46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4327 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4327  LGFP repeat protein  100 
 
 		 967 aa  1929    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343026  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4368  LGFP repeat protein  51.09 
 
 		 1040 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2380  LGFP repeat protein  41.25 
 
 		 867 aa  490  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.729285  normal  0.0240945 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4329  LGFP repeat protein  48.17 
 
 		 928 aa  376  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4447  LGFP repeat protein  42.15 
 
 		 695 aa  278  3e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445822 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4038  LGFP repeat protein  33.14 
 
 		 780 aa  217  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.046638 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4933  NLP/P60 protein  43.82 
 
 		 986 aa  216  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0579  hypothetical protein  47.46 
 
 		 308 aa  213  2e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.404895 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0161  hypothetical protein  47.22 
 
 		 323 aa  198  3e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.124913  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2379  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  36.45 
 
 		 879 aa  192  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3877  LGFP repeat protein  44.76 
 
 		 654 aa  173  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.200487  normal  0.0193324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3028  LGFP repeat protein  41.54 
 
 		 396 aa  162  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  38.75 
 
 		 351 aa  161  7e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3879  SpoIID/LytB domain  48.29 
 
 		 664 aa  156  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907037 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0039  LGFP repeat protein  43.4 
 
 		 306 aa  147  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2701  LGFP repeat protein  37 
 
 		 322 aa  139  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0967  SCP-like extracellular  40.91 
 
 		 475 aa  134  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0383584 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2440  LGFP repeat-containing protein  30.64 
 
 		 686 aa  125  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199605  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3878  LGFP repeat protein  44.83 
 
 		 407 aa  125  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0449633 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3957  LGFP repeat-containing protein  30.06 
 
 		 708 aa  124  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.420458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.8 
 
 		 846 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1717  LGFP repeat-containing protein  29.89 
 
 		 595 aa  119  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.2949 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  36.28 
 
 		 892 aa  112  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1965  LGFP repeat protein  46.3 
 
 		 316 aa  112  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2167  LGFP  30.07 
 
 		 754 aa  111  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381725  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2213  LGFP repeat-containing protein  30.07 
 
 		 705 aa  111  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0467397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2156  LGFP repeat-containing protein  30.07 
 
 		 706 aa  111  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337154 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12735  hypothetical protein  28.9 
 
 		 699 aa  107  8e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.724333 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0168  putative esterase  43.75 
 
 		 546 aa  106  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4171  LGFP repeat protein  35.37 
 
 		 617 aa  100  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  43.9 
 
 		 399 aa  91.7  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  37.11 
 
 		 496 aa  86.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2298  hypothetical protein  43.97 
 
 		 300 aa  80.1  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.181107 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1190  glycosyl hydrolase family 25  25.33 
 
 		 662 aa  70.5  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1016  LGFP repeat protein  32.53 
 
 		 205 aa  65.9  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2269  LGFP repeat protein  40 
 
 		 186 aa  65.1  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2503  LGFP repeat-containing protein  33.54 
 
 		 344 aa  63.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272639  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5652  LGFP repeat-containing protein  36.97 
 
 		 539 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.786051  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2565  LGFP repeat protein  32.39 
 
 		 312 aa  56.6  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.387749  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1157  LGFP repeat-containing protein  41.38 
 
 		 541 aa  56.2  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0583206  normal  0.0991304 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5403  LGFP repeat-containing protein  36.76 
 
 		 537 aa  56.2  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.116536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5110  LGFP repeat-containing protein  36.76 
 
 		 537 aa  56.2  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.667896 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5022  LGFP  36.76 
 
 		 537 aa  56.2  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13845  hypothetical protein  35.64 
 
 		 539 aa  54.3  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.280356 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4477  LGFP repeat-containing protein  34.62 
 
 		 370 aa  52.4  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2545  hypothetical protein  34.62 
 
 		 284 aa  45.8  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.631524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>