55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2486 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2486  Solo B3/4 domain-containing protein  100 
 
 		 239 aa  490  1e-137  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1176  B3/4 domain protein  61.54 
 
 		 235 aa  280  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185017  normal  0.273713 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0131  B3/4 domain protein  57.83 
 
 		 231 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1040  hypothetical protein  53.25 
 
 		 234 aa  257  9e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0178906  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14900  hypothetical protein  54.39 
 
 		 241 aa  257  1e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000192579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf669  hypothetical protein  53.88 
 
 		 232 aa  254  7e-67  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2162  hypothetical protein  50 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06500  hypothetical protein  46.44 
 
 		 241 aa  232  3e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000280748  normal  0.453475 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1756  B3/4 domain-containing protein  49.79 
 
 		 241 aa  229  4e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0178794  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02780  hypothetical protein  35.07 
 
 		 242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3145  B3/4 domain protein  36.24 
 
 		 240 aa  136  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0928  B3/4 domain-containing protein  30.93 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191069  normal  0.0846004 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14530  hypothetical protein  36.42 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278523  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4932  B3/4 domain protein  40.52 
 
 		 228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8283  hypothetical protein  40 
 
 		 235 aa  118  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182929  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5071  B3/4 domain protein  34.6 
 
 		 227 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142893  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1912  B3/4 domain protein  28.76 
 
 		 233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1486  B3/4 domain protein  37.74 
 
 		 228 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.275004  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1667  B3/4 domain-containing protein  37.74 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0922271 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1790  B3/4 domain protein  37.74 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.23323 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1788  B3/4 domain protein  37.11 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00972614  normal  0.283564 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1850  B3/4 domain-containing protein  37.11 
 
 		 228 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3530  B3/4 domain-containing protein  36.88 
 
 		 228 aa  105  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2889  B3/4 domain-containing protein  33.51 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0911  hypothetical protein  37.31 
 
 		 239 aa  101  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09810  hypothetical protein  38.06 
 
 		 239 aa  101  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1605  B3/4 domain protein  25.54 
 
 		 235 aa  93.2  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000125396  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3672  B3/4 domain protein  29.91 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1602  B3/4 domain-containing protein  32.67 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.172541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5725  B3/4 domain protein  26.76 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5429  phosphoenolpyruvate synthase  28.34 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2948  B3/4 domain protein  23.01 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2690  B3/4 domain protein  26.88 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3065  hypothetical protein  26.29 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.570745  normal  0.843466 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1717  B3/4 domain protein  29.52 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1201  B3/4 domain-containing protein  25.11 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.62584  hitchhiker  0.00215136 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0502  B3/4 domain protein  25.58 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0504  B3/4  32.89 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.333323  normal  0.47226 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1367  B3/4 domain protein  24.22 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5108  B3/4 domain protein  23.56 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_002950  PG0789  hypothetical protein  28 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.995984 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1117  B3/4 domain-containing protein  32.89 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.871418  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01765  hypothetical protein  22.04 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73481  normal  0.164289 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1790  phosphoenolpyruvate synthase  27.54 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1676  B3/4 domain-containing protein  26.79 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0519  B3/4 domain-containing protein  26.67 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.015821  normal  0.0554264 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2205  B3/4 domain protein  26.84 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0925  hypothetical protein  51.85 
 
 		 57 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000509221  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2004  phosphoenolpyruvate synthase  26.71 
 
 		 217 aa  48.5  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0454  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  38 
 
 		 800 aa  48.5  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01730  hypothetical protein  27.47 
 
 		 232 aa  45.8  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00581405  hitchhiker  0.00000000634299 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0210  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.09 
 
 		 810 aa  44.3  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3623  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33 
 
 		 798 aa  43.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.117267 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0237  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.02 
 
 		 798 aa  42.7  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3094  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.51 
 
 		 820 aa  42.7  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.067961 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>