 336 aa  157  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0018  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.94 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000124809  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2621  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  30.18 
 
 		 324 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.533199  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0125  magnesium transporter, putative  25.99 
 
 		 322 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2530  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  27.24 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783252 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2830  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  23.91 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.689102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0457  Mg2 transporter protein CorA family protein  32.62 
 
 		 345 aa  126  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3533  hypothetical protein  27.7 
 
 		 332 aa  126  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115882  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0935  Mg2+ transporter protein, CorA-like  26.15 
 
 		 327 aa  124  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785343  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3316  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.21 
 
 		 331 aa  124  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2609  zinc transporter  24.22 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.590272 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2010  Mg2 transporter protein CorA family protein  32 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.313618 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1736  Mg2+ transporter protein, CorA-like  29.2 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0741818 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41630  putative cytoplasmic membrane-associated protein  27.03 
 
 		 332 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0554  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.19 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.836799 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1773  Mg2+ transporter protein, CorA-like  26.98 
 
 		 331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5567  Mg2 transporter protein CorA family protein  32.39 
 
 		 356 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1772  zinc transporter  23.43 
 
 		 327 aa  115  7.999999999999999e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2295  cmaX protein  26.53 
 
 		 331 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00916865  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2600  zinc transporter  22.81 
 
 		 327 aa  112  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1799  zinc transporter  22.11 
 
 		 327 aa  112  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0599  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.19 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0357357  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2318  zinc transporter  22.46 
 
 		 327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1907  zinc transporter  22.11 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.250715  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2390  zinc transporter  22.11 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.536189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0985  divalent cation transporter  26.46 
 
 		 331 aa  110  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1737  zinc transporter  23.44 
 
 		 323 aa  110  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2093  Mg2+ transporter protein, CorA-like  26.8 
 
 		 331 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420798 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1498  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  27.17 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4137  Mg2 transporter protein CorA family protein  22.71 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000182664  hitchhiker  0.000000000148264 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3838  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.02 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000270616  hitchhiker  0.000568378 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1603  Mg2 transporter protein CorA family protein  27 
 
 		 331 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261111  decreased coverage  0.000000000150807 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3656  Mg2 transporter protein CorA family protein  22.66 
 
 		 321 aa  106  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000861188  hitchhiker  0.00000222917 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3715  Mg2 transporter protein CorA family protein  22.66 
 
 		 325 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000111951  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0790  Mg2+ transporter  22.66 
 
 		 325 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000404579  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4248  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.28 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0618  Mg2 transporter protein, CorA family protein  26.62 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152241  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1596  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.42 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180854  normal  0.0212568 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2144  zinc transporter  21.75 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.932831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1278  Mg2+ transporter protein, CorA-like  28.47 
 
 		 347 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0707161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2647  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  21.18 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0681  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  23.29 
 
 		 330 aa  100  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3655  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  26.09 
 
 		 331 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561597  normal  0.899414 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01319  zinc transporter  22.46 
 
 		 327 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2302  Mg2 transporter protein CorA family protein  22.46 
 
 		 327 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0640484  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2085  cmaX protein  26.09 
 
 		 332 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10467  normal  0.016656 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1556  zinc transporter  22.46 
 
 		 327 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1780  zinc transporter  22.46 
 
 		 327 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.81394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01329  hypothetical protein  22.46 
 
 		 327 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1990  zinc transporter  22.46 
 
 		 327 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.983964 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1459  zinc transporter  22.46 
 
 		 327 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2283  zinc transporter  22.46 
 
 		 327 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.322724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1587  zinc transporter  22.46 
 
 		 327 aa  99.8  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2088  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  28.73 
 
 		 328 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3367  Mg2 transporter protein, CorA family protein  24.1 
 
 		 325 aa  99  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00335371  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1780  zinc transporter  21.75 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0977223 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1496  zinc transporter  21.75 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1678  zinc transporter  21.75 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.284877  normal  0.0898182 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1840  zinc transporter  21.75 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1777  zinc transporter  21.75 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.342474  normal  0.102835 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0552  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.08 
 
 		 321 aa  98.2  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114827  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0655  Mg2 transporter protein, CorA family protein  23.96 
 
 		 325 aa  97.8  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000194891  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2126  hypothetical protein  25.96 
 
 		 375 aa  97.1  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3984  magnesium transporter, putative  23.94 
 
 		 321 aa  95.5  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0654  Mg2 transporter protein, CorA family protein  23.74 
 
 		 325 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000466682  normal  0.097367 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0715  Mg2+ transporter protein, CorA-like  26.83 
 
 		 346 aa  91.3  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2908  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  24.49 
 
 		 321 aa  91.7  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000151397  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3665  Mg2+ transporter protein, CorA-like  24.42 
 
 		 329 aa  90.5  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00199439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>