216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1769 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  100 
 
 
372 aa  733    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  65.99 
 
 
369 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  65.99 
 
 
369 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  63.79 
 
 
369 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  63.46 
 
 
386 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  63.22 
 
 
369 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  63.79 
 
 
362 aa  451  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  63.22 
 
 
369 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  62.93 
 
 
371 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  62.36 
 
 
369 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3473  flagellar basal body P-ring protein  62.36 
 
 
369 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813313  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  60.43 
 
 
380 aa  433  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  60.29 
 
 
401 aa  433  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  59.65 
 
 
376 aa  417  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  57.1 
 
 
367 aa  412  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06161  flagellar basal body P-ring protein  60.23 
 
 
372 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0591048  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2206  flagellar basal body P-ring protein  59.37 
 
 
379 aa  405  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.988864  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01005  flagellar basal body P-ring protein  60.23 
 
 
372 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1899  flagellar basal body P-ring protein  57.53 
 
 
376 aa  404  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.046577 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  54.42 
 
 
365 aa  395  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1467  flagellar basal body P-ring protein  56.79 
 
 
366 aa  389  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01294  flagellar basal body P-ring protein  55.25 
 
 
363 aa  389  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2331  flagellar basal body P-ring protein  53.23 
 
 
373 aa  388  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3242  flagellar basal body P-ring protein  56.2 
 
 
363 aa  384  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1347  flagellar basal body P-ring protein  54.76 
 
 
364 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  54.55 
 
 
369 aa  382  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1336  flagellar basal body P-ring protein  53.83 
 
 
363 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2311  flagellar basal body P-ring protein  54.37 
 
 
363 aa  381  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0349  flagellar basal body P-ring protein  57.06 
 
 
369 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196884  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3093  flagellar basal body P-ring protein  53.28 
 
 
363 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1310  flagellar basal body P-ring protein  55.33 
 
 
366 aa  379  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1423  flagellar basal body P-ring protein  53.28 
 
 
363 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.769389  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2955  flagellar basal body P-ring protein  53.28 
 
 
363 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.667376  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3093  flagellar basal body P-ring protein  52.77 
 
 
370 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1266  flagellar basal body P-ring protein  53.55 
 
 
363 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1168  flagellar basal body P-ring protein  55.91 
 
 
368 aa  378  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0244391  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02921  flagellar basal body P-ring protein  52.63 
 
 
370 aa  379  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1712  flagellar basal body P-ring protein  56.34 
 
 
371 aa  378  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405686  normal  0.248733 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2940  flagellar basal body P-ring protein  53.28 
 
 
363 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0076  flagellar basal body P-ring protein  56.06 
 
 
371 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.322423  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1604  flagellar basal body P-ring protein  54.47 
 
 
363 aa  375  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0616045  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  53.01 
 
 
363 aa  377  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1665  flagellar basal body P-ring protein  55.49 
 
 
371 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.231572  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5632  flagellar basal body P-ring protein  55.04 
 
 
392 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347995  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1328  flagellar basal body P-ring protein  51.47 
 
 
363 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24070  flagellar basal body P-ring protein  55.01 
 
 
385 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1785  flagellar basal body P-ring protein  55.04 
 
 
361 aa  374  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3080  flagellar basal body P-ring protein  54.47 
 
 
363 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2590  flagellar basal body P-ring protein  53.6 
 
 
363 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4784  flagellar basal body P-ring protein  55.84 
 
 
372 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.341084 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3576  flagellar P-ring protein  51.6 
 
 
362 aa  366  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2917  flagellar basal body P-ring protein  57.93 
 
 
374 aa  365  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0476897  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3741  flagellar basal body P-ring protein  54.47 
 
 
394 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.713349  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3707  flagellar basal body P-ring protein  55.84 
 
 
372 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0982974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1264  flagellar basal body P-ring protein  54.18 
 
 
367 aa  363  2e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.236282  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1484  flagellar basal body P-ring protein  54.47 
 
 
363 aa  362  5.0000000000000005e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.313129  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  53.03 
 
 
377 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  52.55 
 
 
390 aa  362  6e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0285  flagellar basal body P-ring protein  54.06 
 
 
401 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394102  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0469  flagellar basal body P-ring protein  54.06 
 
 
397 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  55.04 
 
 
377 aa  359  4e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  53.78 
 
 
397 aa  359  5e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0247  flagellar basal body P-ring protein  53.5 
 
 
401 aa  359  5e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04916  flagellar basal body P-ring protein  51.35 
 
 
378 aa  359  5e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  53.78 
 
 
401 aa  359  5e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  53.78 
 
 
400 aa  359  5e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  53.78 
 
 
400 aa  359  5e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1231  flagellar basal body P-ring protein  52.28 
 
 
367 aa  358  6e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  54.06 
 
 
394 aa  358  6e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  53.78 
 
 
394 aa  358  6e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  53.78 
 
 
391 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  53.78 
 
 
392 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  53.78 
 
 
391 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  53.78 
 
 
391 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1231  flagellar basal body P-ring protein  52.01 
 
 
367 aa  357  1.9999999999999998e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  53.19 
 
 
392 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0213  flagellar basal body P-ring protein  53.49 
 
 
364 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.613431  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1630  flagellar basal body P-ring protein  55.04 
 
 
365 aa  349  5e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.891214  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  51.09 
 
 
392 aa  348  6e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000733  flagellar P-ring protein FlgI  49.87 
 
 
370 aa  348  9e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  50 
 
 
364 aa  346  3e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3571  flagellar basal body P-ring protein  49.2 
 
 
368 aa  346  4e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0513  flagellar basal body P-ring protein  49.73 
 
 
371 aa  345  5e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164737  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1961  flagellar basal body P-ring protein  52.74 
 
 
368 aa  345  8e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2955  flagellar basal body P-ring protein  51.7 
 
 
395 aa  344  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.468199 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3787  flagellar basal body P-ring protein  53.5 
 
 
395 aa  340  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3964  flagellar basal body P-ring protein  49.72 
 
 
370 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0147  flagellar basal body P-ring protein  52.76 
 
 
398 aa  338  7e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2963  flagellar basal body P-ring protein  49.87 
 
 
366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.863915  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0062  flagellar basal body P-ring protein  49.86 
 
 
375 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3461  flagellar basal body P-ring protein  49.72 
 
 
372 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0220  flagellar basal body P-ring protein  48.92 
 
 
391 aa  336  5e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2914  flagellar basal body P-ring protein  50.43 
 
 
371 aa  335  7e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.193418  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3644  flagellar basal body P-ring protein  51.84 
 
 
371 aa  335  9e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.185096  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0068  flagellar basal body P-ring protein  51.43 
 
 
376 aa  333  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  50.29 
 
 
368 aa  333  4e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3066  flagellar basal body P-ring protein  50.8 
 
 
384 aa  330  3e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.405902  normal  0.219474 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2591  flagellar basal body P-ring protein  51.15 
 
 
369 aa  330  4e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0646  flagellar basal body P-ring protein  49.18 
 
 
372 aa  329  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4103  flagellar basal body P-ring protein  50.86 
 
 
368 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>