32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0097 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0097  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  100 
 
 
157 aa  313  7e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1801  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  65.61 
 
 
179 aa  205  2e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.215109  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0596  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  59.24 
 
 
154 aa  183  6e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382829  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3384  dUTP diphosphatase  57.67 
 
 
160 aa  171  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1337  dUTP diphosphatase  53.99 
 
 
160 aa  165  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1129  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  39.58 
 
 
177 aa  94.7  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297941  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0910  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  42.07 
 
 
170 aa  93.6  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0187783  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0398  deoxyUTP pyrophosphatase  38.19 
 
 
156 aa  90.5  7e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.264828  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0514  dUTP diphosphatase  38.19 
 
 
156 aa  87.8  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0328  dUTP diphosphatase  38.19 
 
 
156 aa  87.4  8e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.10049  hitchhiker  0.000547742 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1584  dUTP diphosphatase  37.5 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.182406  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0394  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  36.62 
 
 
170 aa  85.1  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000865558  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1372  deoxycytidine triphosphate deaminase, putative  38.85 
 
 
160 aa  85.1  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0239095  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0415  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  35.46 
 
 
170 aa  84  7e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.054799  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_358  deoxyuridine 5-prime-triphosphate nucleotidohydrolase, dUTP pyrophosphatase  34.75 
 
 
170 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000735952  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0085  dUTPase  37.93 
 
 
163 aa  79  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0752  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  37.32 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0123121 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11124  dUTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14580)  38.46 
 
 
131 aa  68.9  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0827  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.81 
 
 
180 aa  57.8  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119841  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60120  putative deoxycytidine deaminase  30.66 
 
 
177 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000424193  hitchhiker  0.0000000073225 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2075  deoxycytidine triphosphate deaminase  32.62 
 
 
176 aa  53.5  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0523695 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1825  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.08 
 
 
176 aa  53.1  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0453985  decreased coverage  0.0000000000000312471 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1293  deoxycytidine triphosphate deaminase  31.08 
 
 
176 aa  52.8  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3391  hypothetical protein  28.78 
 
 
184 aa  48.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0525  deoxycytidine triphosphate deaminase  29.25 
 
 
179 aa  47.8  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1391  deoxyUTP pyrophosphatase  26.88 
 
 
159 aa  47.4  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.45866  unclonable  0.000000274623 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1021  deoxycytidine triphosphate deaminase  35.8 
 
 
176 aa  45.1  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0208189 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01700  dCTP deaminase  28.57 
 
 
182 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0151  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.19 
 
 
172 aa  43.5  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00954201 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0561  deoxycytidine triphosphate deaminase  28.67 
 
 
177 aa  42.4  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2622  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  40.48 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0746  deoxycytidine triphosphate deaminase (dcD-2)  25.48 
 
 
159 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0671531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>