188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4067 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4067  ATP synthase F0, C subunit  100 
 
 
77 aa  140  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0293539  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  61.04 
 
 
77 aa  96.7  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0517  ATP synthase F0, C subunit  63.64 
 
 
77 aa  84  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.959097  normal  0.580721 
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  64.71 
 
 
76 aa  79.3  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  64.71 
 
 
76 aa  79.3  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  64.71 
 
 
76 aa  79.3  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0990  ATP synthase F0, C subunit  67.12 
 
 
76 aa  74.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.447801  normal  0.601286 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  63.64 
 
 
81 aa  70.5  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  51.52 
 
 
103 aa  68.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  50.7 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  50.7 
 
 
82 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  50.7 
 
 
82 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  50.7 
 
 
111 aa  67  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  49.23 
 
 
72 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  49.23 
 
 
72 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  49.23 
 
 
72 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  49.23 
 
 
72 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  49.23 
 
 
72 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  49.23 
 
 
72 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  47.89 
 
 
81 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  49.23 
 
 
72 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  49.23 
 
 
72 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  49.23 
 
 
72 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  47.89 
 
 
81 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  47.89 
 
 
81 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  49.23 
 
 
72 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  47.89 
 
 
81 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  49.23 
 
 
72 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4141  ATP synthase F0, C subunit  53.23 
 
 
75 aa  64.3  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0895  H+transporting two-sector ATPase C subunit  54.84 
 
 
74 aa  63.9  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3635  ATP synthase F0, C subunit  58.62 
 
 
74 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466022  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  47.22 
 
 
75 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  47.69 
 
 
70 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1067  ATP synthase F0, C subunit  43.75 
 
 
81 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  42.65 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  47.69 
 
 
70 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  47.69 
 
 
70 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6141  ATP synthase F0, C subunit  49.18 
 
 
73 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4339  ATP synthase F0, C subunit  41.89 
 
 
76 aa  58.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2121  ATP synthase F0, C subunit  46.67 
 
 
76 aa  58.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000306231  hitchhiker  0.00429019 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4475  ATP synthase F0, C subunit  41.89 
 
 
76 aa  58.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4486  ATP synthase F0, C subunit  43.06 
 
 
79 aa  58.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862141  normal  0.124516 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  48.33 
 
 
74 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19180  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  49.18 
 
 
75 aa  58.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0660  F0F1-type ATP synthase, subunit c  43.94 
 
 
70 aa  58.2  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.307082  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  44.26 
 
 
78 aa  57.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  44.78 
 
 
91 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  45.16 
 
 
75 aa  57.4  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  44.78 
 
 
91 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  44.78 
 
 
91 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  47.37 
 
 
74 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2453  ATP synthase F0, C subunit  44.26 
 
 
76 aa  56.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2332  hypothetical protein  49.09 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3360  ATP synthase F0, C subunit  44.78 
 
 
91 aa  56.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000392065  hitchhiker  0.00459127 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  42.19 
 
 
79 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  41.94 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3143  ATP synthase F0, C subunit  44.78 
 
 
91 aa  56.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00841289  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2412  ATP synthase F0, C subunit  46.55 
 
 
68 aa  56.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  44.78 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0045  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0943976 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  44.78 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  41.89 
 
 
321 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2884  ATP synthase F0, C subunit  46.15 
 
 
73 aa  55.5  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000318758  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0065  ATP synthase F0, C subunit  47.46 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.475844  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1656  F0F1 ATP synthase subunit C  41.18 
 
 
93 aa  55.1  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  45.31 
 
 
78 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0331  ATP synthase F0, C subunit  49.09 
 
 
76 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2708  ATP synthase F0, C subunit  47.46 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00577662  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2700  ATP synthase F0, C subunit  47.17 
 
 
88 aa  54.7  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  49.09 
 
 
81 aa  55.1  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  49.09 
 
 
82 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4494  ATP synthase F0, C subunit  41.67 
 
 
76 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  49.18 
 
 
70 aa  54.7  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0847  ATP synthase F0, C subunit  42.86 
 
 
88 aa  54.7  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1068  F0F1 ATP synthase subunit C  37.68 
 
 
93 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  46.15 
 
 
73 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000013986  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  46.38 
 
 
83 aa  53.5  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2777  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
86 aa  53.5  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.787943  normal  0.376194 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  40.3 
 
 
88 aa  53.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0152  ATP synthase, C subunit  48.28 
 
 
109 aa  52.8  0.000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2246  ATP synthase F0, C subunit  45.31 
 
 
78 aa  53.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.548731  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2673  F0F1 ATP synthase subunit C  35.71 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  49.09 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1604  ATP synthase F0, C subunit  48 
 
 
90 aa  53.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0016  ATP synthase F0, C subunit  40.3 
 
 
88 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229893  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  47.27 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1040  H+transporting two-sector ATPase C subunit  42.11 
 
 
72 aa  52.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0572773 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4017  H+transporting two-sector ATPase C subunit  48.21 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000406172 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0128  F0F1 ATP synthase subunit C  45.45 
 
 
82 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  47.27 
 
 
81 aa  51.6  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1051  F0F1 ATP synthase subunit C  45.45 
 
 
82 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0424  F0F1 ATP synthase subunit C  45.45 
 
 
82 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173635  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  50.91 
 
 
81 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1295  F0F1 ATP synthase subunit C  45.45 
 
 
83 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.490401  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  40.28 
 
 
76 aa  51.6  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4101  F0F1 ATP synthase subunit C  47.83 
 
 
83 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000110269  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2789  F0F1 ATP synthase subunit C  45.45 
 
 
82 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2647  F0F1 ATP synthase subunit C  45.45 
 
 
82 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0152  F0F1 ATP synthase subunit C  45.45 
 
 
82 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0463692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>