168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1618 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1618  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
147 aa  278  2e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0386  hypothetical protein  85.71 
 
 
147 aa  240  3.9999999999999997e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.369769  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0365  hypothetical protein  85.03 
 
 
147 aa  240  6e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1344  hypothetical protein  72.41 
 
 
147 aa  209  1e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2017  hypothetical protein  41.13 
 
 
151 aa  95.1  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0715199  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3361  hypothetical protein  35.56 
 
 
160 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.276443  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1381  membrane protein-like protein  31.16 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0381  SNARE associated Golgi protein  29.93 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.129917  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4122  putative inner membrane protein  33.59 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0487  putative transmembrane protein  37.12 
 
 
160 aa  80.1  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.528398  normal  0.0272623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4633  hypothetical protein  35.88 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0493  hypothetical protein  33.59 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0020  SNARE associated Golgi protein  38.35 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0229  hypothetical protein  35.61 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0892  hypothetical protein  36.64 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.241646 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0453  hypothetical protein  28.21 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.97409 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3614  membrane protein-like protein  40.82 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3548  membrane protein-like protein  39.46 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3029  hypothetical protein  35.38 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.332295 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0641  inner membrane protein  35.92 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.346096  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0535  putative transmembrane protein  34.75 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1579  hypothetical protein  31.82 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.49497  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0328  putative transmembrane protein  29.73 
 
 
193 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2638  putative inner membrane protein  35.56 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.111038  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0426  hypothetical protein  29.88 
 
 
192 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167258  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2552  hypothetical protein  35.29 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0353  hypothetical protein  29.84 
 
 
148 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0636  hypothetical protein  28.26 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1129  hypothetical protein  32.59 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0566076  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1852  hypothetical protein  31.58 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1779  SNARE associated Golgi protein  31.78 
 
 
144 aa  72  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.380295  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002528  hypothetical protein  37.78 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2147  putative integral membrane protein  36.51 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.864762  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0030  membrane protein-like protein  31.43 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0561299  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4281  hypothetical protein  34.81 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0335  hypothetical protein  32.86 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2244  membrane protein-like protein  32.06 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0054372  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03488  hypothetical protein  37.21 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3878  hypothetical protein  33.07 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0343  hypothetical protein  28.38 
 
 
193 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.38894  normal  0.477555 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1825  hypothetical protein  31.58 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272987  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0366  hypothetical protein  27.21 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1070  hypothetical protein  32.61 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1561  hypothetical protein  28.74 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0345  hypothetical protein  27.94 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141714  hitchhiker  0.00000000000399194 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2910  hypothetical protein  29.79 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1119  hypothetical protein  30.47 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000563823  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3587  hypothetical protein  30.28 
 
 
202 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.428384 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0684  membrane protein-like protein  32.09 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3535  hypothetical protein  31.01 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5610  SNARE associated Golgi protein  30.28 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.407349 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1327  hypothetical protein  33.08 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0199997 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1387  hypothetical protein  32.56 
 
 
167 aa  67  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2202  hypothetical protein  31.01 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3328  SNARE associated Golgi protein  31.54 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111498 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1056  hypothetical protein  32.58 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0574  hypothetical protein  31.62 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3208  hypothetical protein  28.12 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000592602  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3229  transmembrane protein  31.39 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.588156  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3935  hypothetical protein  30.6 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.809511 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1217  hypothetical protein  32.84 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.323612  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1225  hypothetical protein  32.54 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3169  hypothetical protein  32.33 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0441375  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02544  conserved inner membrane protein  30.6 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00731446  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0995  conserved hypothetical protein  30.6 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000205167  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1001  hypothetical protein  28.79 
 
 
143 aa  62.8  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453071  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2940  hypothetical protein  29.63 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2811  hypothetical protein  30.6 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000161283  hitchhiker  0.000505734 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02509  hypothetical protein  30.6 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0129195  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1018  hypothetical protein  30.6 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0859423  hitchhiker  0.00416875 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2825  hypothetical protein  30.6 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883213  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0846  hypothetical protein  29.29 
 
 
142 aa  62.8  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000797425  hitchhiker  0.00000218061 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3187  hypothetical protein  30.6 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000058062  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2405  hypothetical protein  27.41 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2972  hypothetical protein  30.6 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000189151  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1716  membrane protein-like  28.47 
 
 
143 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3370  hypothetical protein  30 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000974791  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0892  hypothetical protein  30 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000438982  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4308  membrane protein-like protein  29.2 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.266341 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2487  hypothetical protein  28.37 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3235  hypothetical protein  30 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000052813  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4069  membrane protein-like  29.2 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4297  membrane protein-like protein  29.2 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1130  hypothetical protein  29.01 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1034  hypothetical protein  28.03 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3220  membrane protein-like protein  29.2 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.55153 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2982  hypothetical protein  29.63 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3162  hypothetical protein  30.77 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1029  hypothetical protein  28.57 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01067  membrane protein-like protein  30.53 
 
 
132 aa  58.2  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0101097  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3262  hypothetical protein  28.24 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.175834  normal  0.086413 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0986  hypothetical protein  28.91 
 
 
142 aa  57.8  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0000995466  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28510  hypothetical protein  29.58 
 
 
147 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173571 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3374  hypothetical protein  33.33 
 
 
138 aa  57.4  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4193  membrane protein-like protein  27.86 
 
 
143 aa  57  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194091  normal  0.36355 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3561  hypothetical protein  30.08 
 
 
141 aa  57  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0082  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.37 
 
 
221 aa  57  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0692  hypothetical protein  30.3 
 
 
137 aa  57  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3715  membrane protein-like protein  27.86 
 
 
143 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3064  hypothetical protein  28.89 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>