24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0011 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0011  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  627  1e-179  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000604844 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1818  hypothetical protein  61.79 
 
 		 338 aa  385  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1217  Mammalian cell entry related domain protein  60.9 
 
 		 336 aa  378  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2658  ABC-type transport system periplasmic component  60.38 
 
 		 346 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2591  hypothetical protein  61.19 
 
 		 336 aa  381  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703679  normal  0.200982 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1790  hypothetical protein  62.28 
 
 		 343 aa  375  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0502683 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0553  hypothetical protein  62.05 
 
 		 341 aa  363  2e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2918  hypothetical protein  61.67 
 
 		 330 aa  355  5e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.184503  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1223  ABC-type transport system periplasmic component  55.74 
 
 		 299 aa  333  2e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0978  ABC-type transport system periplasmic component  40.79 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  22.61 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1894  hypothetical protein  25 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276188  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1854  Mammalian cell entry related domain protein  23.91 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000329704  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3670  hypothetical protein  23.18 
 
 		 353 aa  55.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0456409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2193  Mammalian cell entry related domain protein  23.26 
 
 		 456 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141725  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1899  virulence factor Mce family protein  22.48 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1982  Mammalian cell entry related domain protein  23.68 
 
 		 456 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0362661  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1954  hypothetical protein  26.53 
 
 		 360 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5281  Mammalian cell entry related domain protein  24.47 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.192594 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0795  Mammalian cell entry related domain protein  23.34 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1810  Mammalian cell entry related domain protein  25.2 
 
 		 341 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_004310  BR1021  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  22.76 
 
 		 331 aa  42.7  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2805  Mammalian cell entry related domain protein  24.91 
 
 		 357 aa  42.7  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3390  Mammalian cell entry related domain protein  23.1 
 
 		 317 aa  42.7  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0881876 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>