More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0386 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0386  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 302 aa  617  1e-176  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477103 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3210  putative sugar kinase transferase protein  70.86 
 
 		 301 aa  442  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.258809  decreased coverage  0.003878 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3388  ribokinase-like domain-containing protein  67.33 
 
 		 307 aa  404  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.684995 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1493  ribokinase-like domain-containing protein  66.55 
 
 		 298 aa  401  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2945  PfkB domain protein  66.22 
 
 		 298 aa  397  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3635  ribokinase-like domain-containing protein  66.55 
 
 		 298 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.151802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1103  PfkB  64.12 
 
 		 300 aa  396  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00948504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1498  ribokinase-like domain-containing protein  63.33 
 
 		 300 aa  386  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0861  ribokinase-like domain-containing protein  64.53 
 
 		 298 aa  386  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.035179  normal  0.0608327 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0953  PfkB domain protein  62.58 
 
 		 300 aa  381  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.940655  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0225  PfkB domain protein  55.19 
 
 		 319 aa  347  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0207  ribokinase-like domain-containing protein  55.78 
 
 		 319 aa  343  2e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000760585  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0471  PfkB  57 
 
 		 320 aa  340  2e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000138593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0173  PfkB domain protein  55.74 
 
 		 310 aa  338  8e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00145747  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1195  ribokinase-like domain-containing protein  56.08 
 
 		 316 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  55.26 
 
 		 315 aa  335  5e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2067  Adenosine kinase  53.2 
 
 		 310 aa  335  5e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3036  PfkB domain protein  53.67 
 
 		 311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3935  PfkB  54.33 
 
 		 310 aa  324  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0713343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  53.95 
 
 		 315 aa  324  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2791  putative sugar kinase transferase protein  54 
 
 		 311 aa  322  3e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00725009  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2626  PfkB domain protein  53.33 
 
 		 311 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0526  ribokinase-like domain-containing protein  52.82 
 
 		 312 aa  321  7e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.846303  normal  0.476119 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2784  ribokinase-like domain-containing protein  53.16 
 
 		 312 aa  321  8e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.417689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2634  ribokinase-like domain-containing protein  52.16 
 
 		 314 aa  321  8e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.831919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0502  ribokinase-like domain-containing protein  52.82 
 
 		 320 aa  321  8e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0047  carbohydrate kinase  55.25 
 
 		 310 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1158  ribokinase, putative  50.5 
 
 		 312 aa  318  9e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3506  sugar kinase  50.17 
 
 		 312 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3508  PfkB family kinase  50.17 
 
 		 312 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3470  PfkB family kinase  50.17 
 
 		 312 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0209  PfkB  52.33 
 
 		 311 aa  315  7e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0527  putative sugar kinase transferase, PfkB  51.16 
 
 		 312 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2548  carbohydrate kinase, PfkB  53.67 
 
 		 310 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.636589  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1286  putative ribokinase  49.83 
 
 		 312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3278  putative ribokinase  49.83 
 
 		 312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0427  putative ribokinase  49.83 
 
 		 312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3683  adenosine kinase  51.64 
 
 		 312 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3450  PfkB domain protein  53.82 
 
 		 311 aa  311  5.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3431  PfkB domain protein  50.5 
 
 		 312 aa  309  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0295739  normal  0.0158701 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0569  ribokinase-like domain-containing protein  50.5 
 
 		 312 aa  308  8e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  decreased coverage  0.0000690864 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0117  adenosine kinase  50.5 
 
 		 312 aa  308  8e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0600  adenosine kinase  50.5 
 
 		 312 aa  308  8e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0171  carbohydrate kinase  53.92 
 
 		 310 aa  305  6e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.150341 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04263  sugar kinase  50.17 
 
 		 362 aa  298  1e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.383154  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0530  carbohydrate kinase, PfkB family  52.63 
 
 		 313 aa  294  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00148509  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0688  PfkB domain protein  52.63 
 
 		 313 aa  294  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000405539  hitchhiker  0.000110738 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3455  PfkB domain protein  48 
 
 		 312 aa  291  1e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.327587  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2506  ribokinase, putative  49.26 
 
 		 283 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.617052  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2935  PfkB domain protein  37.87 
 
 		 308 aa  202  5e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0800  ribokinase-like domain-containing protein  40.94 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2351  ribokinase-like domain-containing protein  38.87 
 
 		 318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153207  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0200  PfkB domain protein  38.54 
 
 		 318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0158  ribokinase-like domain-containing protein  40.2 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1489  carbohydrate kinase  38.03 
 
 		 308 aa  192  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000020351  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0487  ribokinase-like domain-containing protein  38.54 
 
 		 327 aa  187  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12230  carbohydrate kinase cbhK  37.54 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000530804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2001  ribokinase-like domain-containing protein  35.49 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0769014  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3300  adenosine kinase  35.55 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3311  adenosine kinase  35.55 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.353965  normal  0.464112 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3362  adenosine kinase  35.55 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2947  adenosine kinase  34.88 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3120  adenosine kinase  35.18 
 
 		 326 aa  172  5.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3081  PfkB domain protein  33.11 
 
 		 324 aa  169  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00739756  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3566  adenosine kinase  34.34 
 
 		 323 aa  169  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0415989  normal  0.0392481 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1531  PfkB domain protein  33.66 
 
 		 329 aa  169  8e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0901719  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3562  PfkB domain protein  36.21 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3257  Adenosine kinase  34.32 
 
 		 325 aa  166  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00285447  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1012  putative carbohydrate kinase  34.43 
 
 		 324 aa  166  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27030  sugar kinase, ribokinase  34.65 
 
 		 321 aa  166  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.805869  normal  0.364358 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3063  PfkB domain protein  32.89 
 
 		 324 aa  164  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142988  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3153  Adenosine kinase  34.1 
 
 		 323 aa  162  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1286  PfkB domain-containing protein  34 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0955  ribokinase-like domain-containing protein  34.77 
 
 		 339 aa  161  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.989352  normal  0.38603 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3144  ribokinase-like domain-containing protein  33.44 
 
 		 327 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1665  Adenosine kinase  33.22 
 
 		 329 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2666  PfkB domain protein  33.55 
 
 		 328 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1798  adenosine kinase  33.33 
 
 		 326 aa  153  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527553  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4145  PfkB domain-containing protein  31.48 
 
 		 327 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786211  decreased coverage  0.0063394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3294  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3535  ribokinase-like domain-containing protein  31 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32323  decreased coverage  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3303  ribokinase-like domain-containing protein  30.33 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.121546 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  29.01 
 
 		 302 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  28.57 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  29.41 
 
 		 302 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  30.03 
 
 		 302 aa  119  6e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  29.35 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  27.82 
 
 		 299 aa  99.4  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1080  PfkB domain protein  27.61 
 
 		 317 aa  98.6  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0967  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  26.05 
 
 		 300 aa  89.4  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0230959  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  31.18 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  25.72 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1085  PfkB domain protein  27.87 
 
 		 294 aa  79  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000428719  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0859  ribokinase-like domain-containing protein  28.03 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.826184  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1796  PfkB  28.36 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000052274  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0932  inosine-guanosine kinase / cytidine kinase  25.61 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.934328  normal  0.0821037 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  25.86 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  26.6 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  25 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  25.96 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>