24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0024 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0024  O-antigen polymerase  100 
 
 		 456 aa  918    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5004  O-antigen polymerase family protein  27.2 
 
 		 436 aa  79.7  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3885  O-antigen polymerase  30.64 
 
 		 443 aa  69.7  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.722344  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  27 
 
 		 464 aa  68.2  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  30.97 
 
 		 461 aa  60.5  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  36.27 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  28.1 
 
 		 454 aa  55.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3061  O-antigen polymerase  28.74 
 
 		 465 aa  53.5  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3401  polysaccharide deacetylase  25.64 
 
 		 464 aa  53.5  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.264275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  25.67 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  25 
 
 		 457 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3077  O-antigen polymerase  24.19 
 
 		 504 aa  47.8  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  24.43 
 
 		 498 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  25 
 
 		 457 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0679  O-antigen polymerase  34.33 
 
 		 437 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2018  O-antigen polymerase  22.66 
 
 		 456 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  24.61 
 
 		 437 aa  46.6  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2363  hypothetical protein  26.37 
 
 		 431 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0658  O-antigen polymerase family protein  21.24 
 
 		 398 aa  45.1  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.238334  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2455  O-antigen polymerase  26.72 
 
 		 435 aa  45.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818595  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2009  O-antigen polymerase  22 
 
 		 459 aa  45.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0314  O-antigen polymerase  27.53 
 
 		 397 aa  45.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  22.07 
 
 		 501 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2886  O-antigen ligase-like  26.49 
 
 		 414 aa  43.1  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000199013  normal  0.062273 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>