35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2988 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2988  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  100 
 
 		 329 aa  686    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2987  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  37.88 
 
 		 338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3509  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  37.38 
 
 		 326 aa  189  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0622  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  35.53 
 
 		 326 aa  179  7e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0581453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4730  Terpene synthase metal-binding domain protein  31.11 
 
 		 321 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0913781  decreased coverage  0.0000445956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1982  Terpene synthase, metal-binding  29.64 
 
 		 322 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150078  normal  0.785629 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0493  Terpene synthase, metal-binding protein  30.16 
 
 		 324 aa  142  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3949  Terpene synthase metal-binding domain protein  30.28 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.598954  normal  0.405526 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6866  hypothetical protein  28.28 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4100  Terpene synthase metal-binding domain protein  28.34 
 
 		 325 aa  116  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421743  hitchhiker  0.00192352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1797  Terpene synthase metal-binding domain protein  27.86 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2648  hypothetical protein  25.64 
 
 		 323 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4149  hypothetical protein  22.37 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2608  hypothetical protein  24.24 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242922  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2716  hypothetical protein  24.36 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1127  Terpene synthase metal-binding domain-containing protein  23.87 
 
 		 769 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0393162 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0947  lyase  28.21 
 
 		 339 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000129184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0075  putative terpene cyclase  23.01 
 
 		 745 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1841  Terpene synthase, metal-binding  24.07 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.981026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5559  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  22.87 
 
 		 750 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1257  Terpene synthase metal-binding domain protein  23.95 
 
 		 756 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4231  Terpene synthase, metal-binding  20.97 
 
 		 751 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0977  Terpene synthase metal-binding domain protein  20.85 
 
 		 751 aa  63.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3107  hypothetical protein  22.37 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000114521  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1634  terpene synthase family protein  21.81 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1721  terpene synthase family protein  21.81 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.24708  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0219  terpene synthase family protein  21.81 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.315963  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6200  Terpene synthase metal-binding domain protein  22.26 
 
 		 755 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4335  hypothetical protein  24.22 
 
 		 343 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2201  putative terpene cyclase  30.68 
 
 		 269 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000144579  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4612  terpene synthase, metal-binding  27.56 
 
 		 393 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000213288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3801  hypothetical protein  22.22 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234501  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03277  conserved hypothetical protein  23.08 
 
 		 341 aa  43.5  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0111655 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0041  putative lyase  30.34 
 
 		 286 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000993648  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1580  putative terpene cyclase  30.34 
 
 		 286 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000363115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>