More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0072 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0072  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 		 393 aa  784    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248407 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1237  signal recognition particle GTPase  73.79 
 
 		 423 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1464  signal recognition particle-docking protein FtsY  59.08 
 
 		 399 aa  350  2e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.359002 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0979  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.07 
 
 		 391 aa  348  9e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2548  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.02 
 
 		 394 aa  344  1e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.221459  normal  0.277216 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1567  signal recognition particle-docking protein FtsY  59.03 
 
 		 413 aa  344  1e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0244087 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1161  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.06 
 
 		 388 aa  338  9e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.273828  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0658  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.93 
 
 		 393 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.987967  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2125  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.56 
 
 		 413 aa  336  3.9999999999999995e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147567  normal  0.0509134 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09120  signal recognition particle-docking protein FtsY  59.87 
 
 		 393 aa  333  3e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.296605  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23810  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.97 
 
 		 405 aa  333  3e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235092  normal  0.652933 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3428  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.1 
 
 		 389 aa  328  8e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0207387  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1185  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.86 
 
 		 395 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.291994  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3270  signal recognition particle-docking protein FtsY  59.22 
 
 		 376 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1295  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.54 
 
 		 411 aa  325  8.000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.182603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4020  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.01 
 
 		 407 aa  325  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10960  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.17 
 
 		 480 aa  324  2e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0134963  normal  0.0668977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1146  signal recognition particle-docking protein FtsY  59.35 
 
 		 431 aa  321  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0800411  normal  0.0132649 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2775  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.74 
 
 		 391 aa  318  1e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.41655 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2494  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.82 
 
 		 404 aa  317  3e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2234  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.49 
 
 		 400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014808 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1392  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.93 
 
 		 391 aa  312  6.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292581  decreased coverage  0.00432039 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4186  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.54 
 
 		 469 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.475167 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0220  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.28 
 
 		 394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1935  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.86 
 
 		 458 aa  302  9e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1955  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.86 
 
 		 466 aa  301  9e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.345625  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2001  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.86 
 
 		 466 aa  301  9e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.805492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8003  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.73 
 
 		 395 aa  300  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3596  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.84 
 
 		 414 aa  295  9e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2177  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.61 
 
 		 449 aa  294  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.159993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7989  cell division membrane protein  56.45 
 
 		 394 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0488836  normal  0.407167 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12935  cell division protein ftsY  55.92 
 
 		 422 aa  287  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000035929  normal  0.45291 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09610  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.49 
 
 		 516 aa  285  9e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.640999  normal  0.596403 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3150  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.21 
 
 		 321 aa  281  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000013579  hitchhiker  0.00179323 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1607  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.19 
 
 		 479 aa  280  3e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1319  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.19 
 
 		 416 aa  262  8e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025253  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1294  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.19 
 
 		 416 aa  262  8e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000563395  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0801  cell division protein FtsY  46.86 
 
 		 408 aa  261  2e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0242269  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5945  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.88 
 
 		 490 aa  260  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2077  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.66 
 
 		 531 aa  259  8e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.0051754  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1555  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.14 
 
 		 295 aa  256  5e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.2 
 
 		 481 aa  255  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0777  Signal recognition particle GTPase-like protein  46.23 
 
 		 305 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.221787  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.12 
 
 		 405 aa  253  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3889  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.19 
 
 		 329 aa  251  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141738  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3767  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.19 
 
 		 320 aa  251  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000377729  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  43.4 
 
 		 362 aa  251  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1157  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.85 
 
 		 508 aa  251  2e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000684917  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1184  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.72 
 
 		 312 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000333894  normal  0.0338709 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1563  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.96 
 
 		 442 aa  251  2e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3670  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.19 
 
 		 329 aa  250  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000567512  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1085  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.76 
 
 		 329 aa  250  3e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131602  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  43.71 
 
 		 541 aa  250  4e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3895  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.43 
 
 		 329 aa  249  5e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3606  recognition particle-docking protein  49.81 
 
 		 329 aa  249  5e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000396319  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3946  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.81 
 
 		 329 aa  249  5e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1297  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.81 
 
 		 329 aa  249  6e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000242515  hitchhiker  2.59158e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3698  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.81 
 
 		 329 aa  249  8e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000493228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3588  recognition particle-docking protein FtsY  49.81 
 
 		 329 aa  249  8e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000596157  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3985  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.81 
 
 		 329 aa  249  8e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000399496  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.32 
 
 		 485 aa  249  8e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3861  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.81 
 
 		 329 aa  249  8e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.12258e-60 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.87 
 
 		 432 aa  248  9e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3597  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.6 
 
 		 375 aa  248  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549182  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3336  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.78 
 
 		 320 aa  246  4e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1715  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.66 
 
 		 319 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0121805  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2499  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.06 
 
 		 329 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00080713  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1399  signal recognition particle receptor (docking protein)  42.42 
 
 		 463 aa  245  8e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0283882  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1768  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.35 
 
 		 304 aa  244  9.999999999999999e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00021093  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.03 
 
 		 452 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  44.55 
 
 		 495 aa  243  5e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0962  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.64 
 
 		 311 aa  242  7.999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000455691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  44.22 
 
 		 471 aa  242  9e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0733  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.28 
 
 		 335 aa  241  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0697  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.62 
 
 		 302 aa  241  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0640674  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1176  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.98 
 
 		 351 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.216853  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1386  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.77 
 
 		 348 aa  241  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.478265  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3686  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.76 
 
 		 331 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.915822  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.97 
 
 		 453 aa  241  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3496  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.59 
 
 		 342 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000989715  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.61 
 
 		 373 aa  240  4e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0221  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.29 
 
 		 535 aa  239  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359451  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0455  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.12 
 
 		 382 aa  239  5e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000410251  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0317  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.98 
 
 		 483 aa  239  5e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1096  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.51 
 
 		 340 aa  239  8e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0138862  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.36 
 
 		 501 aa  239  8e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0730  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.07 
 
 		 317 aa  238  9e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0926  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.29 
 
 		 302 aa  239  9e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.183665  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2724  hypothetical protein  41.04 
 
 		 355 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  42.99 
 
 		 497 aa  238  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  42.99 
 
 		 498 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0251  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.99 
 
 		 497 aa  237  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002138  signal recognition particle receptor protein FtsY  43.69 
 
 		 407 aa  238  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.745787  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  42.99 
 
 		 498 aa  238  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00280  signal recognition particle GTPase  42.81 
 
 		 408 aa  238  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  42.99 
 
 		 498 aa  238  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3747  cell division protein FtsY  42.99 
 
 		 512 aa  238  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  42.99 
 
 		 498 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  42.99 
 
 		 498 aa  238  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3858  cell division protein FtsY  42.99 
 
 		 497 aa  237  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>