68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3436 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3436  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  303  6e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0488184  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0296  protein of unknown function DUF107  69.33 
 
 		 152 aa  184  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0320  protein of unknown function DUF107  70.67 
 
 		 152 aa  183  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0323  protein of unknown function DUF107  70 
 
 		 152 aa  183  9e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1621  hypothetical protein  50.34 
 
 		 147 aa  168  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0648  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity, NfeD-like  50.34 
 
 		 150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.24585  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0138  protein of unknown function DUF107  48.3 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0609  protein of unknown function DUF107  47.59 
 
 		 154 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3109  protein of unknown function DUF107  47.62 
 
 		 148 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00574825  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  43.06 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0261  hypothetical protein  47.26 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  41.1 
 
 		 145 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  40.97 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  41.43 
 
 		 143 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2365  hypothetical protein  39.01 
 
 		 157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2128  hypothetical protein  36.77 
 
 		 165 aa  107  8.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2452  hypothetical protein  38.16 
 
 		 165 aa  102  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0087  hypothetical protein  28.37 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3149  hypothetical protein  45.21 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.722841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  30.41 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  30.41 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  29.05 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  29.05 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  29.05 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  29.05 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  28.38 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  27.81 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  27.81 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  27.81 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4844  hypothetical protein  32.88 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  27.81 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  27.21 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  33.1 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  29.37 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004151  putative activity regulator of membrane protease YbbK  24.83 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  32.41 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0461  protein of unknown function DUF107  26.35 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  32.45 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  26.49 
 
 		 152 aa  51.2  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  28.28 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1445  hypothetical protein  31.07 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155103  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0505  protein of unknown function DUF107  30.28 
 
 		 147 aa  50.4  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  26.9 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0572  regulator of membrane protease activity  26.71 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1187  protein of unknown function DUF107  29.73 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  28.08 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6549  protein of unknown function DUF107  28.06 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  47.8  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0069  hypothetical protein  38.16 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.473003  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1033  protein of unknown function DUF107  27.14 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  27.86 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2149  hypothetical protein  29.66 
 
 		 488 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0074  hypothetical protein  38.16 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1152  hypothetical protein  26.03 
 
 		 153 aa  44.3  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.243195  hitchhiker  0.000000302368 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1099  hypothetical protein  27.89 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1803  nodulation efficiency protein NfeD  26.67 
 
 		 437 aa  44.3  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0281  membrane protein  27.66 
 
 		 150 aa  44.3  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  25 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3060  protein of unknown function DUF107  23.46 
 
 		 430 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4304  hypothetical protein  24.03 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0496  hypothetical protein  31.47 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41983  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3217  protein of unknown function DUF107  29.25 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0418  protein of unknown function DUF107  23.39 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3111  hypothetical protein  24.18 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0558  hypothetical protein  23.08 
 
 		 137 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2246  protein of unknown function DUF107  23.94 
 
 		 143 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0353999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0403  hypothetical protein  32.94 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1630  protein of unknown function DUF107  25.18 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.159398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>