More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2947 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2947  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
535 aa  1012  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3190  sodium/hydrogen exchanger  53.39 
 
 
498 aa  471  1e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2399  sodium/hydrogen exchanger  54.12 
 
 
530 aa  441  1e-122  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00231654 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0298  potassium/proton antiporter  52.42 
 
 
505 aa  436  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8651  potassium/proton antiporter  53.77 
 
 
501 aa  434  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3692  potassium/proton antiporter  56.2 
 
 
500 aa  427  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000164721  normal  0.675965 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3197  potassium/proton antiporter  51.02 
 
 
497 aa  414  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  3.94197e-05  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5749  potassium/proton antiporter  53.3 
 
 
492 aa  406  1e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0152205  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0746  potassium/proton antiporter  51.61 
 
 
498 aa  402  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0086  sodium/hydrogen exchanger  57.23 
 
 
505 aa  405  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0163  potassium/proton antiporter  50.29 
 
 
524 aa  405  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0160  potassium/proton antiporter  50.5 
 
 
498 aa  395  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3251  sodium/hydrogen exchanger  57.55 
 
 
503 aa  379  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  33.19 
 
 
478 aa  278  3e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  38.51 
 
 
597 aa  276  8e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  40.53 
 
 
509 aa  275  2e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  37.76 
 
 
487 aa  273  5e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03170  cell volume regulation protein CvrA  37.26 
 
 
485 aa  272  1e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  40.17 
 
 
486 aa  271  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  40.6 
 
 
483 aa  270  6e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  36.78 
 
 
497 aa  269  1e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  40.04 
 
 
597 aa  269  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  39.55 
 
 
596 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1841  Na(+)/H(+) exchanger  34.59 
 
 
485 aa  268  3e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42634  hitchhiker  0.00748386 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  36.58 
 
 
581 aa  265  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  38.28 
 
 
581 aa  265  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0572  sodium/hydrogen exchanger  37.35 
 
 
575 aa  264  4e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  38.35 
 
 
576 aa  262  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  30.44 
 
 
498 aa  260  4e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  39.67 
 
 
597 aa  259  6e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  34.17 
 
 
481 aa  259  7e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  39.63 
 
 
597 aa  258  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_002950  PG0381  potassium/proton antiporter  35.96 
 
 
506 aa  254  2e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5829  sodium/hydrogen exchanger  38.38 
 
 
593 aa  254  2e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.626917  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0729  potassium/proton antiporter  36.38 
 
 
572 aa  254  2e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  39.5 
 
 
597 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  38.48 
 
 
598 aa  254  4e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  36.54 
 
 
574 aa  254  4e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  35.76 
 
 
445 aa  251  3e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0112  sodium/hydrogen exchanger  31.1 
 
 
527 aa  250  4e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3071  potassium/proton antiporter  36.29 
 
 
574 aa  250  6e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.57549  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0222  potassium/proton antiporter  40 
 
 
499 aa  250  6e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  30.75 
 
 
477 aa  249  7e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0550  sodium/hydrogen exchanger  38.74 
 
 
541 aa  249  8e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0919  sodium/hydrogen exchanger  43.6 
 
 
490 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0469679  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0915  sodium/hydrogen exchanger  43.6 
 
 
490 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101671  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1171  sodium/hydrogen exchanger  40.6 
 
 
490 aa  248  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.246697 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3747  potassium/proton antiporter  35.59 
 
 
574 aa  247  4e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1831  sodium/hydrogen exchanger  39.11 
 
 
598 aa  247  4e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205605 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0400  potassium/proton antiporter  37.66 
 
 
580 aa  246  5e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.763312 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3821  potassium/proton antiporter  37.87 
 
 
574 aa  246  7e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.59426e-06  hitchhiker  0.000169781 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1203  potassium/proton antiporter  39.82 
 
 
486 aa  246  8e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.195277  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  44.05 
 
 
414 aa  246  9e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  36.79 
 
 
580 aa  246  1e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1549  potassium/proton antiporter  37.42 
 
 
575 aa  246  1e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1658  potassium/proton antiporter  37.42 
 
 
575 aa  246  1e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  37.42 
 
 
598 aa  245  1e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5116  potassium/proton antiporter  37.23 
 
 
580 aa  244  2e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5066  potassium/proton antiporter  37.37 
 
 
580 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4939  potassium/proton antiporter  37.37 
 
 
580 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  35.67 
 
 
626 aa  243  8e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4559  potassium/proton antiporter  38.83 
 
 
592 aa  242  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875877  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0944  potassium/proton antiporter  35.32 
 
 
576 aa  240  4e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2361  potassium/proton antiporter  35.28 
 
 
577 aa  240  4e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.325914  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0847  potassium/proton antiporter  35.64 
 
 
574 aa  240  4e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  1.12338e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3088  potassium/proton antiporter  36.63 
 
 
574 aa  240  5e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0092711  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0884  potassium/proton antiporter  36.63 
 
 
574 aa  240  5e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00781318  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  39.39 
 
 
491 aa  240  6e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0935  potassium/proton antiporter  35.12 
 
 
576 aa  239  9e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108607  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0910  potassium/proton antiporter  35.12 
 
 
576 aa  239  9e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.490198  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3425  potassium/proton antiporter  35.12 
 
 
576 aa  239  9e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0240027  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0870  Sodium/hydrogen exchanger  43.6 
 
 
490 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0500  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.78 
 
 
578 aa  238  3e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.76767 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0611  sodium/hydrogen exchanger  32.16 
 
 
531 aa  237  5e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00744487  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5758  potassium/proton antiporter  37.34 
 
 
580 aa  236  6e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1349  potassium/proton antiporter  35.01 
 
 
578 aa  236  6e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.401684  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1336  potassium/proton antiporter  35.01 
 
 
578 aa  236  6e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000106159  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1678  potassium/proton antiporter  35.01 
 
 
578 aa  236  6e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.13521e-05  normal  0.874424 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  39.18 
 
 
572 aa  236  6e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1957  potassium/proton antiporter  35.01 
 
 
578 aa  236  6e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0260417  normal  0.308586 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45090  potassium/proton antiporter  37.28 
 
 
582 aa  236  7e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00181989  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01166  potassium/proton antiporter  34.82 
 
 
578 aa  235  1e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106351  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1294  potassium/proton antiporter  34.82 
 
 
578 aa  235  1e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000808232  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2434  potassium/proton antiporter  34.82 
 
 
578 aa  235  1e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.010009  normal  0.436306 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0446  potassium/proton antiporter  36.91 
 
 
580 aa  236  1e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0536009  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1930  potassium/proton antiporter  38.04 
 
 
569 aa  236  1e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.401785  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2457  sodium/hydrogen exchanger  34.82 
 
 
578 aa  235  1e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  3.99384e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01176  hypothetical protein  34.82 
 
 
578 aa  235  1e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0803034  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0122  sodium/hydrogen exchanger  38.99 
 
 
570 aa  235  2e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1999  potassium/proton antiporter  36.3 
 
 
577 aa  233  7e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.861236  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1867  potassium/proton antiporter  35.79 
 
 
573 aa  233  7e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  37.45 
 
 
588 aa  232  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  37.02 
 
 
608 aa  232  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1943  potassium/proton antiporter  36.08 
 
 
577 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00285963  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1517  potassium/proton antiporter  36.08 
 
 
577 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.044428  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1332  potassium/proton antiporter  36.08 
 
 
577 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  6.12144e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1939  potassium/proton antiporter  36.08 
 
 
577 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.058645  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  38.14 
 
 
573 aa  229  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  34.5 
 
 
597 aa  228  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  38.99 
 
 
580 aa  227  5e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>