50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0476 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0476  hypothetical protein  100 
 
 
369 aa  662  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  3.68033e-05  normal  0.0256844 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35930  hypothetical protein  39.63 
 
 
364 aa  132  1e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.184188 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1983  septum site determining protein  34.41 
 
 
403 aa  108  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3373  hypothetical protein  35.29 
 
 
325 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0728  hypothetical protein  36.76 
 
 
359 aa  106  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5871  hypothetical protein  35.14 
 
 
369 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  1.85366e-05  normal  0.407546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0479  hypothetical protein  37.38 
 
 
348 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4806  hypothetical protein  42.91 
 
 
353 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.723828  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4892  hypothetical protein  42.91 
 
 
353 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5193  hypothetical protein  43.3 
 
 
353 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000272361 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4839  hypothetical protein  42.24 
 
 
359 aa  96.7  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5422  hypothetical protein  34.45 
 
 
365 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0213  chromosome partitioning-like ATPase  37.2 
 
 
346 aa  92.8  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0618  hypothetical protein  41.35 
 
 
345 aa  91.3  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3162  hypothetical protein  35.8 
 
 
362 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0841875 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0129  putative septum site determining protein  38.54 
 
 
364 aa  89.4  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1383  hypothetical protein  33.64 
 
 
365 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.068723  normal  0.317281 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0275  hypothetical protein  40.74 
 
 
371 aa  85.9  1e-15  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4422  hypothetical protein  40.49 
 
 
366 aa  85.1  2e-15  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13690  hypothetical protein  39.45 
 
 
350 aa  82.4  1e-14  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00103627  normal  0.200408 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3909  hypothetical protein  40 
 
 
355 aa  79.7  8e-14  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0591  septum site determining protein  38.46 
 
 
357 aa  77.4  3e-13  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4040  hypothetical protein  40.08 
 
 
366 aa  75.1  2e-12  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79902  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0363  septum site determining protein  33.73 
 
 
348 aa  72.8  1e-11  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  3.46854e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0053  hypothetical protein  34.87 
 
 
569 aa  70.9  4e-11  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544146  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0517  hypothetical protein  34.01 
 
 
352 aa  67.8  3e-10  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0323  flp pilus assembly protein FlpE  35.24 
 
 
266 aa  65.5  2e-09  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264858  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33370  hypothetical protein  36.41 
 
 
309 aa  60.1  6e-08  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.066941  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1298  chromosome partitioning ATPase  30.15 
 
 
232 aa  53.1  7e-06  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2225  hypothetical protein  34.57 
 
 
265 aa  53.1  8e-06  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.503048 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0952  hypothetical protein  23.98 
 
 
297 aa  51.6  2e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4296  putative septum site determining protein  31.82 
 
 
402 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334486  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0552  septum site-determining protein MinD  26.15 
 
 
260 aa  47.4  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  30.81 
 
 
389 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1205  septum site-determining protein MinD  26.21 
 
 
265 aa  47  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03531  putative septum site-determining protein MinD  29.41 
 
 
271 aa  46.6  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  27.56 
 
 
389 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25810  hypothetical protein  35.57 
 
 
420 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  27.43 
 
 
528 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2370  septum site-determining protein MinD  24.05 
 
 
260 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0304422  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1534  septum site-determining protein MinD  24.44 
 
 
264 aa  43.9  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341054  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2457  CpaE, putative  28.4 
 
 
405 aa  44.3  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335722  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2018  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  22.71 
 
 
408 aa  44.3  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.724066  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1306  septum site-determining protein MinD  22.37 
 
 
266 aa  43.5  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  1.07586e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0021  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.31 
 
 
275 aa  43.1  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  4.72925e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0021  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.31 
 
 
275 aa  43.1  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03451  putative septum site-determining protein MinD  28.18 
 
 
275 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1353  septum site-determining protein MinD  22.62 
 
 
264 aa  42.7  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  23.76 
 
 
392 aa  42.7  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3334  septum site-determining protein MinD  24.66 
 
 
264 aa  42.7  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0234044  normal  0.602718 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>