More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2958 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2958  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 211 aa  429  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0995  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.56 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1991  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.07 
 
 		 206 aa  228  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175013  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2166  Glutathione S-transferase domain protein  54.59 
 
 		 208 aa  228  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193029  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1955  Glutathione S-transferase domain  54.11 
 
 		 208 aa  221  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0193951  normal  0.329521 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.73 
 
 		 205 aa  218  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2778  glutathione S-transferase-like protein  50.24 
 
 		 211 aa  210  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.910721 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0897  glutathione S-transferase  54.64 
 
 		 210 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1911  glutathione S-transferase  50.25 
 
 		 207 aa  209  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4394  Glutathione S-transferase domain  54.5 
 
 		 213 aa  208  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2556  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.64 
 
 		 210 aa  207  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.55 
 
 		 213 aa  205  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.519007  normal  0.381422 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4505  Glutathione S-transferase domain  55.38 
 
 		 213 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal  0.527562 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2090  glutathione S-transferase domain-containing protein  50 
 
 		 227 aa  191  6e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2889  glutathione S-transferase-like  46.01 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.737778  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.42 
 
 		 200 aa  167  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5702  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.07 
 
 		 214 aa  161  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.366134  normal  0.106893 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1820  glutathione S-transferase-like protein  40.8 
 
 		 201 aa  149  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.631165 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.84 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0031  glutathione S-transferase  42.71 
 
 		 198 aa  139  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0537  Glutathione S-transferase domain  38.76 
 
 		 222 aa  138  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4826  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.21 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3512  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0524  Glutathione S-transferase domain protein  39.38 
 
 		 222 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0039  glutathione S-transferase-like  42.71 
 
 		 198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2508  Glutathione S-transferase domain  39.29 
 
 		 214 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3564  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.58 
 
 		 211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.146055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3382  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.21 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485104  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0607  putative glutathione S-transferase protein  37.2 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1699  Glutathione S-transferase domain protein  38.14 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3695  Glutathione S-transferase domain  36.27 
 
 		 215 aa  125  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0434501  hitchhiker  0.00000154046 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5220  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.62 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0962693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  37.62 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0065  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.83 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  37.5 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  37.62 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1358  Glutathione S-transferase domain  37.19 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1689  glutathione S-transferase-like  33.83 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0144  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.78 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6685  glutathione S-transferase  33 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0145  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.82 
 
 		 203 aa  104  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.397548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4186  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.76 
 
 		 202 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.367804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6295  glutathione S-transferase-like protein  33.33 
 
 		 204 aa  99  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0039  glutathione S-transferase-like protein  32.68 
 
 		 218 aa  98.2  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2329  glutathione S-transferase-like  34.65 
 
 		 204 aa  98.2  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209551  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2943  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.65 
 
 		 204 aa  98.2  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2964  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.65 
 
 		 204 aa  97.8  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.16 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0243  glutathione S-transferase-like  32.21 
 
 		 220 aa  97.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0539  Glutathione S-transferase domain protein  33.65 
 
 		 224 aa  96.7  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333365  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.3 
 
 		 202 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  30.3 
 
 		 202 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2477  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.55 
 
 		 201 aa  94.7  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2937  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.17 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2967  glutathione S-transferase-like protein  32.04 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3767  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.59 
 
 		 222 aa  92.4  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.08 
 
 		 202 aa  92.4  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2990  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.17 
 
 		 204 aa  92  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.63 
 
 		 207 aa  91.7  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2594  glutathione S-transferase  34.5 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.287653  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2223  Glutathione S-transferase domain  34.5 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.809628  normal  0.501649 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.44 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0359  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.53 
 
 		 201 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00589351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2853  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.67 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5977  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.16 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2200  glutathione S-transferase-like  32.67 
 
 		 216 aa  89.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.44 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0074  glutathione S-transferase  32.46 
 
 		 203 aa  88.6  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3310  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.35 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141117  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00398  glutathione S-transferase  33.02 
 
 		 232 aa  86.7  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.995047  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.3 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2431  Glutathione S-transferase domain  31.19 
 
 		 216 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2423  putative glutathione S-transferase  32.04 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3264  glutathione S-transferase-like protein  31.34 
 
 		 216 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3561  Glutathione S-transferase domain protein  30.93 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134068  normal  0.24035 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 205 aa  85.9  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3752  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.93 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0132369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3629  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.93 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395815  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3205  glutathione S-transferase-like  31.19 
 
 		 219 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.877532  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2653  Glutathione S-transferase domain  31.82 
 
 		 211 aa  85.1  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.520035  normal  0.305227 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2573  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.41 
 
 		 221 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.748409  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1365  glutathione S-transferase  28.86 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.290536  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0783  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.82 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4290  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.1 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4110  Glutathione S-transferase domain protein  29.17 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4150  glutathione S-transferase domain protein  29.17 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3680  glutathione S-transferase  31.53 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2221  glutathionine S-transferase  32.46 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0005501 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05193  glutathione S-transferase III  28.99 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5735  Glutathione S-transferase domain protein  32.78 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3183  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.31 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  normal  0.024534 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3744  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.52 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66674  normal  0.0935446 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1722  glutathione S-transferase-like protein  29.61 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1904  Glutathione S-transferase domain protein  32.69 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0755  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.31 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.76216  normal  0.189515 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2947  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.94 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.282557  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.51 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2628  Glutathione S-transferase domain  33.85 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1626  Glutathione S-transferase domain  30.91 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.506745  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2979  glutathione S-transferase  26.7 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.978891  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>