More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1052 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1052  quinone oxidoreductase  100 
 
 		 327 aa  652    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0901  alcohol dehydrogenase  68.6 
 
 		 327 aa  449  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2819  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  65.55 
 
 		 327 aa  424  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1643  zinc-binding alcohol dehydrogenase  61.59 
 
 		 327 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.561484  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1984  alcohol dehydrogenase  60.06 
 
 		 327 aa  392  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3356  quinone oxidoreductase  59.94 
 
 		 327 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0638936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2939  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  61.4 
 
 		 327 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0250  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  58.72 
 
 		 327 aa  388  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.68401  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2891  putative oxidoreductase protein  60.53 
 
 		 338 aa  385  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.874963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0359  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  57.62 
 
 		 327 aa  384  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000624901 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1893  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  62.39 
 
 		 327 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0808  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  58.54 
 
 		 327 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18460  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  58.23 
 
 		 327 aa  383  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5289  quinone oxidoreductase  58.72 
 
 		 327 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574483  normal  0.60541 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1185  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  59.57 
 
 		 327 aa  382  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3133  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  59.35 
 
 		 338 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.87638 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1204  quinone oxidoreductase  58.41 
 
 		 326 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.740135  normal  0.265781 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1526  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56.4 
 
 		 327 aa  378  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24770  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  60.67 
 
 		 328 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2634  zinc-binding alcohol dehydrogenase  59.2 
 
 		 325 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2517  putative zinc-binding dehydrogenase  60.49 
 
 		 326 aa  378  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.145021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5461  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.41 
 
 		 327 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4744  alcohol dehydrogenase  58.41 
 
 		 327 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5401  alcohol dehydrogenase  58.41 
 
 		 327 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910947 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4869  quinone oxidoreductase  58.1 
 
 		 327 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.578327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0065  alcohol dehydrogenase  58.28 
 
 		 326 aa  375  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1223  quinone oxidoreductase  58.23 
 
 		 328 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0950  quinone oxidoreductase  56.13 
 
 		 327 aa  372  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.759216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3189  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.73 
 
 		 333 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.246614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3700  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  58.23 
 
 		 327 aa  371  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2767  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  58.46 
 
 		 338 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1210  alcohol dehydrogenase  58.1 
 
 		 328 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783737  normal  0.219465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2364  dehydrogenase NAD(P)-binding domain-containing protein  57.98 
 
 		 328 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.214717 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2962  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  58.72 
 
 		 327 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.372073  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4477  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  55.05 
 
 		 327 aa  366  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000206096 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2753  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56.4 
 
 		 327 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.700456  normal  0.0252326 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1230  zinc-binding alcohol dehydrogenase  57.06 
 
 		 328 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1474  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  54.13 
 
 		 331 aa  366  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3408  alcohol dehydrogenase  54.27 
 
 		 327 aa  363  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3034  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  57.23 
 
 		 334 aa  363  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5139  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  55.21 
 
 		 328 aa  362  4e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2968  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  55.93 
 
 		 327 aa  362  6e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0338214  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1108  alcohol dehydrogenase  57.06 
 
 		 328 aa  362  6e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.588532  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0612  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  59.51 
 
 		 329 aa  362  6e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00543509 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3502  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  56 
 
 		 328 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.990659  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2477  acyl-CoA dehydrogenase-like  58.41 
 
 		 738 aa  359  3e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193974  normal  0.0198771 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1602  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  53.96 
 
 		 327 aa  356  1.9999999999999998e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4779  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  56.44 
 
 		 325 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.279047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4337  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  55.83 
 
 		 329 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270219  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4991  alcohol dehydrogenase  56.13 
 
 		 328 aa  355  5.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0105  zinc-binding alcohol dehydrogenase  56.88 
 
 		 328 aa  354  1e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227745  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0766  alcohol dehydrogenase  55.18 
 
 		 327 aa  353  2e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2639  zinc-binding alcohol dehydrogenase  55.08 
 
 		 345 aa  352  5e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.718234  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0309  zinc-binding alcohol dehydrogenase  56.27 
 
 		 328 aa  351  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1675  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  55.56 
 
 		 327 aa  350  1e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.509844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2229  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  56.17 
 
 		 327 aa  348  6e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.979693 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6206  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  56.88 
 
 		 328 aa  347  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3835  quinone oxidoreductase  55.52 
 
 		 328 aa  347  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2475  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  54.43 
 
 		 329 aa  343  2e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2846  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  54.15 
 
 		 328 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0354021  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0752  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  52.29 
 
 		 330 aa  342  4e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0082  alcohol dehydrogenase  52.45 
 
 		 326 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0838693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1248  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  54.6 
 
 		 328 aa  340  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.893092  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1434  putative Zn-dependent oxidoreductase  52.15 
 
 		 326 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4748  oxidoreductase, zinc-binding  49.85 
 
 		 327 aa  338  5e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2365  quinone oxidoreductase  54.13 
 
 		 328 aa  338  5e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2363  alcohol dehydrogenase  53.68 
 
 		 329 aa  337  9.999999999999999e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.949479  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1586  alcohol dehydrogenase  52.6 
 
 		 330 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001990  alcohol dehydrogenase  50.46 
 
 		 326 aa  337  1.9999999999999998e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00458  alcohol dehydrogenase  50.77 
 
 		 326 aa  336  2.9999999999999997e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3679  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  51.69 
 
 		 329 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3736  hypothetical protein  52.15 
 
 		 324 aa  335  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0213449 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3568  protein YhdH  52.15 
 
 		 324 aa  335  7e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.408975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3567  protein YhdH  52.15 
 
 		 324 aa  335  7e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000716793  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3639  hypothetical protein  52.15 
 
 		 324 aa  335  7e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000530088 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3519  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  50.92 
 
 		 330 aa  335  9e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.231356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3674  hypothetical protein  52 
 
 		 324 aa  334  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0677066  normal  0.330413 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1505  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  53.7 
 
 		 330 aa  333  2e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1035  alcohol dehydrogenase  51.99 
 
 		 326 aa  333  3e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0255  quinone oxidoreductase  51.83 
 
 		 326 aa  332  4e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2493  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.6 
 
 		 326 aa  332  6e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0250  alcohol dehydrogenase  51.83 
 
 		 326 aa  332  6e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2535  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.13 
 
 		 336 aa  331  8e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351283  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0254  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.52 
 
 		 326 aa  332  8e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000117637 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3346  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  51.86 
 
 		 328 aa  331  8e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.584462  normal  0.149022 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03112  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  51.23 
 
 		 324 aa  331  1e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0728423  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0454  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.23 
 
 		 324 aa  331  1e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.749607  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3679  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  52.15 
 
 		 326 aa  331  1e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0862676  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03063  hypothetical protein  51.23 
 
 		 324 aa  331  1e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0710671  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3737  quinone oxidoreductase  50.92 
 
 		 324 aa  330  2e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000296751  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0467  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  52.62 
 
 		 325 aa  330  2e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4569  quinone oxidoreductase, YhdH family  50.92 
 
 		 324 aa  330  2e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000284525  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0252  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  51.22 
 
 		 326 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3443  quinone oxidoreductase  50.92 
 
 		 324 aa  329  3e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378871  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0454  quinone oxidoreductase  50.92 
 
 		 324 aa  329  3e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0728  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  55.69 
 
 		 325 aa  329  4e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.43463 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4413  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  52.92 
 
 		 325 aa  328  5.0000000000000004e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00493012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3285  quinone oxidoreductase, YhdH family  50.61 
 
 		 324 aa  328  6e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00682496  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3548  quinone oxidoreductase  50.61 
 
 		 324 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000395647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3572  alcohol dehydrogenase  51.52 
 
 		 326 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>