62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1199 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1199  cell division membrane protein  100 
 
 
98 aa  184  4e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1036  protein of unknown function YGGT  45.12 
 
 
89 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000119033  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1490  cell division membrane protein  44.19 
 
 
87 aa  73.2  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0595  protein of unknown function YGGT  38.96 
 
 
86 aa  68.6  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102021  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0477  hypothetical protein  36.9 
 
 
99 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1906  protein of unknown function YGGT  36.36 
 
 
90 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0493  protein of unknown function YGGT  43.21 
 
 
92 aa  65.5  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.197871  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  39.19 
 
 
87 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  40.54 
 
 
87 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2059  hypothetical protein  40 
 
 
91 aa  62.4  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3749  ylmG protein  39.19 
 
 
87 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0442014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3640  hypothetical protein  39.19 
 
 
87 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138235  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  39.19 
 
 
87 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3912  ylmG protein  39.19 
 
 
87 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638636 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4037  hypothetical protein  39.19 
 
 
87 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000926366  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3950  ylmG protein  39.19 
 
 
87 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361919  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  39.44 
 
 
87 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  39.19 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08930  YGGT family protein  40.28 
 
 
84 aa  58.9  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.384516  hitchhiker  0.0000000251444 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2082  protein of unknown function YGGT  38.03 
 
 
86 aa  58.2  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0261764  hitchhiker  0.000000000000996106 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  40.58 
 
 
87 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09420  YGGT family protein  47.76 
 
 
86 aa  57  0.00000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0374287  normal  0.111305 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  35.29 
 
 
85 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0755  ylmG protein  37.66 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0014  hypothetical protein  39.39 
 
 
98 aa  55.8  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08491  integral membrane protein  36.25 
 
 
102 aa  54.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.321113  hitchhiker  0.00153658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3109  hypothetical protein  37.88 
 
 
92 aa  53.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264306  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0994  hypothetical protein  31.17 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0252519  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  34.67 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09491  hypothetical protein  36.71 
 
 
92 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.291422  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09691  hypothetical protein  38.55 
 
 
100 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0755134  normal  0.205345 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0297  hypothetical protein  38.55 
 
 
100 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.475908  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1141  cell division membrane protein  46.15 
 
 
64 aa  51.2  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0053  protein of unknown function YGGT  36.84 
 
 
99 aa  51.2  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09511  hypothetical protein  36.36 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.545335  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0890  hypothetical protein  36.36 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09931  hypothetical protein  35.06 
 
 
92 aa  50.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2189  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.111036 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1249  hypothetical protein  39.06 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000234986  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1433  hypothetical protein  32.47 
 
 
98 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.116879 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1274  hypothetical protein  39.06 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000722021  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15401  hypothetical protein  28.4 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  31.82 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0295  protein of unknown function YGGT  31.88 
 
 
78 aa  47.4  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315255  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3329  protein of unknown function YGGT  29.35 
 
 
98 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4761  protein of unknown function YGGT  31.11 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_002978  WD0121  YGGT family protein  28.74 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  24.73 
 
 
189 aa  45.4  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4335  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.680603  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_10630  predicted protein  39.34 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1066  hypothetical protein  35 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0780  hypothetical protein  34.85 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0696156  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  27.38 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  30.86 
 
 
199 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  29.63 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2521  protein of unknown function YGGT  39.47 
 
 
91 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3585  protein of unknown function YGGT  39.47 
 
 
91 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0833218  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36034  predicted protein  33.33 
 
 
237 aa  40.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.119025  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  29.63 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2785  hypothetical protein  30.61 
 
 
193 aa  40.8  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.555098  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  28 
 
 
87 aa  40.4  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1230  protein of unknown function YGGT  28.77 
 
 
182 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000825612  normal  0.409234 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>