More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_15320 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_15320  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 
305 aa  613  1e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0917  cobalamin synthesis protein P47K  31.73 
 
 
614 aa  122  6e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  34.65 
 
 
369 aa  116  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  35.9 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  37.77 
 
 
324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  36.73 
 
 
349 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  35.68 
 
 
393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  35.9 
 
 
367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  35.92 
 
 
346 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  35.92 
 
 
346 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.18 
 
 
374 aa  112  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  35.18 
 
 
343 aa  112  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  36.87 
 
 
341 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  30.3 
 
 
323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  34.69 
 
 
323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  35.29 
 
 
354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4133  cobalamin synthesis protein P47K  33.93 
 
 
424 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  38.5 
 
 
322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3403  cobalamin synthesis protein P47K  26.91 
 
 
341 aa  110  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6990  cobalamin synthesis protein P47K  27.93 
 
 
360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.81769  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  32.73 
 
 
417 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  26.8 
 
 
316 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.36 
 
 
316 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  34.31 
 
 
379 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  35.11 
 
 
365 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  34.16 
 
 
380 aa  108  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0536  cobalamin synthesis protein, P47K  29.86 
 
 
352 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  35.64 
 
 
384 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3924  cobalamin synthesis protein P47K  26.83 
 
 
344 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0777863  normal  0.0144678 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  34.76 
 
 
320 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  36.22 
 
 
353 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  34.67 
 
 
355 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0441  cobalamin synthesis protein, P47K  34.65 
 
 
382 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.319844  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  35.71 
 
 
323 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  27.86 
 
 
319 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4724  cobalamin synthesis protein P47K  32.13 
 
 
376 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  34.04 
 
 
363 aa  107  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2838  cobalamin synthesis protein P47K  32.47 
 
 
356 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  35.71 
 
 
323 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.86 
 
 
316 aa  106  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  27.48 
 
 
316 aa  106  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5621  cobalamin synthesis protein P47K  26.3 
 
 
325 aa  106  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  31.82 
 
 
406 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  32.04 
 
 
329 aa  105  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.1 
 
 
316 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  32.68 
 
 
378 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  32.68 
 
 
378 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  33.69 
 
 
337 aa  105  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1874  cobalamin synthesis protein/P47K  27.03 
 
 
325 aa  105  9e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  27.95 
 
 
349 aa  105  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.48 
 
 
316 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  34.05 
 
 
350 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  32.11 
 
 
408 aa  104  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  31.79 
 
 
328 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.48 
 
 
316 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  31.25 
 
 
388 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  33.51 
 
 
353 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  34.87 
 
 
349 aa  104  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  36.22 
 
 
332 aa  104  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  32.99 
 
 
347 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  32.12 
 
 
355 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7138  cobalamin synthesis protein P47K  34.16 
 
 
360 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775863  normal  0.480911 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 
358 aa  103  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.76 
 
 
345 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  33.69 
 
 
350 aa  103  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  33.69 
 
 
349 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4936  cobalamin synthesis protein P47K  31.86 
 
 
402 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3649  cobalamin synthesis protein P47K  31.42 
 
 
423 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493761  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  34.16 
 
 
362 aa  103  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  33.51 
 
 
361 aa  103  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  34.39 
 
 
320 aa  103  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  27.65 
 
 
395 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  26.38 
 
 
394 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  32.68 
 
 
379 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0198  cobalamin synthesis protein, P47K  33.67 
 
 
322 aa  103  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  33 
 
 
326 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3034  cobalamin synthesis protein, P47K  30.97 
 
 
423 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0820283  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  30.08 
 
 
457 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5332  cobalamin synthesis protein, P47K  30.97 
 
 
423 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.1 
 
 
319 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1091  cobalamin synthesis protein P47K  31.53 
 
 
406 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.1 
 
 
316 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5779  cobalamin synthesis protein, P47K  27.52 
 
 
344 aa  103  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  35.05 
 
 
364 aa  102  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  31.5 
 
 
364 aa  102  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  32.16 
 
 
404 aa  102  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3150  cobalamin synthesis protein P47K  30.3 
 
 
640 aa  102  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179732  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0316  cobalamin synthesis protein/P47K  31.08 
 
 
423 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  32.14 
 
 
493 aa  102  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1800  cobalamin synthesis protein P47K  31.41 
 
 
328 aa  102  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.739911  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  32.2 
 
 
372 aa  102  9e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  33.69 
 
 
320 aa  102  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1485  cobalamin synthesis protein P47K  31.2 
 
 
310 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861962  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  27.65 
 
 
395 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  35.9 
 
 
366 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1786  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.21 
 
 
320 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114166  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  32.5 
 
 
328 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  35.91 
 
 
324 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1925  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.21 
 
 
307 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000812691  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  28.11 
 
 
377 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>