35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2765 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2765  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  692    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0570  hypothetical protein  77.14 
 
 
353 aa  475  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2901  hypothetical protein  75 
 
 
345 aa  432  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0026  hypothetical protein  41.53 
 
 
354 aa  267  2e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.228478  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2434  hypothetical protein  42.38 
 
 
337 aa  261  8.999999999999999e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.792267  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3168  hypothetical protein  45.71 
 
 
365 aa  256  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0820  hypothetical protein  45.04 
 
 
361 aa  255  6e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2467  hypothetical protein  39.82 
 
 
349 aa  255  8e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000101698  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1442  hypothetical protein  42.24 
 
 
353 aa  253  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000253988  normal  0.0151377 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2089  hypothetical protein  43.34 
 
 
368 aa  253  5.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000895888  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3245  hypothetical protein  44.07 
 
 
363 aa  252  6e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2081  hypothetical protein  42.77 
 
 
356 aa  252  7e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0249  hypothetical protein  43.14 
 
 
367 aa  251  1e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1621  hypothetical protein  38.72 
 
 
360 aa  249  4e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0905  hypothetical protein  41.14 
 
 
364 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0830124  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0064  hypothetical protein  40.12 
 
 
362 aa  236  6e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00560  hypothetical protein  39.09 
 
 
381 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25130  hypothetical protein  35.83 
 
 
369 aa  231  1e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.917917 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0957  metal-activated pyridoxal enzyme  36.78 
 
 
352 aa  207  2e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.361179  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0403  hypothetical protein  37.75 
 
 
356 aa  206  6e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0601  hypothetical protein  36.61 
 
 
361 aa  202  5e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0186  hypothetical protein  35.82 
 
 
352 aa  192  6e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00395817  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0538  hypothetical protein  29.97 
 
 
357 aa  189  4e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2313  hypothetical protein  39.37 
 
 
366 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.840992  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1636  hypothetical protein  45.93 
 
 
171 aa  93.2  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0851  transporter component  32.89 
 
 
159 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0037  transporter component  35.62 
 
 
156 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1132  transporter component  34.93 
 
 
156 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0786  transporter component  33.56 
 
 
156 aa  63.5  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0827  transporter component  34.31 
 
 
157 aa  53.5  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0166268  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0785  cytochrome c heme-binding site  32.14 
 
 
151 aa  46.6  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1133  cytochrome c heme-binding site  30.66 
 
 
151 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0038  cytochrome c heme-binding site  30.66 
 
 
151 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2440  putative transmembrane protein  33.86 
 
 
373 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746191  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04350  YeeE/YedE family protein (DUF395)  32.74 
 
 
355 aa  42.7  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217444 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>